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猪流行性腹泻病毒陕西分离株的鉴定及全基因组序列分析

摘要第5-7页
abstract第7-8页
文献综述第12-22页
    第一章 猪流行性腹泻病毒研究现状第12-22页
        1.1 猪流行性腹泻病毒PEDV的世界流行状况第12-13页
        1.2 猪流行性腹泻病毒PEDV的基因组结构第13-15页
        1.3 临床症状及组织学病变第15页
        1.4 病毒传播第15-16页
        1.5 PEDV肠内复制动力学第16页
        1.6 PEDV感染的免疫应答第16页
        1.7 猪流行性腹泻病毒PEDV的细胞培养特性第16-17页
        1.8 PEDV的诊断方法概述第17-19页
            1.8.1 检测PEDV病毒抗原的病毒学试验第17-18页
            1.8.2 免疫荧光检测(IF)第18页
            1.8.3 免疫组织化学(IHC)第18页
            1.8.4 抗原ELISA第18-19页
            1.8.5 基于聚合酶链反应(PCR)的PEDV核酸检测方法第19页
            1.8.6 胶体金检测技术(GICA)第19页
        1.9 猪流行性腹泻病PED的疫苗研究现状第19-20页
        1.10 猪流行性腹泻病PED的防治第20-21页
        1.11 研究的目的及意义第21-22页
第二章 猪流行性腹泻病毒陕西分离株的鉴定第22-35页
    2.1 材料与方法第22-27页
        2.1.1 病毒与细胞第22页
        2.1.2 载体与菌种第22页
        2.1.3 工具酶与主要试剂第22页
        2.1.4 主要仪器设备第22页
        2.1.5 病毒增殖第22-23页
        2.1.6 引物设计与合成第23页
        2.1.7 PEDV总RNA的提取第23页
        2.1.8 反转录第23-24页
        2.1.9 PCR扩增及检测第24页
        2.1.10 目的基因的克隆与鉴定第24-25页
        2.1.11 基因测序第25页
        2.1.12 S基因序列分析第25-27页
    2.2 结果及分析第27-34页
        2.2.1 病毒增殖的细胞病变镜检第27页
        2.2.2 PEDVS基因片段的RT-PCR扩增第27-28页
        2.2.3 鉴定阳性重组克隆第28-29页
        2.2.4 序列测定第29页
        2.2.5 S基因遗传进化树绘制与分析第29-31页
        2.2.6 S基因序列同源性分析第31-33页
        2.2.7 PEDV-SX株与CV777株S基因序列比对分析第33-34页
    2.3 讨论第34页
    2.4 小结第34-35页
第三章 猪流行性腹泻病毒陕西分离株的全基因组序列测定及分析第35-72页
    3.1 材料与方法第35-41页
        3.1.1 病毒与细胞第35页
        3.1.2 载体与菌种第35页
        3.1.3 工具酶与主要试剂第35页
        3.1.4 仪器设备第35页
        3.1.5 引物设计第35-37页
        3.1.6 病毒总RNA的提取第37页
        3.1.7 反转录第37页
        3.1.8 目的片段的PCR扩增及检测第37页
        3.1.9 PCR扩增产物回收第37页
        3.1.10 PCR产物与载体连接第37页
        3.1.11 转化第37-38页
        3.1.12 质粒的提取与鉴定第38页
        3.1.13 序列比对与分析第38-41页
    3.2 结果及分析第41-70页
        3.2.1 全基因组RT-PCR电泳结果第41页
        3.2.2 阳性重组克隆PCR鉴定结果第41-42页
        3.2.3 PEDV全基因组分析第42-45页
        3.2.4 5’-UTR和3’-UTR序列分析第45页
        3.2.5 PEDVE、M、N、ORF3、ORF1基因遗传进化分析及同源性分析第45-60页
        3.2.6 生物信息学分析PEDV-SX株各结构蛋白第60-70页
    3.3 讨论第70-71页
    3.4 小结第71-72页
全文总结第72-73页
参考文献第73-78页
致谢第78-79页
作者简介第79页

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