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响应群体感应和体内信号的细菌调控系统的设计及应用

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 文献综述第14-32页
    1.1 鱼类疫苗第14-18页
        1.1.1 鱼类疫苗的种类第14-16页
        1.1.2 鱼类疫苗的接种方式第16-17页
        1.1.3 细菌载体疫苗的优点与隐患第17-18页
    1.2 细菌的群体感应系统第18-23页
        1.2.1 以费氏弧菌luxI-luxR为代表的革兰氏阴性菌的群体感应系统第18-20页
        1.2.2 luxI-luxR型群体感应的特异性第20页
        1.2.3 以金黄色葡萄球菌为代表的革兰氏阳性菌的群体感应系统第20-23页
        1.2.4 其他类型的群体感应系统第23页
    1.3 群体感应系统的抑制——群体淬灭系统第23-25页
        1.3.1 原核生物的群体淬灭机制第24页
        1.3.2 典型的AHL-内酯酶AiiA的群体淬灭机理第24-25页
        1.3.3 真核生物对群体感应的抑制第25页
    1.4 群体感应系统在生物工程中的应用第25-27页
        1.4.1 群体感应的合成生物学回路第25-26页
        1.4.2 群体感应回路作为生物传感器第26-27页
        1.4.3 防止生物淤积第27页
    1.5 细菌的摄铁系统第27-29页
        1.5.1 微生物体内金属离子平衡的建立第27-28页
        1.5.2 铁摄取调控子的基本特性第28页
        1.5.3 铁摄取调控子的DNA结合位点第28-29页
        1.5.4 Fur蛋白与致病和群体感应系统的关系第29页
    1.6 本论文的主要内容和意义第29-32页
第2章 细菌密度依赖的一元调控表达系统的构建与功能第32-48页
    2.1 引言第32页
    2.2 实验材料第32-34页
        2.2.1 药品与试剂第32页
        2.2.2 仪器及技术服务第32页
        2.2.3 菌株、质粒以及引物第32-34页
        2.2.4 培养基和其他溶液配方第34页
    2.3 实验方法第34-38页
        2.3.1 细菌密度依赖的一元调控表达系统的构建第34-36页
        2.3.2 一元调控表达系统随时间的表达水平检测第36-37页
        2.3.3 一元调控表达系统随细菌密度变化的表达特性检测第37页
        2.3.4 一元调控表达系统的广宿主特性检测第37-38页
    2.4 实验结果第38-46页
        2.4.1 细菌密度依赖的一元调控表达系统的构建第38-41页
        2.4.2 一元调控表达系统随时间的表达第41-44页
        2.4.3 一元系统的密度依赖表达特性第44-45页
        2.4.4 细菌密度依赖表达系统QS4的广宿主适应性第45-46页
    2.5 实验讨论及小结第46-48页
第3章 “阿拉伯糖—细菌密度”二元调控表达系统的构建与功能分析第48-73页
    3.1 引言第48-49页
    3.2 实验材料第49-51页
        3.2.1 药品与试剂第49页
        3.2.2 仪器及技术服务第49页
        3.2.3 菌株、质粒和引物第49页
        3.2.4 培养基以及其他溶液配方第49-51页
        3.2.5 大菱鲆免疫保护力实验场地与材料第51页
    3.3 实验方法第51-57页
        3.3.1 二元调控表达系统的构建第51页
        3.3.2 二元系统在有/无阿拉伯糖环境下表达水平检测第51-52页
        3.3.3 二元系统随细菌密度变化的表达特性检测第52页
        3.3.4 二元系统的宿主适应性分析第52页
        3.3.5 J774巨噬细胞的细菌侵染实验第52-53页
        3.3.6 斑马鱼幼鱼的细菌侵染第53页
        3.3.7 斑马鱼成鱼的腹腔注射与内脏组织蛋白提取第53-54页
        3.3.8 SDS-PAGE蛋白电泳第54页
        3.3.9 Western blot实验第54-55页
        3.3.10 基于二元调控表达系统的WED多价载体疫苗株的构建第55页
        3.3.11 大菱鲆的饲养第55-56页
        3.3.12 大菱鲆的注射免疫第56页
        3.3.13 大菱鲆的免疫后取样第56页
        3.3.14 大菱鲆的攻毒与相对免疫保护力评价第56-57页
    3.4 实验结果第57-70页
        3.4.1 “阿拉伯糖—细菌密度”二元系统araQS的构建第57-58页
