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MBF1对酵母Cu2+胁迫应答基因表达的调控作用

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第一章 前言第13-21页
   ·非生物胁迫第13-16页
     ·重金属胁迫的研究进展第13-14页
     ·Cu~(2+)胁迫的机制和相关研究进展第14-16页
   ·MBF1 参与胁迫应答调控第16-18页
   ·转录组第18-20页
     ·转录组测序第18-19页
     ·转录组测序的应用第19-20页
       ·基因差异性表达研究第19页
       ·选择性剪接的表征与检测第19-20页
       ·融合基因的检测第20页
   ·研究目的和意义第20-21页
第二章 材料与方法第21-29页
   ·材料第21页
     ·菌株第21页
     ·载体第21页
     ·数据库和生物软件第21页
   ·方法第21-29页
     ·转录组测序第21-25页
       ·RNA的提取与检测第21-22页
       ·测序文库构建及测序第22-23页
       ·原始数据处理第23页
       ·与参考序列比对第23页
       ·测序质量评估第23页
       ·基因表达量计算第23-24页
       ·差异表达基因筛选第24页
       ·Gene Ontology之功能显著性富集分析第24-25页
       ·Gene Ontology之功能分类分析第25页
       ·Pathway显著性富集分析第25页
     ·差异表达基因的验证第25-27页
       ·酵母RNA的提取第25页
       ·RT-PCR获取c DNA第25页
       ·Real-Time PCR验证差异基因表达量第25-27页
     ·BMH1 和MBF1 在酵母中的诱导表达第27-29页
       ·酵母Y258 基因组的提取第27页
       ·重组质粒p EGH-rad24m的构建第27页
       ·BMH1 诱导表达及免疫印迹检测第27-28页
       ·p EGH-mbf1 重组质粒的构建第28页
       ·MBF1 诱导表达及免疫印迹检测第28-29页
第三章 结果第29-49页
   ·RNA提取的质量检测结果第29页
   ·转录组测序质量检测结果第29-32页
     ·原始数据处理统计结果第29-30页
     ·数据比对统计结果第30-31页
     ·饱和度分析结果第31-32页
     ·随机性分析结果第32页
   ·受MBF1 调控的基因第32-33页
   ·受MBF1 调控的基因的Gene Ontology分析结果第33-35页
   ·受MBF1 调控的基因的KEGG Pathway分析结果第35-36页
   ·受Cu~(2+)胁迫影响的基因第36-37页
   ·受Cu~(2+)胁迫影响的基因Gene Ontology分析结果第37-39页
   ·受Cu~(2+)胁迫影响的基因的KEGG Pathway分析结果第39-40页
   ·受MBF1 调控的Cu~(2+)胁迫基因第40-41页
   ·对差异基因的Real-Time PCR验证结果第41-47页
   ·pEGH-rad24m和pEGH-mbf1 重组质粒的鉴定结果第47-48页
   ·BMH1 和MBF1 的诱导表达鉴定结果第48-49页
第四章 讨论第49-58页
   ·受MBF1 调控的基因第49-51页
     ·MBF1 广泛参与了各种生命过程第49页
     ·氧化磷酸化是受MBF1 调控的主要通路第49-51页
   ·受Cu~(2+)胁迫影响的基因第51-54页
     ·Cu~(2+)胁迫下酵母细胞产生了应激反应第51-52页
     ·过氧化物酶体是受Cu~(2+)胁迫影响的主要通路第52-54页
   ·受MBF1 调控的Cu~(2+)胁迫应答基因第54-58页
     ·氧化磷酸化通路既受MBF1 调控又受Cu~(2+)胁迫影响第54-55页
     ·基因转录既受MBF1 调控又受Cu~(2+)胁迫影响第55-56页
     ·MFS转运蛋白的合成既受MBF1 调控又Cu~(2+)胁迫影响第56-58页
第五章 结论第58-59页
   ·氧化磷酸化是受MBF1 调控的主要通路第58页
   ·过氧化物酶体是受Cu~(2+)胁迫影响的主要通路第58页
   ·细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ是Cu~(2+)和MBF1 协同作用的关键位点第58-59页
参考文献第59-64页
附录第64-65页
致谢第65-66页

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