| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 中英文缩略词表(Abbreviation) | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第13-25页 |
| 1.1 EPAS1基因的研究进展 | 第13-21页 |
| 1.1.1 低氧诱导因子概况 | 第13-14页 |
| 1.1.2 EPAS1的分布和表达调节 | 第14-15页 |
| 1.1.3 EPAS1的靶基因及生理作用 | 第15-18页 |
| 1.1.4 EPAS1与高原低氧适应性 | 第18-20页 |
| 1.1.5 HIFα进化及功能分化 | 第20-21页 |
| 1.2 分子水平的自然选择检验 | 第21-23页 |
| 1.2.1 基于等位基因频率的方法 | 第21-22页 |
| 1.2.2 基于连锁不平衡的方法 | 第22页 |
| 1.2.3 基于群体分化的方法 | 第22-23页 |
| 1.2.4 基于种间差异度的方法 | 第23页 |
| 1.3 多羔氧胁迫与高海拔低氧胁迫对基因进化的相似性 | 第23-24页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第24-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-34页 |
| 2.1 试验材料 | 第25-28页 |
| 2.1.1 绵羊样品及分布 | 第25-26页 |
| 2.1.2 物种EPAS1基因编码序列及登录号 | 第26-28页 |
| 2.2 试验仪器及试剂 | 第28-29页 |
| 2.2.1 试验主要试剂 | 第28页 |
| 2.2.2 试验主要仪器 | 第28-29页 |
| 2.2.3 试验常用缓冲液的配制 | 第29页 |
| 2.3 试验方法 | 第29-34页 |
| 2.3.1 绵羊血样DNA的提取与质量检测 | 第29-30页 |
| 2.3.2 DNA混合池构建 | 第30页 |
| 2.3.3 引物的设计、合成及测序 | 第30-31页 |
| 2.3.4 基因频率计算及连锁分析 | 第31页 |
| 2.3.5 产羔数关联分析 | 第31-32页 |
| 2.3.6 等位基因频率差异分析 | 第32页 |
| 2.3.7 蛋白质二级结构及三级结构预测 | 第32页 |
| 2.3.8 EPAS1基因的种间进化及进化驱动力分析 | 第32-33页 |
| 2.3.9 群体内进化分析 | 第33-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-53页 |
| 3.1 EPAS1基因物种间的进化分析 | 第34-35页 |
| 3.1.1 种间进化树的构建 | 第34-35页 |
| 3.1.2 正选择检验与分析 | 第35页 |
| 3.2 EPAS1基因变异与海拔的关系 | 第35-47页 |
| 3.2.1 EPAS1基因变异的检测 | 第35-37页 |
| 3.2.2 等位基因频率及基因型频率 | 第37-40页 |
| 3.2.3 哈代温伯格平衡检验及连锁图谱 | 第40-43页 |
| 3.2.4 EPAS1基因变异与海拔高度的相关分析 | 第43-44页 |
| 3.2.5 等位基因频率在高中低海拔绵羊群体间的差异分析 | 第44-46页 |
| 3.2.6 绵羊EPAS1基因的群体遗传多样性 | 第46-47页 |
| 3.3 EPAS1基因变异与其蛋白结构关系分析 | 第47-48页 |
| 3.4 绵羊EPAS1基因在绵羊种内的进化分析 | 第48-50页 |
| 3.5 EPAS1基因变异与产羔数关联分析 | 第50-53页 |
| 4 讨论 | 第53-57页 |
| 4.1 EPAS1基因的种间进化分析 | 第53-54页 |
| 4.2 绵羊EPAS1基因进化和低氧的关系 | 第54-55页 |
| 4.3 EPAS1基因变异与功能 | 第55-57页 |
| 5 结论和建议 | 第57-58页 |
| 5.1 结论 | 第57页 |
| 5.2 进一步研究建议 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-68页 |
| 名词索引 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