        3.4.2 “阿拉伯糖—细菌密度”二元系统响应阿拉伯糖信号的表达第58-61页
        3.4.3 “阿拉伯糖—细菌密度”二元系统响应细菌密度信号的表达第61-62页
        3.4.4 “阿拉伯糖—细菌密度”二元系统在多种细菌宿主中的表达第62-63页
        3.4.5 “阿拉伯糖—细菌密度”二元系统在J774巨噬细胞中的表达第63-65页
        3.4.6 “阿拉伯糖一细菌密度”二元系统在斑马鱼幼鱼中的表达第65-66页
        3.4.7 “阿拉伯糖—细菌密度”二元系统在斑马鱼成鱼中的表达第66-67页
        3.4.8 基于araQS系统的WED多价载体减毒疫苗株的构建与诱导表达第67-68页
        3.4.9 疫苗株WED(araQS-G)在大菱鲆中的免疫评价第68-70页
    3.5 本章讨论及小结第70-73页
第4章 “铁—细菌密度”二元调控表达系统的构建与功能分析第73-91页
    4.1 引言第73页
    4.2 实验材料第73-74页
    4.3 实验方法第74-76页
        4.3.1 含有Fur box的启动子的筛选第74-75页
        4.3.2 Fur box筛选质粒的构建第75页
        4.3.3 限铁诱导表达系统体外限铁信号诱导的表达量检测第75-76页
        4.3.4 “铁—细菌密度”二元调控表达系统的密度依赖表达特性检测第76页
        4.3.5 “铁—细菌密度”二元调控表达系统的广宿主特性分析第76页
        4.3.6 “铁—细菌密度”二元调控表达系统的体内表达分析与疫苗效果评价第76页
    4.4 实验结果第76-89页
        4.4.1 Fur box的筛选第76-78页
        4.4.2 “铁一细菌密度”二元调控表达系统的构建与筛选第78-81页
        4.4.3 “铁一细菌密度”二元调控表达系统响应群体密度的表达第81-82页
        4.4.4 “铁—细菌密度”二元调控表达系统在不同细菌宿主中的表达第82-83页
        4.4.5 “铁—细菌密度”二元调控表达系统在J774巨噬细胞中的表达第83页
        4.4.6 “铁—细菌密度”二元调控表达系统在斑马鱼幼鱼中的表达第83-84页
        4.4.7 “铁—细菌密度”二元调控表达系统在斑马鱼成鱼中的表达第84-86页
        4.4.8 基于ironQS系统的WED多价载体减毒疫苗株的构建与诱导表达第86-87页
        4.4.9 疫苗株WED(ironQS-G)在大菱鲆中的免疫保护力第87-89页
    4.5 本章讨论及小结第89-91页
第5章 群体感应调控的细菌裂解系统的设计第91-99页
    5.1 引言第91页
    5.2 实验材料第91-92页
    5.3 实验方法第92页
    5.4 实验结果第92-97页
        5.4.1 群体感应调控的细菌裂解系统构建第92-93页
        5.4.2 群体感应调控的细菌裂解系统的裂解效果第93-95页
        5.4.3 加入IPTG开关的群体感应裂解系统的构建第95页
        5.4.4 加入IPTG开关的群体感应裂解系统的裂解效果第95-97页
    5.5 本章讨论及小结第97-99页
第6章 体内限铁信号调控的细菌裂解系统的设计第99-109页
    6.1 引言第99页
    6.2 实验材料第99-100页
    6.3 实验方法第100-102页
        6.3.1 质粒的构建第100页
        6.3.2 限铁培养基中的GFP表达检测第100-101页
        6.3.3 斑马鱼幼鱼中GFP的表达检测第101-102页
        6.3.4 限铁诱导裂解系统的体外检测第102页
        6.3.5 限铁诱导裂解系统的斑马鱼体内检测第102页
        6.3.6 含有裂解系统的鳗弧菌疫苗的生物安全性评价第102页
    6.4 实验结果第102-107页
        6.4.1 限铁调控启动子在鳗弧菌中的筛选第102-103页
        6.4.2 P_(viuA)启动子在斑马鱼体内的表达检测第103-104页
        6.4.3 P_(viuA)启动子调控的裂解系统的构建和筛选第104页
        6.4.4 限铁诱导裂解系统pUTatL2的体内检测第104-105页
        6.4.5 限铁诱导裂解系统在细菌减毒疫苗中的应用第105-107页
    6.5 本章讨论及小结第107-109页
第7章 总结与展望第109-113页
    7.1 主要结论第109-110页
    7.2 课题创新点第110-111页
    7.3 课题展望第111-113页
参考文献第113-120页
攻读博士学位期间撰写的论文第120-121页
致谢第121-122页
附件第122页

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