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新疆军垦型细毛羊基因组BAC文库的构建及20号染色体MHC基因邻近区段相关位1点的研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-16页
第一章 文献综述第16-50页
 引言第16-18页
   ·绵羊的起源、细毛羊品种分类及新疆细毛羊遗传资源现状第18-20页
     ·绵羊的起源及细毛羊品种分类第18-19页
       ·绵羊的起源第18页
       ·绵羊品种分类第18-19页
     ·新疆细毛羊的遗传资源现状第19-20页
   ·绵羊的基因组研究第20-35页
     ·绵羊基因组的研究第21-23页
     ·绵羊的基因组图谱第23-30页
       ·绵羊的遗传连锁图谱第23-25页
       ·绵羊的物理图谱第25-29页
       ·基因图谱在动物遗传育种中的应用第29-30页
     ·比较基因组学与绵羊的比较图谱第30-32页
     ·主要组织相容性复合体(MHC)基因第32-35页
   ·BAC文库及其在基因组学中的应用第35-45页
     ·DNA克隆载体的发展与应用第35-37页
       ·质粒载体必须具备的基本条件第35页
       ·质粒载体的选择记号第35-36页
       ·YAC载体第36-37页
       ·P1克隆和源于P1的PAC载体第37页
     ·BAC载体概述第37-39页
     ·BAC载体的发展历史第39-42页
     ·BAC文库的构建方法第42页
     ·BAC文库的筛选方法第42-43页
       ·PCR筛选系统第42-43页
       ·HD杂交膜筛选系统第43页
     ·BAC文库的参数第43-44页
       ·基因组覆盖率(genome equivalent,GE)第43页
       ·嵌合体比率第43-44页
     ·BAC文库的应用第44-45页
   ·微卫星、STS等分子遗传标记在动物遗传育种中的应用第45-48页
     ·遗传标记的种类第45-46页
       ·遗传标记的概念第45-46页
       ·分子标记的种类第46页
     ·微卫星分子遗传标记在绵羊育种中的应用第46-47页
       ·微卫星DNA第46页
       ·微卫星在绵羊基因定位及构建基因图谱中的应用第46-47页
     ·STS(Sequence Tagged Sites)第47-48页
   ·脉冲电场凝胶电泳第48-50页
第二章 本项目的研究意义和立题依据第50-53页
   ·研究意义第50-51页
   ·立题依据第51-52页
   ·总技术路线第52-53页
第三章 材料和方法第53-68页
   ·主要试剂第53页
   ·常规试剂第53-54页
   ·主要仪器第54页
   ·新疆军垦型细毛羊基因组BAC文库的构建第54-61页
     ·试验动物第54-55页
     ·菌株和克隆载体第55页
       ·菌株第55页
       ·克隆载体第55页
     ·新疆军垦型细毛羊基因组BAC文库构建试剂第55-56页
     ·试验方法第56-61页
       ·BAC文库的构建与鉴定第57-61页
   ·新疆军垦型细毛羊2倍基因组文库PCR筛选系统的建立和使用第61-63页
     ·单克隆分离和培养第62页
     ·使用机械臂分装菌液第62页
     ·池DNA的提取第62页
     ·PCR筛选BAC文库中的阳性克隆第62-63页
   ·MHC基因邻近区段相关位点的研究第63-68页
     ·白细胞的分离和激化第63-65页
     ·提取白细胞中的DNA,检测、定量PCR模板DNA第65页
     ·PCR反应条件第65-66页
       ·相关位点的引物序列第65页
       ·材料第65-66页
       ·加样步骤第66页
       ·琼脂糖凝胶检测PCR扩增产物第66页
     ·使用试剂盒从胶中回收DNA第66-68页
第四章 结果与分析第68-85页
   ·新疆军垦型细毛羊基因组BAC文库的构建与鉴定第68-74页
     ·新疆军垦型细毛羊基因组BAC文库的构建第68-74页
       ·新疆军垦型细毛羊基因组DNA大片段制备第68-71页
       ·BAC载体制备第71页
       ·连接和转化第71页
       ·文库的管理第71-72页
       ·随机挑取BAC克隆,酶切鉴定BAC文库平均插入片段大小第72-74页
   ·新疆军垦型细毛羊2倍基因组文库PCR筛选系统的建立第74-76页
     ·单克隆分离和培养第74页
     ·使用机械臂分装菌液第74页
     ·池DNA的提取第74页
     ·文库结构和PCR筛选系统第74-75页
     ·PCR筛选BAC文库中MHC基因邻近区段分子标记的阳性克隆第75-76页
   ·MHC基因邻近区段相关位点阳性克隆的研究第76-85页
     ·白细胞的分离与激化第76页
     ·提取白细胞中的DNA,检测、定量PCR模板DNA第76-77页
     ·MHC基因邻近区段相关位点的PCR反应、检测及测序第77-85页
       ·DMB_EX_2位点的研究第77-79页
       ·MCMA36位点的研究第79-81页
       ·CP73位点的研究第81-83页
       ·BM1258位点的研究第83-85页
第五章 结论与讨论第85-91页
   ·讨论第85-87页
     ·新疆军垦型细毛羊基因组文库的构建与鉴定第85-87页
       ·文库的筛选系统第85页
       ·文库的质量第85-86页
       ·文库的构建技术第86-87页
   ·MHC基因邻近区段相关位点的研究第87-88页
     ·MHC基因邻近区段相关位点的比对结果第87-88页
   ·结论第88-89页
   ·展望第89-91页
致谢第91-92页
参考文献第92-101页
附录第101-106页
 附录1第101-103页
 附录2第103-105页
 附录3第105-106页
缩略词第106-107页
作者简介第107页

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