| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第14-27页 |
| 1.1 大肠杆菌对畜牧业生产和公共卫生健康的影响 | 第14页 |
| 1.2 禽源大肠埃希菌毒力基因的研究进展 | 第14-20页 |
| 1.2.1 毒力因子的主要种类 | 第15-17页 |
| 1.2.2 毒力因子的毒力特性 | 第17-19页 |
| 1.2.3 毒力因子的分子流行病学 | 第19-20页 |
| 1.3 超广谱B-内酰胺酶的研究进展 | 第20-23页 |
| 1.3.1 ESBLs的定义和来源 | 第20页 |
| 1.3.2 ESBLs的分类 | 第20-22页 |
| 1.3.3 ESBLS的流行病学调查 | 第22-23页 |
| 1.4 整合子的研究进展 | 第23-25页 |
| 1.4.1 整合子的结构 | 第23页 |
| 1.4.2 整合子的分类 | 第23-24页 |
| 1.4.3 耐药基因盒 | 第24页 |
| 1.4.4 整合子-基因盒系统的流行病学 | 第24-25页 |
| 1.5 选题的目的和意义 | 第25-26页 |
| 1.6 本试验的创新点 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-37页 |
| 2.1 材料 | 第27-28页 |
| 2.1.1 试验菌株 | 第27页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第27页 |
| 2.1.3 主要仪器与设备 | 第27页 |
| 2.1.4 试验动物 | 第27-28页 |
| 2.2 方法 | 第28-37页 |
| 2.2.1 细菌基因组模板的制备 | 第28页 |
| 2.2.2 毒力因子的检测 | 第28-30页 |
| 2.2.3 系统进化群分析 | 第30-31页 |
| 2.2.4 动物致病性试验 | 第31-33页 |
| 2.2.5 最小抑菌浓度测定 | 第33页 |
| 2.2.6 超广谱β内酰胺酶的表型检测 | 第33页 |
| 2.2.7 质粒模板的提取 | 第33-34页 |
| 2.2.8 超广谱β-内酰胺酶基因型和基因亚型的检测 | 第34-35页 |
| 2.2.9 Ⅰ型和Ⅱ型整合子的检测 | 第35页 |
| 2.2.10 序列测定 | 第35-36页 |
| 2.2.11 统计分析 | 第36-37页 |
| 3 结果与分析 | 第37-80页 |
| 3.1 毒力因子的检测结果 | 第37-43页 |
| 3.1.1 24种毒力基因的检测结果 | 第37-41页 |
| 3.1.2 毒力基因组合分析 | 第41-43页 |
| 3.2 系统进化群分析结果 | 第43-44页 |
| 3.2.1 系统进化群分群结果 | 第43-44页 |
| 3.2.2 不同系统进化群的毒力基因携带情况 | 第44页 |
| 3.3 动物致病性试验结果 | 第44-46页 |
| 3.3.1 试验组 | 第44-45页 |
| 3.3.2 对照组 | 第45页 |
| 3.3.3 系统进化群菌株致病结果 | 第45-46页 |
| 3.4 系统进化群与毒力基因的相关性分析 | 第46-47页 |
| 3.5 禽源大肠杆菌耐药测定结果 | 第47-48页 |
| 3.6 超广谱B-内酰胺酶的表型检测结果 | 第48-50页 |
| 3.7 产ESBLS和非产ESBLS菌株的耐药情况比较 | 第50-52页 |
| 3.7.1 耐药率比较 | 第50-51页 |
| 3.7.2 多重耐药比较 | 第51-52页 |
| 3.8 超广谱B-内酰胺酶基因型的检测结果 | 第52-55页 |
| 3.8.1 四种常见基因型的检测结果 | 第52-53页 |
| 3.8.2 基因亚型的检测 | 第53-54页 |
| 3.8.3 ESBLs基因型和基因亚型的组合形式分析 | 第54-55页 |
| 3.9 Ⅰ型和Ⅱ型整合子的检测结果 | 第55-62页 |
| 3.9.1 Ⅰ型和Ⅱ型整合酶的检测结果 | 第55页 |
| 3.9.2 Ⅰ型和Ⅱ型整合子基因盒的检测结果 | 第55-60页 |
| 3.9.3 Ⅰ型整合子的酶切反应结果 | 第60-61页 |
| 3.9.4 整合子基因盒的测序结果 | 第61-62页 |
| 3.10 各类整合子及其携带耐药基因盒的流行情况 | 第62页 |
| 3.11 耐药表型与毒力之间的相关性 | 第62-74页 |
| 3.11.1 耐药表型与毒力基因的相关性 | 第62-71页 |
| 3.11.2 耐药表型与系统进化群的相关性 | 第71-72页 |
| 3.11.3 多重耐药与毒力的相关性 | 第72-73页 |
| 3.11.4 多重耐药与系统进化群的相关性 | 第73-74页 |
| 3.12 超广谱β-内酰胺酶与毒力的相关性 | 第74-78页 |
| 3.12.1 ESBLs表型与毒力基因的相关性 | 第74-76页 |
| 3.12.2 ESBLs表型与系统进化群的相关性 | 第76页 |
| 3.12.3 ESBLs基因亚型与系统进化群的相关性 | 第76-78页 |
| 3.13 整合子与毒力之间的相关性 | 第78-80页 |
| 3.13.1 整合子与毒力基因的相关性 | 第78页 |
| 3.13.2 整合子-基因盒与系统进化群的相关性 | 第78-80页 |
| 4 讨论 | 第80-94页 |
| 4.1 24种毒力基因流行分布情况 | 第80-81页 |
| 4.2 系统进化群分析 | 第81页 |
| 4.3 毒力基因、系统进化群与致病性的关系 | 第81-82页 |
| 4.4 禽源大肠杆菌耐药性的流行情况 | 第82页 |
| 4.5 超广谱B-内酰胺酶表型流行情况 | 第82-83页 |
| 4.6 超广谱B-内酰胺酶基因型的流行分布 | 第83-84页 |
| 4.7 超广谱B-内酰胺酶基因亚型的流行分布 | 第84-89页 |
| 4.7.1 TEM基因亚型 | 第84页 |
| 4.7.2 OXA基因亚型 | 第84-85页 |
| 4.7.3 CTX-M基因亚型 | 第85-88页 |
| 4.7.4 关于CTX-M-1组和CTX-M-9组组合的讨论 | 第88-89页 |
| 4.8 Ⅰ型整合子流行分布及与耐药性的关系 | 第89-90页 |
| 4.9 Ⅱ型整合子流行分布及与耐药性的关系 | 第90页 |
| 4.10 耐药表型与毒力基因的相关性 | 第90-92页 |
| 4.11 耐药表型与系统进化群的相关性 | 第92页 |
| 4.12 超广谱B-内酰胺酶与毒力基因的相关性 | 第92页 |
| 4.13 ESBLS基因型与系统进化群的相关性 | 第92-93页 |
| 4.14 整合子-基因盒与系统进化群、毒力基因的相关性 | 第93-94页 |
| 5 结论 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-108页 |
| 英文缩写词表 | 第108-110页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第110页 |
