| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-22页 |
| 1.1 前言 | 第8-9页 |
| 1.2 阿尔兹海默症 | 第9-17页 |
| 1.2.1 AD的致病机理-淀粉样假说 | 第9-10页 |
| 1.2.2 淀粉样多肽 | 第10-12页 |
| 1.2.3 阿尔兹海默症的抑制剂 | 第12-17页 |
| 1.3 分子动力学模拟在淀粉样多肽聚集研究中的应用 | 第17-19页 |
| 1.3.1 分子动力学模拟的原理及方法 | 第18页 |
| 1.3.2 分子动力学模拟在淀粉样多肽聚集研究中的应用 | 第18-19页 |
| 1.4 自由能分解 | 第19-20页 |
| 1.4.1 MM/PBSA方法 | 第19页 |
| 1.4.2 MM/PBSA在生物大分子研究中的应用 | 第19-20页 |
| 1.5 本论文研究内容及意义 | 第20-22页 |
| 第二章 Aβ17-42 五聚体结合的分子机理 | 第22-46页 |
| 2.1 引言 | 第22-23页 |
| 2.2 模型系统与方法 | 第23-28页 |
| 2.2.1 MD模拟体系 | 第23-24页 |
| 2.2.2 MD模拟过程 | 第24-25页 |
| 2.2.3 模拟参数设置 | 第25页 |
| 2.2.4 分析方法 | 第25-28页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第28-45页 |
| 2.3.1 结构稳定性 | 第28-30页 |
| 2.3.2 结合自由能的分解 | 第30-39页 |
| 2.3.3 关键氨基酸残基对分析 | 第39-44页 |
| 2.3.4 结合作用力分析 | 第44-45页 |
| 2.4 小结 | 第45-46页 |
| 第三章ZAβ稳定Aβ16-40 单体的分子机理 | 第46-66页 |
| 3.1 引言 | 第46-47页 |
| 3.2 模拟系统与方法 | 第47-49页 |
| 3.2.1 模拟体系 | 第47-48页 |
| 3.2.2 分子动力学模拟过程 | 第48页 |
| 3.2.3 模拟参数设置 | 第48页 |
| 3.2.4 分析方法 | 第48-49页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第49-64页 |
| 3.3.1 结构稳定性 | 第49-51页 |
| 3.3.2 结合自由能分解 | 第51-58页 |
| 3.3.3 关键氨基酸残基作用对分析 | 第58-62页 |
| 3.3.4 结合作用力分析 | 第62-63页 |
| 3.3.5 结合模式 | 第63-64页 |
| 3.4 小结 | 第64-66页 |
| 第四章结论与展望 | 第66-68页 |
| 4.1 结论 | 第66-67页 |
| 4.2 展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
