摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-11页 |
中英文缩略词表(Abbreviation) | 第12-13页 |
1 文献综述 | 第13-24页 |
1.1 血红蛋白的组成与相关基因的研究概况 | 第13-15页 |
1.1.1 血红蛋白的组成与生理功能 | 第13页 |
1.1.2 HBB基因的进化 | 第13-14页 |
1.1.3 HBB基因的功能研究 | 第14-15页 |
1.2 黑素皮质素系统的组成与相关基因的研究概况 | 第15-20页 |
1.2.1 黑素皮质素系统的组成结构 | 第15-18页 |
1.2.2 MC5R基因的进化 | 第18-19页 |
1.2.3 MC5R基因的功能研究 | 第19-20页 |
1.3 藏系绵羊与蒙系绵羊的地理分布 | 第20-21页 |
1.4 SNP与蛋白质结构、功能的关系 | 第21-22页 |
1.5 基因对环境的适应性进化 | 第22-23页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第23-24页 |
2 材料与方法 | 第24-34页 |
2.1 试验材料 | 第24-27页 |
2.2 试验仪器及试剂 | 第27-28页 |
2.2.1 主要试剂 | 第27页 |
2.2.2 主要仪器 | 第27页 |
2.2.3 缓冲液的配制 | 第27-28页 |
2.3 试验方法 | 第28-34页 |
2.3.1 绵羊血样采集和DNA的提取 | 第28页 |
2.3.2 基因组DNA的检测 | 第28-29页 |
2.3.3 DNA混合池的构建 | 第29页 |
2.3.4 引物设计、合成及测序 | 第29-30页 |
2.3.5 基因频率计算、连锁分析及单倍型构建 | 第30页 |
2.3.6 SNP位点与海拔、温度的相关性分析 | 第30页 |
2.3.7 蛋白质结构预测 | 第30-31页 |
2.3.8 物种间进化分析 | 第31-32页 |
2.3.8.1 进化树构建 | 第31页 |
2.3.8.2 序列相似性比较 | 第31页 |
2.3.8.3 选择压力分析 | 第31页 |
2.3.8.4 基因正选择检验 | 第31-32页 |
2.3.9 种内群体间进化分析 | 第32-33页 |
2.3.10 性状关联分析 | 第33-34页 |
3 结果与分析 | 第34-76页 |
3.1 HBB基因变异及其遗传效应 | 第34-56页 |
3.1.1 HBB基因SNP位点的检测与分析 | 第34-42页 |
3.1.1.1 HBB基因SNP位点的检测、分型及其与编码蛋白的关系 | 第34-39页 |
3.1.1.2 HBB基因哈代-温伯格平衡检验与连锁图谱的构建 | 第39-41页 |
3.1.1.3 HBB基因的群体遗传学特征 | 第41-42页 |
3.1.2 HBB基因在物种间的进化 | 第42-46页 |
3.1.3 HBB基因在种内群体间的进化 | 第46-47页 |
3.1.4 HBB基因变异与海拔高度的关系 | 第47-50页 |
3.1.4.1 HBB基因变异与海拔高度的相关分析 | 第47-48页 |
3.1.4.2 HBB基因在海拔分组间的差异分析 | 第48-50页 |
3.1.4.3 HBB基因SNP位点单倍型构建与分析 | 第50页 |
3.1.5 HBB基因变异对湖羊产羔数的影响 | 第50-56页 |
3.1.5.1 湖羊群体中HBB基因的SNP位点信息 | 第50-52页 |
3.1.5.2 湖羊HBB基因SNP位点连锁图谱与单倍型的构建 | 第52-53页 |
3.1.5.3 湖羊HBB基因对产羔数的遗传效应 | 第53-56页 |
3.2 MC5R基因变异及其遗传效应 | 第56-76页 |
3.2.1 MC5R基因SNP位点的检测与分析 | 第56-63页 |
3.2.1.1 MC5R基因SNP位点的检测、分型及其与编码蛋白的关系 | 第56-60页 |
3.2.1.2 MC5R基因哈代-温伯格平衡检验与连锁图谱的构建 | 第60-62页 |
3.2.1.3 MC5R基因的群体遗传学特征 | 第62-63页 |
3.2.2 MC5R基因在物种间的进化 | 第63-67页 |
3.2.3 MC5R基因在种内群体间的进化 | 第67-68页 |
3.2.4 MC5R基因变异与环境温度的关系 | 第68-71页 |
3.2.4.1 MC5R基因变异与环境温度的相关分析 | 第68-69页 |
3.2.4.2 MC5R基因在温度分组间的差异分析 | 第69-70页 |
3.2.4.3 MC5R基因SNP位点单倍型构建与分析 | 第70-71页 |
3.2.5 MC5R基因变异对湖羊产羔数的影响 | 第71-76页 |
3.2.5.1 湖羊群体中MC5R基因的SNP位点信息 | 第71-72页 |
3.2.5.2 湖羊MC5R基因SNP位点连锁图谱与单倍型的构建 | 第72-73页 |
3.2.5.3 湖羊MC5R基因对产羔数的遗传效应 | 第73-76页 |
4 讨论 | 第76-83页 |
4.1 HBB基因的进化和遗传效应 | 第76-79页 |
4.1.1 HBB基因的进化分析 | 第76-77页 |
4.1.2 HBB基因变异与海拔高度的关系 | 第77-78页 |
4.1.3 HBB基因对湖羊产羔数的影响 | 第78-79页 |
4.2 MC5R基因的进化和遗传效应 | 第79-83页 |
4.2.1 MC5R基因的进化分析 | 第79-80页 |
4.2.2 MC5R基因变异与环境温度的关系 | 第80-81页 |
4.2.3 MC5R基因对湖羊产羔数的影响 | 第81-83页 |
5 结语 | 第83-84页 |
5.1 结论 | 第83页 |
5.2 进一步研究建议 | 第83-84页 |
参考文献 | 第84-93页 |
致谢 | 第93页 |