| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-26页 |
| 1.1 早期胚胎发育 | 第13页 |
| 1.2 谷胱甘肽 | 第13-16页 |
| 1.2.1 谷胱甘肽的生物合成及代谢 | 第13-14页 |
| 1.2.2 谷胱甘肽在胚胎发育中的作用 | 第14-16页 |
| 1.3 lncRNA | 第16-21页 |
| 1.3.1 lncRNA概述 | 第16-17页 |
| 1.3.2 lncRNA的生物学功能 | 第17-19页 |
| 1.3.3 lncRNA与胚胎发育 | 第19-21页 |
| 1.4 转录组测序在动物胚胎发育研究中的应用 | 第21-24页 |
| 1.4.1 第一代测序技术 | 第21页 |
| 1.4.2 第二代测序技术 | 第21-22页 |
| 1.4.3 第三代测序技术 | 第22页 |
| 1.4.4 RNA-Seq在动物胚胎发育研究中的应用 | 第22-24页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第24-26页 |
| 第二章 牛胚胎lncRNA测序 | 第26-37页 |
| 2.1 试验材料 | 第26-28页 |
| 2.1.1 主要仪器和设备 | 第26-27页 |
| 2.1.2 主要试剂和配制 | 第27-28页 |
| 2.2 试验方法 | 第28-30页 |
| 2.2.1 卵母细胞的采集和体外成熟培养 | 第28-29页 |
| 2.2.2 体外受精 | 第29页 |
| 2.2.3 胚胎的体外培养 | 第29页 |
| 2.2.4 样品收集及cDNA文库构建 | 第29页 |
| 2.2.5 测序数据处理 | 第29-30页 |
| 2.3 结果与分析 | 第30-35页 |
| 2.3.1 候选lncRNA的描述性统计 | 第30-32页 |
| 2.3.2 差异lncRNA的筛选 | 第32-33页 |
| 2.3.3 lncRNA表达的可视化 | 第33-35页 |
| 2.4 讨论 | 第35-37页 |
| 第三章 牛lncRNA转录组的鉴定和分析 | 第37-54页 |
| 3.1 试验材料 | 第37-38页 |
| 3.1.1 主要仪器和设备 | 第37页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第37-38页 |
| 3.2 试验方法 | 第38-41页 |
| 3.2.1 GO注释 | 第38页 |
| 3.2.2 KEGG注释 | 第38页 |
| 3.2.3 lncRNA-mRNA共表达分析及互作网络图的构建 | 第38-39页 |
| 3.2.4 lncRNA顺式作用靶基因的预测 | 第39页 |
| 3.2.5 引物设计与荧光定量PCR | 第39-41页 |
| 3.2.6 测序结果的定量验证 | 第41页 |
| 3.3 结果与分析 | 第41-50页 |
| 3.3.1 lncRNA反式作用靶基因的预测 | 第41-47页 |
| 3.3.2 lncRNA顺式作用靶基因的预测 | 第47-49页 |
| 3.3.3 测序结果与定量验证 | 第49-50页 |
| 3.4 讨论 | 第50-54页 |
| 第四章 lncRNA在细胞水平的功能初探 | 第54-62页 |
| 4.1 试验材料 | 第55页 |
| 4.1.1 主要仪器和设备 | 第55页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第55页 |
| 4.2 试验方法 | 第55-57页 |
| 4.2.1 牛颗粒细胞培养 | 第55-56页 |
| 4.2.2 引物设计与荧光定量PCR | 第56-57页 |
| 4.3 结果与分析 | 第57-60页 |
| 4.3.1 颗粒细胞的培养 | 第57页 |
| 4.3.2 lncRNA在颗粒细胞中的表达变化 | 第57-58页 |
| 4.3.3 GSH相关基因在颗粒细胞中的表达变化 | 第58-60页 |
| 4.4 讨论 | 第60-62页 |
| 第五章 全文结论 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 作者简历 | 第81页 |