| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-20页 |
| ·课题背景 | 第10-11页 |
| ·国内外研究概况 | 第11-17页 |
| ·基于距离的建树方法 | 第12-14页 |
| ·最简约方法 | 第14-15页 |
| ·极大似然法 | 第15-16页 |
| ·建树方法的特点与比较 | 第16-17页 |
| ·本文的主要研究工作 | 第17-18页 |
| ·文章结构 | 第18-20页 |
| 第2章 不加权算术平均组对法介绍 | 第20-30页 |
| ·距离矩阵法构建进化树的基本过程 | 第20-24页 |
| ·构建进化树 | 第20-22页 |
| ·核苷酸替代模型 | 第22-24页 |
| ·UPGMA 算法 | 第24-26页 |
| ·UPGMA 结果不惟一问题的分析 | 第26-28页 |
| ·传统建树方法的其他问题 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 不加权算术平均组群方法 | 第30-39页 |
| ·UMGMA 的基本思想 | 第30页 |
| ·UMGMA 算法描述 | 第30-35页 |
| ·实验数据与结果分析 | 第35-38页 |
| ·12 个物种mtDNA 序列数据的实验 | 第35-36页 |
| ·11 种果蝇的adh 序列数据实验 | 第36-38页 |
| ·算法分析 | 第38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第4章 Multi-Tree 分子进化分析系统的设计与实现 | 第39-65页 |
| ·系统设计原则 | 第39-40页 |
| ·系统需求 | 第40-41页 |
| ·业务目标 | 第40-41页 |
| ·用户特点 | 第41页 |
| ·系统架构与设计实现 | 第41-57页 |
| ·系统架构描述 | 第41-44页 |
| ·系统详细设计与实现 | 第44-57页 |
| ·系统主要源文件说明 | 第57-59页 |
| ·系统输入输出 | 第59-63页 |
| ·进化树结果 | 第59页 |
| ·项目文件 | 第59页 |
| ·序列文件 | 第59-60页 |
| ·多序列比对结果 | 第60页 |
| ·距离矩阵文件 | 第60-61页 |
| ·进化树的字符串表示 | 第61页 |
| ·系统树的绘制风格 | 第61-63页 |
| ·系统运行环境 | 第63-64页 |
| ·本章小结 | 第64-65页 |
| 结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-72页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |