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绵羊HBB基因和MC5R基因的变异与遗传效应研究

摘要第8-10页
Abstract第10-11页
中英文缩略词表(Abbreviation)第12-13页
1 文献综述第13-24页
    1.1 血红蛋白的组成与相关基因的研究概况第13-15页
        1.1.1 血红蛋白的组成与生理功能第13页
        1.1.2 HBB基因的进化第13-14页
        1.1.3 HBB基因的功能研究第14-15页
    1.2 黑素皮质素系统的组成与相关基因的研究概况第15-20页
        1.2.1 黑素皮质素系统的组成结构第15-18页
        1.2.2 MC5R基因的进化第18-19页
        1.2.3 MC5R基因的功能研究第19-20页
    1.3 藏系绵羊与蒙系绵羊的地理分布第20-21页
    1.4 SNP与蛋白质结构、功能的关系第21-22页
    1.5 基因对环境的适应性进化第22-23页
    1.6 本研究的目的和意义第23-24页
2 材料与方法第24-34页
    2.1 试验材料第24-27页
    2.2 试验仪器及试剂第27-28页
        2.2.1 主要试剂第27页
        2.2.2 主要仪器第27页
        2.2.3 缓冲液的配制第27-28页
    2.3 试验方法第28-34页
        2.3.1 绵羊血样采集和DNA的提取第28页
        2.3.2 基因组DNA的检测第28-29页
        2.3.3 DNA混合池的构建第29页
        2.3.4 引物设计、合成及测序第29-30页
        2.3.5 基因频率计算、连锁分析及单倍型构建第30页
        2.3.6 SNP位点与海拔、温度的相关性分析第30页
        2.3.7 蛋白质结构预测第30-31页
        2.3.8 物种间进化分析第31-32页
            2.3.8.1 进化树构建第31页
            2.3.8.2 序列相似性比较第31页
            2.3.8.3 选择压力分析第31页
            2.3.8.4 基因正选择检验第31-32页
        2.3.9 种内群体间进化分析第32-33页
        2.3.10 性状关联分析第33-34页
3 结果与分析第34-76页
    3.1 HBB基因变异及其遗传效应第34-56页
        3.1.1 HBB基因SNP位点的检测与分析第34-42页
            3.1.1.1 HBB基因SNP位点的检测、分型及其与编码蛋白的关系第34-39页
            3.1.1.2 HBB基因哈代-温伯格平衡检验与连锁图谱的构建第39-41页
            3.1.1.3 HBB基因的群体遗传学特征第41-42页
        3.1.2 HBB基因在物种间的进化第42-46页
        3.1.3 HBB基因在种内群体间的进化第46-47页
        3.1.4 HBB基因变异与海拔高度的关系第47-50页
            3.1.4.1 HBB基因变异与海拔高度的相关分析第47-48页
            3.1.4.2 HBB基因在海拔分组间的差异分析第48-50页
            3.1.4.3 HBB基因SNP位点单倍型构建与分析第50页
        3.1.5 HBB基因变异对湖羊产羔数的影响第50-56页
            3.1.5.1 湖羊群体中HBB基因的SNP位点信息第50-52页
            3.1.5.2 湖羊HBB基因SNP位点连锁图谱与单倍型的构建第52-53页
            3.1.5.3 湖羊HBB基因对产羔数的遗传效应第53-56页
    3.2 MC5R基因变异及其遗传效应第56-76页
        3.2.1 MC5R基因SNP位点的检测与分析第56-63页
            3.2.1.1 MC5R基因SNP位点的检测、分型及其与编码蛋白的关系第56-60页
            3.2.1.2 MC5R基因哈代-温伯格平衡检验与连锁图谱的构建第60-62页
            3.2.1.3 MC5R基因的群体遗传学特征第62-63页
        3.2.2 MC5R基因在物种间的进化第63-67页
        3.2.3 MC5R基因在种内群体间的进化第67-68页
        3.2.4 MC5R基因变异与环境温度的关系第68-71页
            3.2.4.1 MC5R基因变异与环境温度的相关分析第68-69页
            3.2.4.2 MC5R基因在温度分组间的差异分析第69-70页
            3.2.4.3 MC5R基因SNP位点单倍型构建与分析第70-71页
        3.2.5 MC5R基因变异对湖羊产羔数的影响第71-76页
            3.2.5.1 湖羊群体中MC5R基因的SNP位点信息第71-72页
            3.2.5.2 湖羊MC5R基因SNP位点连锁图谱与单倍型的构建第72-73页
            3.2.5.3 湖羊MC5R基因对产羔数的遗传效应第73-76页
4 讨论第76-83页
    4.1 HBB基因的进化和遗传效应第76-79页
        4.1.1 HBB基因的进化分析第76-77页
        4.1.2 HBB基因变异与海拔高度的关系第77-78页
        4.1.3 HBB基因对湖羊产羔数的影响第78-79页
    4.2 MC5R基因的进化和遗传效应第79-83页
        4.2.1 MC5R基因的进化分析第79-80页
        4.2.2 MC5R基因变异与环境温度的关系第80-81页
        4.2.3 MC5R基因对湖羊产羔数的影响第81-83页
5 结语第83-84页
    5.1 结论第83页
    5.2 进一步研究建议第83-84页
参考文献第84-93页
致谢第93页

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