| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-28页 |
| 1.1 不定根发生的过程 | 第13-15页 |
| 1.1.1 诱导期 | 第13-14页 |
| 1.1.2 启动期 | 第14页 |
| 1.1.3 表达期 | 第14-15页 |
| 1.2 不定根发生的分子基础 | 第15-20页 |
| 1.2.1 不定根诱导相关基因 | 第16页 |
| 1.2.2 不定根启动相关基因 | 第16-19页 |
| 1.2.3 不定根表达相关基因 | 第19-20页 |
| 1.3 不定根发生的调控机制 | 第20-27页 |
| 1.3.1 植物激素 | 第20-24页 |
| 1.3.2 其它内源因子 | 第24-25页 |
| 1.3.3 环境因子 | 第25-27页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第27-28页 |
| 第二章 辣椒下胚轴不定根发生的转录组测序分析 | 第28-51页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-32页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第29-30页 |
| 2.1.2 不定根发生进程观察 | 第30页 |
| 2.1.3 RNA提取与Illumina测序 | 第30页 |
| 2.1.4 数据过滤与序列比对 | 第30页 |
| 2.1.5 差异表达基因的筛选 | 第30页 |
| 2.1.6 差异表达基因的功能显著性富集分析 | 第30-31页 |
| 2.1.7 Real-time PCR验证 | 第31-32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-48页 |
| 2.2.1 不定根发生进程观察 | 第32-33页 |
| 2.2.2 序列质量的整体评估 | 第33-34页 |
| 2.2.3 差异表达基因鉴定 | 第34-36页 |
| 2.2.4 差异表达基因的GO功能分析 | 第36-37页 |
| 2.2.5 差异表达基因的KEGG分析 | 第37-38页 |
| 2.2.6 淀粉与蔗糖代谢基因参与不定根发生 | 第38-40页 |
| 2.2.7 光合作用、糖酵解和三羧酸循环基因参与不定根发生 | 第40-42页 |
| 2.2.8 植物激素相关基因参与不定根发生 | 第42-44页 |
| 2.2.9 转录因子参与不定根发生 | 第44-48页 |
| 2.2.10 差异表达基因的Real-time PCR验证 | 第48页 |
| 2.3 讨论 | 第48-51页 |
| 第三章 辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析 | 第51-66页 |
| 3.1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 3.1.1 基因挖掘 | 第52页 |
| 3.1.2 序列分析 | 第52页 |
| 3.1.3 材料培养与处理 | 第52-53页 |
| 3.1.4 RNA提取和Real-time PCR分析 | 第53-54页 |
| 3.1.5 数据分析 | 第54页 |
| 3.2 结果与分析 | 第54-64页 |
| 3.2.1 辣椒GRAS家族成员鉴定 | 第54-56页 |
| 3.2.2 辣椒GRAS基因的染色体定位 | 第56-57页 |
| 3.2.3 辣椒GRAS家族系统进化分析 | 第57-58页 |
| 3.2.4 辣椒GRAS家族的组织表达模式 | 第58-59页 |
| 3.2.5 辣椒GRAS家族在干旱胁迫下的表达分析 | 第59-61页 |
| 3.2.6 辣椒GRAS家族在盐胁迫下的表达分析 | 第61-63页 |
| 3.2.7 辣椒GRAS家族在不定根发生过程中的表达分析 | 第63-64页 |
| 3.3 讨论 | 第64-66页 |
| 第四章 外源IBA对辣椒下胚轴不定根发生的影响 | 第66-77页 |
| 4.1 材料与方法 | 第67-68页 |
| 4.1.1 材料培养与处理 | 第67页 |
| 4.1.2 不定根发生进程观察 | 第67页 |
| 4.1.3 糖类物质含量及细胞壁转化酶活性测定 | 第67页 |
| 4.1.4 RNA提取和Real-time PCR分析 | 第67-68页 |
| 4.1.5 数据统计分析 | 第68页 |
| 4.2 结果与分析 | 第68-75页 |
| 4.2.1 外源IBA对辣椒下胚轴不定根发生的影响 | 第68-69页 |
| 4.2.2 外源IBA对辣椒下胚轴不定根发生的诱导作用 | 第69-71页 |
| 4.2.3 外源IBA对辣椒下胚轴不定根发生过程中糖代谢的调节作用 | 第71-75页 |
| 4.3 讨论 | 第75-77页 |
| 第五章 全文结论 | 第77-78页 |
| 5.1 结论 | 第77页 |
| 5.2 问题与展望 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-96页 |
| 附录 | 第96-123页 |
| 致谢 | 第123-124页 |
| 作者简历 | 第124页 |
