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虎(Panthera tigris)微卫星位点多态性及其在圈养种群管理中的应用

1 前言第1-61页
 1.1 虎是倍受关注的濒危物种第7-10页
 1.2 技术上的障碍使野生虎种群数量不够清楚第10-12页
 1.3 虎野生种群的恢复困难重重,圈养种群成为最宝贵的资源第12-14页
 1.4 遗传多样性的保持与监测必须提到战略高度第14-22页
 1.5 圈养种群遗传管理的科学化需要高新技术的支持第22-23页
 1.6 种群管理问题的实验室解决方案第23-61页
  1.6.1 限制性片段长度多态性分析技术第24-27页
  1.6.2 线粒体DNA序列分析技术第27-30页
  1.6.3 随机扩增多态DNA技术第30-33页
  1.6.4 可变数目串联重复序列分析技术第33-61页
   1.6.4.1 微卫星DNA的分布与特点第33-35页
   1.6.4.2 微卫星DNA的研究策略及筛选方法第35-41页
   1.6.4.3 微卫星DNA的应用第41-61页
2 材料与方法第61-71页
 2.1 采样第61-63页
 2.2 DNA的提取第63-64页
 2.3 PCR引物的选择第64-65页
 2.4 PCR条件第65-66页
 2.5 扩增产物的分析第66页
 2.6 微卫星DNA的序列分析第66-67页
 2.7 微卫星DNA数据分析第67-71页
  2.7.1 等位基因频率的计算第67页
  2.7.2 基因型频率的计算第67-68页
  2.7.3 Hardy-Weinberg平衡检验第68页
  2.7.4 杂合子频率与杂合度的计算第68页
  2.7.5 无关个体偶合概率的计算第68-69页
  2.7.6 父权指数与父子关系相对机会的计算第69页
  2.7.7 东北虎、孟加拉虎和华南虎3个亚种间遗传距离的计算第69-70页
  2.7.8 微卫星位点引物种属通用性的检测第70-71页
3 研究结果第71-109页
 3.1 15个微卫星位点的扩增结果第71-72页
 3.2 15个虎微卫星位点的数据分析第72-99页
  3.2.1 等位基因大小及其数量第72-79页
  3.2.2 微卫星位点的分型第79-84页
  3.2.3 微卫星位点的基因频率第84-90页
  3.2.4 微卫星位点的基因型频率第90页
  3.2.5 Hardy-Weinberg平衡检验第90-96页
  3.2.6 各个微卫星位点的杂合子频率与杂合度第96-97页
  3.2.7 东北虎、孟加拉虎和华南虎3个亚种的遗传距离第97-99页
 3.3 雄森熊虎山庄当前虎种群的遗传学分析第99-109页
  3.3.1 雄森熊虎山庄虎个体的基因型数据第99页
  3.3.2 父权指数与父子关系相对机会第99-102页
  3.3.3 个体识别第102-106页
  3.3.4 15个微卫星位点的种属特异性第106-109页
4 讨论第109-129页
 4.1 等位基因判别的准确度第109-111页
 4.2 滑动(Stutter)现象与延伸不完全对确认等位基因的影响第111-112页
 4.3 等位基因丢失与Hafdy-Weinberg平衡第112-113页
 4.4 遗传多样性评价第113-120页
  4.4.1 等位基因数量第114页
  4.4.2 等位基因的频率分布第114-115页
  4.4.3 杂合度第115-117页
  4.4.4 遗传距离与亚种分化第117-120页
 4.5 种群的管理应用第120-121页
 4.6 遗传多样性的保护第121-125页
  4.6.1 严格保持亚种的独立性第121-122页
  4.6.2 避免近交第122-123页
  4.6.3 控制世代间隔时间第123-124页
  4.6.4 基因交流第124-125页
 4.7 圈养虎野性的保持与放虎归山第125-129页
5 结论第129-130页
参考文献第130-152页
致谢第152-153页

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