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发展ABEEMσπ浮动电荷极化力场应用于含有过渡金属金属蛋白的研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
1. 绪论第11-18页
    1.1. 金属蛋白第11-12页
    1.2. 金属蛋白分子力场的发展与现状第12-14页
    1.3. ABEEMσπ浮动电荷极化力场形式第14-15页
    1.4. 蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)第15-17页
        1.4.1. 蛋白质结构数据库简介第15-16页
        1.4.2. 蛋白质结构数据库特点及格式第16-17页
    1.5. 元素周期表第17-18页
2. 发展ABEEMσπ模型涵盖元素周期表中所有过渡金属元素第18-32页
    2.1. 发展ABEEMσπ模型(参考电荷的首次引入)第18-24页
    2.2. ABEEMσπ模型参数的确定第24-31页
        2.2.1. 标号体系第24-25页
        2.2.2. ABEEMσπ模型参数第25-31页
    2.3. 小结第31-32页
3. 金属蛋白模型分子的电荷分布第32-124页
    3.1. 模型分子的选取第32页
        3.1.1. PDB截取获得模型分子第32页
        3.1.2. 高斯优化获得模型分子第32页
    3.2. 选取量子力学方法计算电荷分布第32-33页
    3.3. 金属蛋白模型分子的电荷分布第33-123页
    3.4. 小结第123-124页
4. 金属蛋白模型分子的偶极矩第124-129页
    4.1. 偶极矩第124页
    4.2. 金属蛋白模型分子的偶极矩第124-128页
    4.3. 小结第128-129页
5. ABEEMσπ浮动电荷极化力场应用于金属蛋白的动力学初步研究第129-138页
    5.1. 3bdja模型分子的结构、参数和构型的优化第129-132页
    5.2. 其它模型分子的优化第132-136页
    5.3. 小结第136-138页
6. 应用ABEEMσπ模型研究碱金属和碱土金属卤化物以及非金属硼化物第138-148页
    6.1. 应用ABEEMσπ模型研究碱金属和碱土金属的卤化物第138-143页
        6.1.1. 碱金属和碱土金属卤化物第138页
        6.1.2. ABEEMσπ模型中碱金属与碱土金属卤化物参数的确定第138-141页
        6.1.3. 碱金属与碱土金属卤化物的电荷分布第141-142页
        6.1.4. 碱金属与碱土金属卤化物的偶极矩第142-143页
    6.2. 应用ABEEMσπ模型研究非金属硼化物第143-147页
        6.2.1. 非金属硼化物第143-144页
        6.2.2. ABEEMσπ模型中非金属硼化物参数的确定第144-145页
        6.2.3. 非金属硼化物的电荷分布第145-147页
    6.3. 小结第147-148页
结论第148-149页
参考文献第149-159页
攻读博士学位期间发表学术论文情况第159-160页
致谢第160页

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