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犬类microRNA的计算机鉴定及分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
第1章 综述第10-24页
   ·引言第10页
   ·microRNA 基因第10-12页
     ·microRNA 的发现过程第10-11页
     ·miRNA 基因的结构特征第11-12页
   ·miRNA 的生物合成第12-16页
     ·miRNA 生物发生的基本概况第12-13页
     ·miRNA 加工的核内过程第13-14页
     ·microRNA 加工蛋白第14-15页
     ·微处理器对 pri-miRNA 的剪切机制第15页
     ·pre-miRNA 的细胞核输出第15-16页
   ·microRNA 的作用机制第16-18页
     ·miRNA 指导靶 mRNA 的切割第16页
     ·翻译抑制第16-17页
     ·靶分子的识别第17页
     ·快速脱腺苷酸化第17-18页
     ·miRNA 与 siRNA 的异同第18页
   ·microRNA 的生物学功能第18-20页
     ·miRNA 在动物中的作用第18-19页
     ·miRNA 在植物中的作用第19-20页
     ·与人类疾病相关的 miRNA第20页
   ·miRNA 的命名和界定第20-21页
     ·miRNA 的界定第20-21页
     ·miRNA 的命名第21页
   ·microRNA 的研究方法第21-22页
     ·microRNA 的实验 RNA 组学方法第21-22页
       ·Northern 杂交第21页
       ·原位杂交第21-22页
       ·miRNA 表达谱芯片第22页
       ·基于核酶保护分析技术第22页
     ·microRNA 的计算机 RNA 组学方法第22页
   ·本论文的研究目的与意义第22-24页
第2章 材料与方法第24-34页
   ·材料第24-25页
     ·使用的数据库第24页
     ·供试犬类品种第24页
     ·主要仪器和设备第24-25页
   ·方法第25-34页
     ·microRNA 的计算机分析第25-26页
       ·microRNA 同源基因的搜索第25页
       ·新的 microRNA 基因的预测第25页
       ·microRNA 的基因组织分析第25页
       ·microRNA 的进化分析第25-26页
       ·microRNA 基因的靶序列预测第26页
     ·狗肝中总 RNA 的提取(热酚法)第26-28页
       ·试剂和材料第26页
       ·实验步骤第26-27页
       ·甲醛变性琼脂糖凝胶电泳检测 RNA第27-28页
     ·基因组 DNA 的提取(玻璃珠法)第28-30页
       ·试剂第28页
       ·实验步骤第28-30页
     ·RNA 中的 DNA 的酶解第30页
     ·RNA 的逆转录反应第30-31页
     ·PCR 反应及其产物鉴定第31-34页
第3章 结果第34-89页
   ·300 个同源 microRNA 基因的发现第34-50页
   ·新的 microRNA 分子的鉴定第50-54页
   ·microRNA 分子的基因组织形式第54-58页
   ·microRNA 分子的进化第58-61页
   ·microRNA 靶序列的鉴定第61-86页
   ·microRNA 的表达分析第86-89页
     ·狗总 RNA 提取结果第86-87页
     ·狗基因组 DNA 提取结果第87-88页
     ·RT-PCR 结果第88-89页
第4章 讨论第89-93页
   ·计算机 RNA 组学是鉴定 microRNA 快速、高效的方法第89-90页
   ·microRNA 具有多样的基因组织形式第90-91页
   ·microRNA 进化的机制第91页
   ·miR-186 与靶序列共表达的进化机制第91页
   ·microRNA 的功能多样性第91-92页
   ·microRNA 表达的时空特异性第92-93页
致谢第93-94页
参考文献第94-99页
附录A: 人基因组中尚未发现同源序列的人小分子 RNA第99-101页
附录B: MICRORNA与靶序列完全互补第101-103页
附录C:缩略词第103-104页
攻读学位期间的研究成果第104页

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