摘要 | 第5-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
第一章 文献综述 | 第15-27页 |
1 肝脏功能 | 第15-16页 |
1.1 肝脏五要功能 | 第15页 |
1.2 出生后肝脏的物质代谢 | 第15-16页 |
2 RNA甲基化修饰的研究进展 | 第16-20页 |
2.1 RNA甲基化修饰概述 | 第16-17页 |
2.2 m6A的检测方法 | 第17-18页 |
2.3 m6A的研究现状 | 第18-20页 |
3 转录组测序 | 第20-22页 |
4 lncRNA研究进展 | 第22-24页 |
5 表观遗传学与营养 | 第24-27页 |
第二章 主要研究内容与目的意义 | 第27-29页 |
1 主要研究内容 | 第27-28页 |
2 研究目的与意义 | 第28-29页 |
第三章 材料与方法 | 第29-47页 |
1 实验动物 | 第29页 |
2 实验仪器与主要试剂 | 第29-32页 |
2.1 主要仪器设备 | 第29-30页 |
2.2 主要试剂 | 第30-32页 |
2.3 常用试剂的配制 | 第32页 |
3 试验方法 | 第32-47页 |
3.1 肝脏组织切片H&E染色 | 第33页 |
3.2 RNA抽提 | 第33-34页 |
3.3 RNA质检 | 第34-35页 |
3.4 链特异性转录组文库构建 | 第35-36页 |
3.5 m6A-seq文库构建 | 第36-43页 |
3.6 数据处理 | 第43-47页 |
第四章 结果与分析 | 第47-101页 |
1 猪三个年龄阶段肝脏组织形态学观察 | 第47-49页 |
2 猪不同年龄阶段肝脏转录组 | 第49-74页 |
2.1 测序数据质量和比对的结果 | 第49-51页 |
2.2 不同年龄阶段肝脏转录组特征性分析 | 第51-59页 |
2.3 lncRNA同mRNA的基因组结构特征比较 | 第59-62页 |
2.4 不同年龄阶段肝脏转录组差异分析 | 第62-74页 |
3 不同年龄阶段肝脏RNA表观遗传修饰 | 第74-101页 |
3.1 测序数据(IP+Input)的质量 | 第74-77页 |
3.2 本研究肝脏m6A修饰的基本情况 | 第77-81页 |
3.3 m6A修饰的拓扑特征 | 第81-87页 |
3.4 m6A修饰与基因特征、表达的关系 | 第87-90页 |
3.5 m6A修饰基因参与重要的生物学功能调控 | 第90-91页 |
3.6 差异m6A修饰同差异基因表达 | 第91-101页 |
第五章 讨论 | 第101-108页 |
1 不同年龄阶段肝脏组织形态学差异明显 | 第101页 |
2 不同年龄阶段肝脏转录组特征及差异 | 第101-105页 |
2.1 mRNA及lncRNA鉴定结果的可靠性 | 第101-102页 |
2.2 mRNA同lncRNA的结构特征 | 第102-103页 |
2.3 三个年龄阶段差异表达mRNA的功能分析 | 第103页 |
2.4 三个年龄阶段差异表达lncRNA的功能预测 | 第103-105页 |
3 不同年龄阶段肝脏RNA表观修饰差异 | 第105-108页 |
3.1 猪RNA水平m6A修饰的保守性 | 第105页 |
3.2 m6A修饰同基因量表达的负相关 | 第105页 |
3.3 m6A修饰同肝细胞分化和肝脏生长有关 | 第105页 |
3.4 m6A修饰在三个年龄阶段分别调控重要的生物学功能 | 第105-108页 |
第六章 结论与创新点 | 第108-110页 |
1 结论 | 第108页 |
2 创新点 | 第108-109页 |
3 进一步的工作展望 | 第109-110页 |
参考文献 | 第110-118页 |
致谢 | 第118-119页 |
附录 | 第119-147页 |
博士期间第一作者发表学术论文 | 第147页 |