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黄鳝基因组物理图谱的构建及染色体范围内的基因表达分析

本论文创新点第5-8页
中文摘要第8-10页
Abstract第10-11页
第一章 前言第12-36页
    1 物理作图第12-18页
        1.1 物理图谱与遗传图谱第12页
        1.2 物理图谱的分类第12-16页
        1.3 鱼类基因组物理图谱的研究现状第16-18页
    2 荧光原位杂交技术与基因定位第18-24页
        2.1 荧光原位杂交的发展第18-19页
        2.2 荧光原位杂交的基本原理与流程第19-22页
        2.3 荧光原位杂交在物理定位中的应用第22-24页
    3 黄鳝遗传学研究现状第24-34页
        3.1 性逆转现象第24-26页
        3.2 性逆转遗传机制研究第26-31页
        3.3 鱼类染色体组特征第31-34页
        3.4 黄鳝染色体组研究第34页
    4. 本研究的目的及意义第34-36页
第二章 黄鳝基因组物理图谱的构建第36-85页
    1. 引言第36-38页
    2. 材料方法第38-54页
        2.1 淋巴细胞中期染色体制片第38-40页
        2.2 减数分裂粗线期染色体制片第40-41页
        2.3 基因组提取第41-43页
        2.4 基因组BAC文库末端测序第43-44页
        2.5 荧光原位杂交探针的筛选第44-45页
        2.6 BAC质粒提取第45-48页
        2.7 混合池探针合成第48-50页
        2.8 荧光原位杂交第50-54页
        2.9 Scaffolds共线性预测第54页
    3. 结果分析第54-82页
        3.1 基因组物理图谱构建策略第54-77页
        3.2 基因组精细物理图谱的构建第77页
        3.3 染色体定位基因数第77-78页
        3.4 基因在染色体上的密度分布第78-80页
        3.5 一些性别发育相关基因的染色体定位第80-82页
    4 讨论第82-84页
        4.1 FISH技术在黄鳝基因组物理图谱构建中的改进第82-83页
        4.2 共线性预测对基因组拼装的指导意义第83页
        4.3 黄鳝基因组物理图谱的特点第83-84页
    5 本章小结第84-85页
第三章 染色体范围内基因表达分析第85-110页
    1. 引言第85-87页
    2. 材料方法第87-88页
    3. 结果分析第88-106页
        3.1 性腺表达基因在每条染色体上的分布第88-91页
        3.2 性腺差异表达基因在每条染色体上的分布第91-95页
        3.3 每条染色体基因表达水平在不同性腺中的比较分析第95-99页
        3.4 差异表达基因在染色体上的区域分布第99-103页
        3.5 差异表达基因密集区基因的功能分析第103-106页
    4. 讨论第106-108页
        4.1 染色体水平的表达与黄鳝性逆转过程的关系第106-107页
        4.2 差异基因密集区基因的功能和黄鳝性逆转过程的关系第107页
        4.3 黄鳝性别相关染色体区域的分析第107-108页
    5 本章小结第108-110页
第四章 论文总结第110-112页
参考文献第112-124页
致谢第124页

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