| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表(ABBREVIATIONS) | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第13-24页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第13-15页 |
| 1.2 文献综述 | 第15-23页 |
| 1.2.1 T淋巴细胞的分化发育过程 | 第15-17页 |
| 1.2.2 T淋巴细胞各类亚型及其功能 | 第17-20页 |
| 1.2.3 T淋巴细胞分化发育的研究进展 | 第20-22页 |
| 1.2.4 T淋巴细胞分化发育研究的不足 | 第22-23页 |
| 1.3 本研究的目的与意义 | 第23-24页 |
| 2 实验材料和方法 | 第24-34页 |
| 2.1 技术路线 | 第24页 |
| 2.2 实验材料 | 第24-26页 |
| 2.2.1 试验动物 | 第24-25页 |
| 2.2.2 主要试验试剂 | 第25页 |
| 2.2.3 主要试剂的配置 | 第25页 |
| 2.2.4 主要实验仪器 | 第25-26页 |
| 2.2.5 主要数据库和生物学软件 | 第26页 |
| 2.3 方法 | 第26-34页 |
| 2.3.1 仔猪脾脏和肠系膜淋巴结组织样品的采集 | 第26-27页 |
| 2.3.2 脾脏、肠系膜淋巴结组织单细胞悬浮液的制备 | 第27页 |
| 2.3.3 台盼蓝染色检测细胞数量及活性 | 第27-28页 |
| 2.3.4 流式细胞术分选猪脾脏和肠系膜淋巴结三类T细胞 | 第28-29页 |
| 2.3.5 单类细胞测序样品的制备 | 第29页 |
| 2.3.6 单类细胞cDNA预扩增 | 第29页 |
| 2.3.7 建库测序 | 第29-30页 |
| 2.3.8 生物信息分析流程 | 第30-34页 |
| 3 结果 | 第34-53页 |
| 3.1 选取肠系膜淋巴结作为实验对象的研究过程 | 第34-36页 |
| 3.1.1 猪脾脏和肠系膜淋巴结CD4/CD8三类T细胞分选结果 | 第34-35页 |
| 3.1.2 猪脾脏和肠系膜淋巴结CD4+单阳T细胞文库质检情况 | 第35-36页 |
| 3.2 测序样品的制备 | 第36-39页 |
| 3.3 测序样品文库构建和质检情况 | 第39-42页 |
| 3.4 单类细胞测序结果的研究 | 第42-53页 |
| 3.4.1 测序数据质量评估 | 第42页 |
| 3.4.2 基因表达水平分析 | 第42-43页 |
| 3.4.3 RNA-seq相关性检查 | 第43-44页 |
| 3.4.4 差异表达基因的分布情况 | 第44-48页 |
| 3.4.5 差异表达基因的二维聚类分析结果 | 第48-49页 |
| 3.4.6 差异基因GO富集分析 | 第49-51页 |
| 3.4.7 时序差异表达分析 | 第51-53页 |
| 4 讨论 | 第53-56页 |
| 4.1 关于实验设计思路方面的讨论 | 第53页 |
| 4.2 关于脾脏和肠系膜淋巴结单细胞悬浮液制备方法的讨论 | 第53-54页 |
| 4.3 关于流式分选操作步骤的讨论 | 第54页 |
| 4.4 关于分化发育过程中差异基因的讨论 | 第54-56页 |
| 5 小结 | 第56-59页 |
| 5.1 本研究的主要结果 | 第56-57页 |
| 5.2 本研究的创新点与特色 | 第57页 |
| 5.3 本研究的不足之处 | 第57-58页 |
| 5.4 关于下一步工作的计划 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-67页 |
| 致谢 | 第67-69页 |
