| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-23页 |
| 1.1 转座子概述 | 第13-14页 |
| 1.2 逆转座子概述 | 第14-15页 |
| 1.3 LTR逆转座子结构特征 | 第15-16页 |
| 1.4 逆转座子对植物基因与基因组进化的影响 | 第16-18页 |
| 1.4.1 逆转座子影响基因组大小 | 第16页 |
| 1.4.2 逆转座子促进基因突变和基因重排 | 第16-17页 |
| 1.4.3 逆转座子促进基因组的进化 | 第17-18页 |
| 1.5 棉花基因组中逆转座子的研究概述 | 第18-23页 |
| 1.5.1 棉花简介 | 第18-19页 |
| 1.5.2 棉花逆转座子的研究概述 | 第19-23页 |
| 第二章 引言 | 第23-25页 |
| 2.1 立论依据及研究目的 | 第23-24页 |
| 2.2 技术路线 | 第24-25页 |
| 第三章 材料与方法 | 第25-37页 |
| 3.1 材料 | 第25-30页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第25页 |
| 3.1.2 宿主菌株与载体质粒 | 第25页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第25页 |
| 3.1.4 主要化学试剂 | 第25-26页 |
| 3.1.5 主要溶液及配方 | 第26页 |
| 3.1.6 主要培养基及配方 | 第26-27页 |
| 3.1.7 试验所用引物 | 第27-30页 |
| 3.2 方法 | 第30-37页 |
| 3.2.1 大肠杆菌感受态细胞转化 | 第30页 |
| 3.2.2 农杆菌感受态细胞制备及转化 | 第30-31页 |
| 3.2.3 质粒提取 | 第31页 |
| 3.2.4 DNA片段回收 | 第31页 |
| 3.2.5 pTRV2-GhA2-6 表达载体的构建 | 第31-32页 |
| 3.2.6 GhDOCL逆转座子的序列分析 | 第32页 |
| 3.2.7 鉴定不同棉种中DOCL及REL相关的逆转座子 | 第32页 |
| 3.2.8 LTR逆转座子系统进化分析和分类 | 第32-33页 |
| 3.2.9 LTR逆转座子在染色体的分布以及插入位置分析 | 第33页 |
| 3.2.10 DNA提取以及PCR扩增验证 | 第33页 |
| 3.2.11 RNA提取及RT-PCR分析 | 第33-35页 |
| 3.2.12 病毒诱导基因沉默（VIGS）技术 | 第35-36页 |
| 3.2.13 黄萎病侵染实验 | 第36-37页 |
| 第四章 结果与分析 | 第37-53页 |
| 4.1 DOCL逆转座子家族 | 第37-47页 |
| 4.1.1 GhDOCL逆转座子的分子特征 | 第37-38页 |
| 4.1.2 不同棉种中DOCL逆转座子拷贝数比较 | 第38-39页 |
| 4.1.3 DOCL逆转座子的鉴定、分类和进化分析 | 第39-41页 |
| 4.1.4 DOCL逆转座子在棉花基因组中的分布 | 第41-44页 |
| 4.1.5 DOCL逆转座子和蛋白编码基因的关系 | 第44-46页 |
| 4.1.6 GhA2-6 基因功能的初步鉴定 | 第46-47页 |
| 4.2 REL逆转座子家族 | 第47-53页 |
| 4.2.1 REL逆转座子的鉴定、分类和进化分析 | 第47-48页 |
| 4.2.2 REL逆转座子在棉花基因组中的分布 | 第48-50页 |
| 4.2.3 REL逆转座子和蛋白编码基因的关系 | 第50-53页 |
| 第五章 讨论 | 第53-57页 |
| 5.1 LTR逆转座子的鉴定 | 第53页 |
| 5.2 LTR逆转座子可能是棉种进化的主要动力 | 第53-54页 |
| 5.3 LTR逆转座子对目标基因的影响 | 第54页 |
| 5.4 LTR逆转座子可能参与棉花纤维的进化 | 第54-55页 |
| 5.5 GhA2-6 基因可能是黄萎病抗性基因 | 第55-57页 |
| 第六章 结论 | 第57-59页 |
| 6.1 主要结论 | 第57页 |
| 6.2 创新点 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 附录 | 第65-85页 |
| 附录1 缩略词表 | 第65-66页 |
| 附录2 亚洲棉基因组中鉴定的GhDOCL相关的LTR逆转座子 | 第66页 |
| 附录3 雷蒙德氏棉基因组中鉴定的GhDOCL相关的LTR逆转座子 | 第66-68页 |
| 附录4 陆地棉基因组中鉴定的GhDOCL相关的LTR逆转座子 | 第68-72页 |
| 附录5 海岛棉基因组中鉴定的GhDOCL相关的LTR逆转座子 | 第72-75页 |
| 附录6 陆地棉基因组中鉴定的GbRE1相关的LTR逆转座子 | 第75-78页 |
| 附录7 海岛棉基因组中鉴定的GbRE1相关的LTR逆转座子 | 第78-80页 |
| 附录8 DOCL逆转座子系统进化分析图 | 第80-83页 |
| 附录9 REL逆转座子系统进化分析图 | 第83-84页 |
| 附录10 攻读硕士学位期间发表论文及摘要情况 | 第84-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
