| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1. 绪论 | 第9-12页 |
| 1.1. 分子力场中的电荷 | 第9页 |
| 1.2. 量子力学中的电荷 | 第9-10页 |
| 1.3. 研究的目的和意义 | 第10-11页 |
| 1.4. 本文的结构 | 第11-12页 |
| 2. 理论综述 | 第12-19页 |
| 2.1. 分子力场和分子动力学模拟 | 第12-15页 |
| 2.1.1. 分子力场 | 第12-14页 |
| 2.1.2. 分子动力学模拟 | 第14-15页 |
| 2.2. 量子力学中电荷计算方法 | 第15-19页 |
| 2.2.1. 量子化学的简介 | 第15-16页 |
| 2.2.2. 电荷计算方法 | 第16-19页 |
| 3. Partition-Iterate Quantum方法的研究 | 第19-28页 |
| 3.1. Partition-Iterate Quantum方法的研究体系 | 第19-21页 |
| 3.2. Partition-Iterate Quantum方法的步骤 | 第21-22页 |
| 3.3. Partition-Iterate Quantum方法的具体实施 | 第22-27页 |
| 3.3.1. 蛋白质与核酸的二元体系中的研究过程 | 第22-25页 |
| 3.3.2. 三个水分子的三元体系中的研究过程 | 第25-27页 |
| 3.4. 本章小节 | 第27-28页 |
| 4. 不同体系采用Partition-Iterate Quantum方法的研究过程与数据分析 | 第28-87页 |
| 4.1. 水-水体系的研究过程与数据分析 | 第28-31页 |
| 4.2. 蛋白质-蛋白质体系的研究过程与数据分析 | 第31-37页 |
| 4.3. 蛋白质-水体系的研究过程与数据分析 | 第37-42页 |
| 4.4. 蛋白质-核酸体系的研究过程与数据分析 | 第42-54页 |
| 4.5. 蛋白质-离子体系的研究过程与数据分析 | 第54-63页 |
| 4.6. 核酸-水体系的研究过程与数据分析 | 第63-68页 |
| 4.7. 核酸-核酸体系的研究过程与数据分析 | 第68-73页 |
| 4.8. 核酸-离子体系的研究过程与数据分析 | 第73-85页 |
| 4.9. 本章小节 | 第85-87页 |
| 5. 结论 | 第87-88页 |
| 5.1. 本论文工作 | 第87页 |
| 5.2. 创新点 | 第87页 |
| 5.3. 待改进的工作 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-92页 |
| 附录A 蛋白质-核酸体系的研究过程与数据分析 | 第92-105页 |
| 附录B 蛋白质-离子体系的研究过程与数据分析 | 第105-109页 |
| 附录C 核酸-离子体系的研究过程与数据分析 | 第109-121页 |
| 附录D Partition-Iterate Quantum方法的计算程序 | 第121-123页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124页 |
