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运动发酵单胞菌中实时定量PCR体系的建立及主碳代谢途径基因转录初步分析

中文摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第一章 文献综述第9-24页
   ·运动发酵单胞菌研究进展第9-15页
     ·运动发酵单胞菌的工业应用价值第9页
     ·运动发酵单胞菌的菌体特性第9-11页
     ·运动发酵单胞菌代谢途径研究进展第11-14页
     ·运动发酵单胞菌基因组尺度研究进展第14页
     ·运动发酵单胞菌基因工程改造的研究进展第14-15页
   ·Real-time qPCR 技术第15-22页
     ·转录水平的研究第15-16页
     ·Real-time qPCR 原理及应用现状第16-18页
     ·内参基因的选择第18-21页
     ·数据处理第21-22页
   ·本课题的研究目的及研究内容第22-24页
     ·研究目的第22页
     ·研究内容第22-23页
     ·技术路线第23-24页
第二章 材料与方法第24-39页
   ·实验材料第24-25页
     ·菌株和质粒第24页
     ·主要试剂第24-25页
     ·实验仪器第25页
   ·实验方法第25-37页
     ·菌种培养及保存第25页
     ·运动发酵单胞菌的生长第25-26页
     ·RNA 样本的分离纯化第26-28页
     ·cDNA 样本的制备第28-29页
     ·标准品的制备第29-30页
     ·候选内参基因和目的基因的筛选及引物合成第30-36页
     ·Real-time qPCR 扩增第36页
     ·HLPC 法测定运动发酵单胞菌发酵液组分第36-37页
   ·数据处理第37-39页
     ·内参基因的确定第37页
     ·各基因转录水平的计算第37-39页
第三章 结果与讨论第39-79页
   ·Real-time qPCR 体系优化结果第39-46页
     ·运动发酵单胞菌 ZM4 生长曲线第39页
     ·运动发酵单胞菌 ZM4 菌体个数与 OD600的关系第39-40页
     ·单位体积 TRIzol 裂解细胞数目的确定第40页
     ·RNA 及 cDNA 样本质量评估第40-44页
     ·引物退火温度优化及产物特异性分析第44-46页
   ·内参基因的确定第46-54页
     ·候选内参基因在不同样本中的表达结果第46-48页
     ·内参基因的筛选第48-54页
   ·主碳代谢途径基因在不同生长时期转录水平的研究第54-64页
     ·主碳代谢途径基因标准曲线第54-55页
     ·主碳代谢途径基因在不同生长阶段的转录水平第55-57页
     ·主碳代谢途径基因间在不同生长阶段的相对转录水平第57-64页
   ·野生型 ZM4 与突变型 ZM4(gfo::FRT)菌株在不同碳源及不同糖浓度生长时主碳代谢途径基因转录水平及发酵产物分析第64-79页
     ·实验条件第65页
     ·ZM4 及 ZM(gfo::FRT)在不同碳源及不同糖浓度中生长曲线第65-67页
     ·ZM4 和 ZM4(gfo::FRT)在不同碳源不同糖浓度中发酵分析第67-70页
     ·ZM4 和 ZM4(gfo::FRT)在不同生长条件下的 RNA 样本第70-71页
     ·内参基因稳定性评价第71-73页
     ·ZM4 和 ZM4(gfo::FRT)在不同碳源不同糖浓度中转录水平第73-79页
第四章 结论与展望第79-80页
   ·结论第79页
   ·展望第79-80页
参考文献第80-93页
发表论文和参加科研情况说明第93-94页
致谢第94页

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