| 缩略词 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-24页 |
| 1 细菌人工染色体（Bacterial Artificial Chromosome, BAC）文库的研究进展 | 第13-20页 |
| ·用于大插入片度文库构建的载体 | 第13-16页 |
| ·BAC 文库的构建 | 第16-17页 |
| ·BAC 文库的筛选 | 第17页 |
| ·BAC 文库的分类 | 第17-18页 |
| ·BAC 文库的应用 | 第18-20页 |
| 2 BAC 末端序列的分析 | 第20-22页 |
| ·简单重复序列（SSRs）分析 | 第20页 |
| ·重复元件分析 | 第20-21页 |
| ·基因预测 | 第21-22页 |
| 3 柑橘基因组研究进展 | 第22-23页 |
| 4 本研究的目的意义和主要内容 | 第23-24页 |
| 第二章 琯溪蜜柚BAC 文库的构建与评价 | 第24-53页 |
| 1 材料与方法 | 第25-40页 |
| ·仪器与试剂 | 第25-26页 |
| ·材料 | 第26-27页 |
| ·琯溪蜜柚HMW-DNA 提取方法的建立 | 第27-28页 |
| ·HMW-DNA 的包埋 | 第28-29页 |
| ·胶块的清洗与保存 | 第29页 |
| ·HMW-DNA 的部分酶切条件的确定 | 第29-30页 |
| ·HMW-DNA 的大量酶切 | 第30页 |
| ·酶切片段的分离、回收 | 第30-31页 |
| ·连接与转化 | 第31-32页 |
| ·BAC 文库的保存 | 第32-33页 |
| ·Southern blot 检测细胞器DNA 的污染 | 第33-40页 |
| 2 结果与分析 | 第40-47页 |
| ·细胞核DNA 提取方法的比较 | 第40-41页 |
| ·不同消化时间对HWM-DNA 含量的影响 | 第41-42页 |
| ·HMW-DNA 的部分酶切 | 第42-43页 |
| ·大片段DNA 的分离和回收 | 第43-44页 |
| ·连接反应和电击转化 | 第44-45页 |
| ·文库的保存 | 第45页 |
| ·文库质量 | 第45-47页 |
| 3 讨论 | 第47-52页 |
| ·高分子量DNA 的提取 | 第47-48页 |
| ·载体的选择 | 第48-49页 |
| ·部分酶切条件的确定 | 第49页 |
| ·大片段DNA 的回收 | 第49-50页 |
| ·影响电击转化效率的因素 | 第50-51页 |
| ·BAC 文库的保存 | 第51页 |
| ·文库质量评价 | 第51-52页 |
| 4 小结 | 第52-53页 |
| 第三章 汁胞粒化相关EST M4 的筛选与基因组序列分析 | 第53-75页 |
| 1 材料与方法 | 第53-61页 |
| ·仪器与试剂 | 第53-54页 |
| ·材料 | 第54页 |
| ·BAC 文库超级池的构建 | 第54页 |
| ·小量法提取BAC DNA | 第54页 |
| ·PCR 法筛选文库 | 第54-55页 |
| ·阳性克隆的验证 | 第55-59页 |
| ·反向PCR（I-PCR）扩增EST M4 两侧未知DNA 序列 | 第59-61页 |
| ·M4 两侧基因组序列的生物信息学分析 | 第61页 |
| 2 结果与分析 | 第61-71页 |
| ·PCR 法筛选BAC 文库 | 第61-62页 |
| ·阳性克隆51E8 插入片段大小检测 | 第62-63页 |
| ·阳性克隆51E8 指纹图谱及Southern blot 验证 | 第63页 |
| ·EST M4 DNA 序列的获得 | 第63-65页 |
| ·I-PCR 扩增M4 两翼序列 | 第65-66页 |
| ·M4 及两翼DNA 序列的生物信息学分析 | 第66-71页 |
| 3 讨论 | 第71-74页 |
| ·筛选文库的方法 | 第71-72页 |
| ·反向PCR 扩增DNA 的两翼序列 | 第72页 |
| ·应用基因预测软件GENSCAN 和FGENESH 预测粒化相关基因 | 第72-74页 |
| 4 小结 | 第74-75页 |
| 第四章 琯溪蜜柚BAC 末端测序与序列分析 | 第75-87页 |
| 1 材料与方法 | 第75-80页 |
| ·材料 | 第75-76页 |
| ·BAC DNA 末端序列的亚克隆 | 第76-79页 |
| ·末端序列的生物信息学分析 | 第79-80页 |
| 2 结果与分析 | 第80-83页 |
| ·琯溪蜜柚BAC 末端测序 | 第80页 |
| ·BAC 末端序列中的简单重复序列 | 第80-82页 |
| ·末端序列中的重复元件分析 | 第82页 |
| ·末端序列中的编码区分析 | 第82-83页 |
| 3 讨论 | 第83-86页 |
| ·琯溪蜜柚BAC 末端测序 | 第83页 |
| ·琯溪蜜柚基因组中的简单重复序列（SSRs） | 第83页 |
| ·琯溪蜜柚基因组的重复元件分析 | 第83-85页 |
| ·琯溪蜜柚基因组的GC 含量与编码区分析 | 第85-86页 |
| 4 小结 | 第86-87页 |
| 第五章 总结与研究展望 | 第87-89页 |
| 1 总结 | 第87-88页 |
| 2 研究展望 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-100页 |
| 附录 | 第100-118页 |
| 附录Ⅰ M4 及其两翼 DNA 序列 | 第100-102页 |
| 附录Ⅱ 预测得到的 M4 及其两翼序列的编码区 | 第102-107页 |
| 附录Ⅲ BAC 末端列中的重复元件 | 第107-114页 |
| 附录Ⅳ 从末端序列中预测得到的部分编码区序列和所编码的氨基酸序列 | 第114-118页 |
| 致谢 | 第118页 |
