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猪不同年龄阶段肝脏转录组及6-甲基腺嘌呤修饰的差异分析

摘要第5-8页
Abstract第8-10页
第一章 文献综述第15-27页
    1 肝脏功能第15-16页
        1.1 肝脏五要功能第15页
        1.2 出生后肝脏的物质代谢第15-16页
    2 RNA甲基化修饰的研究进展第16-20页
        2.1 RNA甲基化修饰概述第16-17页
        2.2 m6A的检测方法第17-18页
        2.3 m6A的研究现状第18-20页
    3 转录组测序第20-22页
    4 lncRNA研究进展第22-24页
    5 表观遗传学与营养第24-27页
第二章 主要研究内容与目的意义第27-29页
    1 主要研究内容第27-28页
    2 研究目的与意义第28-29页
第三章 材料与方法第29-47页
    1 实验动物第29页
    2 实验仪器与主要试剂第29-32页
        2.1 主要仪器设备第29-30页
        2.2 主要试剂第30-32页
        2.3 常用试剂的配制第32页
    3 试验方法第32-47页
        3.1 肝脏组织切片H&E染色第33页
        3.2 RNA抽提第33-34页
        3.3 RNA质检第34-35页
        3.4 链特异性转录组文库构建第35-36页
        3.5 m6A-seq文库构建第36-43页
        3.6 数据处理第43-47页
第四章 结果与分析第47-101页
    1 猪三个年龄阶段肝脏组织形态学观察第47-49页
    2 猪不同年龄阶段肝脏转录组第49-74页
        2.1 测序数据质量和比对的结果第49-51页
        2.2 不同年龄阶段肝脏转录组特征性分析第51-59页
        2.3 lncRNA同mRNA的基因组结构特征比较第59-62页
        2.4 不同年龄阶段肝脏转录组差异分析第62-74页
    3 不同年龄阶段肝脏RNA表观遗传修饰第74-101页
        3.1 测序数据(IP+Input)的质量第74-77页
        3.2 本研究肝脏m6A修饰的基本情况第77-81页
        3.3 m6A修饰的拓扑特征第81-87页
        3.4 m6A修饰与基因特征、表达的关系第87-90页
        3.5 m6A修饰基因参与重要的生物学功能调控第90-91页
        3.6 差异m6A修饰同差异基因表达第91-101页
第五章 讨论第101-108页
    1 不同年龄阶段肝脏组织形态学差异明显第101页
    2 不同年龄阶段肝脏转录组特征及差异第101-105页
        2.1 mRNA及lncRNA鉴定结果的可靠性第101-102页
        2.2 mRNA同lncRNA的结构特征第102-103页
        2.3 三个年龄阶段差异表达mRNA的功能分析第103页
        2.4 三个年龄阶段差异表达lncRNA的功能预测第103-105页
    3 不同年龄阶段肝脏RNA表观修饰差异第105-108页
        3.1 猪RNA水平m6A修饰的保守性第105页
        3.2 m6A修饰同基因量表达的负相关第105页
        3.3 m6A修饰同肝细胞分化和肝脏生长有关第105页
        3.4 m6A修饰在三个年龄阶段分别调控重要的生物学功能第105-108页
第六章 结论与创新点第108-110页
    1 结论第108页
    2 创新点第108-109页
    3 进一步的工作展望第109-110页
参考文献第110-118页
致谢第118-119页
附录第119-147页
博士期间第一作者发表学术论文第147页

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