| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-24页 |
| 1.1 猪的脊椎数变异 | 第14-15页 |
| 1.2 猪脊椎数变异的选育意义 | 第15页 |
| 1.3 猪脊椎数的QTL研究进展 | 第15-20页 |
| 1.4 猪肋骨数变异候选基因LTBP2的研究进展 | 第20-23页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 猪肋骨数性状全基因组关联分析 | 第24-41页 |
| 2.1 试验材料 | 第24-26页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第24-25页 |
| 2.1.2 试验样品采集与数据收集 | 第25页 |
| 2.1.3 主要仪器设备、试验试剂和试验溶液的配制 | 第25-26页 |
| 2.2 试验方法 | 第26-31页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取和质量检测 | 第26-27页 |
| 2.2.2 SNP基因型判定 | 第27页 |
| 2.2.3 芯片数据的质量控制 | 第27-28页 |
| 2.2.4 芯片数据分析 | 第28-29页 |
| 2.2.5 共享单倍型分析 | 第29页 |
| 2.2.6 F2资源群体的基因组重测序 | 第29页 |
| 2.2.7 单倍型分析 | 第29-30页 |
| 2.2.8 基因注释及候选基因筛选 | 第30页 |
| 2.2.9 肋骨数候选基因VRTN的因果突变验证 | 第30-31页 |
| 2.3 试验结果 | 第31-37页 |
| 2.3.1 质量控制结果 | 第31页 |
| 2.3.2 猪肋骨数性状描述性统计 | 第31-32页 |
| 2.3.3 全基因组关联分析 | 第32-35页 |
| 2.3.4 共享单倍型分析将显著区间缩小至约952Kb | 第35页 |
| 2.3.5 F2资源群体的基因组重测序将显著区间缩小至约800Kb | 第35-36页 |
| 2.3.6 VRTN基因的因果突变验证 | 第36-37页 |
| 2.4 讨论 | 第37-40页 |
| 2.4.1 猪肋骨数性状的GWAS结果 | 第37-38页 |
| 2.4.2 候选基因筛选 | 第38-40页 |
| 2.5 本章小结 | 第40-41页 |
| 第三章 LTBP2的克隆与表达 | 第41-65页 |
| 3.1 试验材料 | 第41-42页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第41页 |
| 3.1.2 试验样品采集与数据收集 | 第41页 |
| 3.1.3 主要仪器设备、试验试剂 | 第41-42页 |
| 3.2 试验方法 | 第42-55页 |
| 3.2.1 LTBP2基因cDNA克隆 | 第42-51页 |
| 3.2.2 LTBP2基因的生物信息学分析 | 第51-52页 |
| 3.2.3 LTBP2基因的多态性探索及群体验证. | 第52-54页 |
| 3.2.4 LTBP2基因的组织表达谱分析 | 第54-55页 |
| 3.3 试验结果 | 第55-64页 |
| 3.3.1 LTBP2基因cDNA克隆 | 第55-57页 |
| 3.3.2 LTBP2基因的生物信息学分析 | 第57-60页 |
| 3.3.3 LTBP2基因的多态性探索及群体验证 | 第60-64页 |
| 3.4 讨论 | 第64页 |
| 3.5 本章小结 | 第64-65页 |
| 第四章 全文结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-74页 |
| 附录 | 第74-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 作者简历 | 第79页 |
