摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
1. 绪论 | 第11-18页 |
1.1. 金属蛋白 | 第11-12页 |
1.2. 金属蛋白分子力场的发展与现状 | 第12-14页 |
1.3. ABEEMσπ浮动电荷极化力场形式 | 第14-15页 |
1.4. 蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB) | 第15-17页 |
1.4.1. 蛋白质结构数据库简介 | 第15-16页 |
1.4.2. 蛋白质结构数据库特点及格式 | 第16-17页 |
1.5. 元素周期表 | 第17-18页 |
2. 发展ABEEMσπ模型涵盖元素周期表中所有过渡金属元素 | 第18-32页 |
2.1. 发展ABEEMσπ模型(参考电荷的首次引入) | 第18-24页 |
2.2. ABEEMσπ模型参数的确定 | 第24-31页 |
2.2.1. 标号体系 | 第24-25页 |
2.2.2. ABEEMσπ模型参数 | 第25-31页 |
2.3. 小结 | 第31-32页 |
3. 金属蛋白模型分子的电荷分布 | 第32-124页 |
3.1. 模型分子的选取 | 第32页 |
3.1.1. PDB截取获得模型分子 | 第32页 |
3.1.2. 高斯优化获得模型分子 | 第32页 |
3.2. 选取量子力学方法计算电荷分布 | 第32-33页 |
3.3. 金属蛋白模型分子的电荷分布 | 第33-123页 |
3.4. 小结 | 第123-124页 |
4. 金属蛋白模型分子的偶极矩 | 第124-129页 |
4.1. 偶极矩 | 第124页 |
4.2. 金属蛋白模型分子的偶极矩 | 第124-128页 |
4.3. 小结 | 第128-129页 |
5. ABEEMσπ浮动电荷极化力场应用于金属蛋白的动力学初步研究 | 第129-138页 |
5.1. 3bdja模型分子的结构、参数和构型的优化 | 第129-132页 |
5.2. 其它模型分子的优化 | 第132-136页 |
5.3. 小结 | 第136-138页 |
6. 应用ABEEMσπ模型研究碱金属和碱土金属卤化物以及非金属硼化物 | 第138-148页 |
6.1. 应用ABEEMσπ模型研究碱金属和碱土金属的卤化物 | 第138-143页 |
6.1.1. 碱金属和碱土金属卤化物 | 第138页 |
6.1.2. ABEEMσπ模型中碱金属与碱土金属卤化物参数的确定 | 第138-141页 |
6.1.3. 碱金属与碱土金属卤化物的电荷分布 | 第141-142页 |
6.1.4. 碱金属与碱土金属卤化物的偶极矩 | 第142-143页 |
6.2. 应用ABEEMσπ模型研究非金属硼化物 | 第143-147页 |
6.2.1. 非金属硼化物 | 第143-144页 |
6.2.2. ABEEMσπ模型中非金属硼化物参数的确定 | 第144-145页 |
6.2.3. 非金属硼化物的电荷分布 | 第145-147页 |
6.3. 小结 | 第147-148页 |
结论 | 第148-149页 |
参考文献 | 第149-159页 |
攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第159-160页 |
致谢 | 第160页 |