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计算机辅助设计新型EGFR和PD-1双靶向抗体的设计及初步鉴定

缩略词表第6-8页
中文摘要第8-10页
Abstract第10-11页
前言第12-16页
第一部分 分子动力学模拟分析双特异抗体结构稳定性第16-23页
    材料与方法第16-19页
        1. 实验材料第16页
        2. 方法第16-19页
            2.1 抗体结构预处理第16页
            2.2 抗体结构能量最小化第16-17页
            2.3 抗体CH3结构体系的升温第17页
            2.4 抗体CH3结构体系的平衡第17页
            2.5 抗体CH3结构体系的长时间尺度动力学模拟第17-19页
    结果第19-22页
        1. 抗体CH3 wt和KIH在355K下结构稳定性分析第19-20页
        2. 抗体CH3 wt和KIH在355K下氨基酸波动性分析第20-22页
    讨论第22-23页
第二部分 靶向EGFR和PD1分子的双特异抗体的设计和构建第23-47页
    材料与方法第23-33页
        1. 实验材料第23-24页
            1.1 菌株与细胞株第23页
            1.2 载体与质粒第23页
            1.3 常用分子生物学试剂盒第23页
            1.4 DNA标准分子Marker第23页
            1.5 其他分子生物学试剂和化学试剂第23页
            1.6 主要实验仪器第23-24页
        2. 方法第24-33页
            2.1 EGFR和PD1分子的双特异抗体的结构的设计第24页
            2.2 EGFR和PD1分子的双特异抗体的重链、轻链的构建策略第24-27页
                2.2.1 EGFR分子抗体(Cetuximab,C225)的重链和knob结构的构建方法第24-25页
                2.2.2 EGFR分子抗体(Cetuximab,C225)的轻链的构建第25-26页
                2.2.3 PD1分子抗体(Nivolumab,5C4)的重链和hole的构建方法第26-27页
                2.2.4 PD1分子抗体(Nivolumab,5C4)轻链的构建方法第27页
            2.3 分子克隆构建中用到的Overlap PCR体系设计及引物设计序列第27-28页
            2.4 酶切体系及步骤第28-29页
            2.5 酶切/PCR产物琼脂糖凝胶DNA回收第29-30页
            2.6 酶切产物和PCR回收产物与载体的连接第30页
                2.6.1 与克隆载体连接第30页
                2.6.2 与表达载体连接第30页
            2.7 转化第30-31页
                2.7.1 感受态细胞的制备第30-31页
                2.7.2 LB液与LB板的制备第31页
                2.7.3 转化步骤第31页
            2.8 质粒重组与筛选第31-32页
            2.9 测序鉴定序列第32-33页
    结果第33-46页
        1. 双特异性抗体Cetu-PD1 CrossMab的构建第33-46页
            1.1 EGFR分子抗体(Cetuximab,C225)的重链和knob结构的构建第33-36页
            1.2 EGFR分子抗体(Cetuximab,C225)的轻链的构建第36-38页
            1.3 PD1分子抗体(Nivolumab,5C4)的重链和hole的构建第38-43页
            1.4 PD1分子抗体(Nivolumab,5C4)轻链的构建第43-46页
    讨论第46-47页
第三部分 靶向EGFR和PD1分子的双特异抗体的转染与表达第47-53页
    材料与方法第47-51页
        1. 实验材料第47页
            1.1 菌株与细胞株第47页
            1.2 常用分子生物学试剂盒第47页
            1.3 蛋白标准分子Marker第47页
            1.4 其他分子生物学试剂和化学试剂第47页
            1.5 抗体第47页
            1.6 主要实验仪器第47页
        2. 方法第47-51页
            2.1 抗体转染第47-48页
                2.1.1 10μM线性聚乙烯亚胺PEI的配置第47-48页
                2.1.2 细胞准备第48页
                2.1.3 双特异抗体重轻链共转染到Freestyle TM 293F细胞第48页
            2.2 分析抗体分子量大小及完整性第48-51页
                2.2.1 SDS-PAGE的配置和考马斯亮蓝染色第48-49页
                2.2.2 抗体的纯化第49页
                2.2.3 抗体的表达点膜初步鉴定第49-51页
    结果第51-52页
        1. Cetu-PD1 CrossMab双特异性抗体的表达及分子鉴定第51-52页
            1.1 Cetu-PD1 CrossMab双特异性抗体的表达第51页
            1.2 Cetu-PD1 CrossMab双特异性抗体表达的初步鉴定:点膜实验第51页
            1.3 通过SDS-PAGE考马斯亮蓝染色来鉴定表达抗体的分子大小及结构完整性第51-52页
    讨论第52-53页
结论第53-55页
参考文献第55-59页
文献综述 免疫检测点治疗在肺癌中的研究进展第59-69页
    参考文献第65-69页
在读期间发表论文情况第69-70页
致谢第70页

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