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中国寄生虫数据库(ChinaPathDB)的数据准备及相关生物信息学分析

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
第1章 前言第9-21页
   ·生物信息学在寄生虫学领域的应用第9-10页
   ·寄生虫数据库第10-12页
   ·寄生虫与宿主第12-13页
   ·重要的模式寄生虫背景知识介绍第13-21页
     ·疟原虫第13-17页
     ·血吸虫第17-21页
第2章 中国寄生虫数据库(ChinaPathDB)表达谱数据的收集、整理第21-26页
第3章 基于寄生虫公共数据的二次分析第26-34页
   ·血吸虫蛋白蛋白相互作用(PPI)网络的构建第26-31页
     ·研究背景第26-28页
     ·材料和方法第28-29页
     ·结果与讨论第29-31页
   ·寄生虫受体预测第31-34页
     ·研究背景第31-32页
     ·材料和方法第32页
     ·结果与讨论第32-34页
第4章 血吸虫血红蛋白降解途径关键酶蛋白的序列分析和结构分析第34-57页
   ·研究背景第34-41页
     ·疟原虫血红蛋白降解途径及其关键酶第34-38页
     ·疟原虫食物泡中的抗疟药靶点第38页
     ·存贮于PDB数据库的恶性疟原虫血红蛋白降解酶结构第38-40页
     ·蛋白质结构模拟与分子对接第40-41页
   ·材料和方法第41-44页
     ·构建日本血吸虫、曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径第41页
     ·血红蛋白降解酶的保守结构域同源建模第41-43页
     ·用于分子对接的receptor的准备第43-44页
     ·用于分子对接的ligand的准备第44页
     ·保守结构域与底物片段的对接第44页
   ·结果与讨论第44-57页
     ·日本血吸虫、曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径第44-47页
     ·血红蛋白降解酶保守结构域的同源建模及分析第47-52页
     ·底物片段的结构第52-54页
     ·酶与底物片段的对接结果第54-57页
第5章 总结与展望第57-58页
参考文献第58-63页
致谢第63-64页
附录1第64-70页

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