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乳腺癌中雌激素诱导的长链非编码RNA的鉴定和功能研究

英文缩略词第4-5页
摘要第5-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 前言第14-28页
    1 乳腺癌的现状与研究进展第14-19页
        1.1 乳腺癌简介第14页
        1.2 乳腺癌的发病率和死亡率第14-15页
        1.3 乳腺癌患者的年龄分布第15-16页
        1.4 乳腺癌的致病因素第16页
        1.5 乳腺癌的分子分型第16-17页
        1.6 乳腺癌的治疗第17-18页
        1.7 乳腺癌发生发展的主要机制第18页
        1.8 乳腺癌的全球研究现状第18-19页
    2 长链非编码RNA第19-25页
        2.1 长链非编码RNA介绍第19-22页
        2.2 长链非编RNA的分子机制和生物学功能第22-25页
    3 长非编码RNA与乳腺癌第25-27页
    4 本课题的研究目的和意义第27-28页
第二章 材料和方法第28-75页
    1 主要实验试剂和仪器第28-33页
        1.1 主要试剂第28-29页
        1.2 主要耗材第29-30页
        1.3 质粒第30页
        1.4 主要引物第30-33页
    2 主要试剂配方第33-37页
        2.1 普通培养液DMEM配方(1L)第33-34页
        2.2 活性炭吸附的DMEM培养液(去激素培养液)第34页
        2.3 细胞培养其他相关试剂第34-35页
        2.4 50xTAE配方第35页
        2.5 配制6x DNA loading buffer(DNA电泳用)第35页
        2.6 配制1000x Ampicillin溶液第35页
        2.7 配制LB液体培养基第35-36页
        2.8 配制LB/Amp液体培养基第36页
        2.9 配制20x SSC缓冲液第36-37页
        2.10 配备1x PBS缓冲液第37页
    3 主要试剂盒第37-41页
        3.1 细胞总RNA提取纯化试剂盒(promega)第37页
        3.2 细胞总RNA提取纯化试剂盒(QIAGEN)第37-38页
        3.3 通用型DNA纯化回收试剂盒(TIANGEN)第38页
        3.4 质粒小提试剂盒(TIANGEN)第38-39页
        3.5 琼脂糖凝胶浓度与线性DNA的最佳分辨范围第39页
        3.6 Dual-Glo(?) Luciferase Assay System (promega)第39页
        3.7 TranStart Top Green qPCR SuperMix第39页
        3.8 TranStart FastPfu DNA Polymerase第39-40页
        3.9 GoScript Reverse Transcription System第40页
        3.10 SilverQuest Silver Staining Kit第40页
        3.11 NEBNext(?)Ultra~(TM)Ⅱ Directional RNA Library Prep Kit for Illumina(?)第40-41页
    4 细胞株和感受态第41页
    5 主要实验方法第41-75页
        5.1 细胞传代第41-42页
        5.2 细胞冻存第42页
        5.3 细胞复苏第42页
        5.4 雌激素刺激的乳腺癌MCF-7细胞培养第42-43页
        5.5 细胞转染实验第43-44页
        5.6 敲低表达载体的构建第44-49页
        5.7 慢病毒的包装和细胞感染第49-50页
        5.8 过表达载体的构建第50-54页
        5.9 报告基因第54-55页
        5.10 细胞增殖第55页
        5.11 细胞总RNA的提取(方法一)第55-57页
        5.12 细胞总RNA的提取(方法二)第57-58页
        5.13 细胞总RNA的提取(方法三)第58-60页
        5.14 逆转录反应(promega)第60-61页
        5.15 实时荧光定量PCR实验(RT-qPCR)第61-62页
        5.16 测序样本的准备第62-63页
        5.17 RNA-seq测序文库的构建和高通量测序第63-72页
        5.18 GRO-seq测序文库构建和高通量测序第72-75页
第三章 实验结果第75-92页
    1. 雌激素诱导的lncRNA的生物信息分析第75-79页
        1.1 基于RNA-seq鉴定雌激素诱导的lncRNA的数据分析第75-76页
        1.2 基于Gro-seq鉴定雌激素诱导的lncRNA的数据分析第76-78页
        1.3 生物信息预测差异表达的lncRNA的性能指标第78-79页
        1.4 差异表达的lncRNA的筛选和验证第79页
    2. 乳腺癌细胞中受雌激素诱导的长非编码RNA第79-85页
    3. 部分lncRNA对乳腺癌细胞的增殖具有显著影响第85页
    4. LINC02568在乳腺癌组织中特异性高表达第85-87页
    5. LINC02568在乳腺癌的发生发展中的重要性第87-92页
第四章 讨论第92-95页
    1. 高通量测序数据分析的瓶颈和解决方案第92-93页
    2. 雌激素诱导的长链非编码RNA潜在的分子机制第93-95页
第五章 结论第95-96页
参考文献第96-101页
致谢第101-103页
硕士研究生期间主要研究成果第103页

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