| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 前言 | 第12-24页 |
| 1.1 斑点叉尾鮰简介 | 第12页 |
| 1.2 miRNA简介 | 第12-18页 |
| 1.2.1 miRNA概况 | 第12页 |
| 1.2.2 miRNA产生机制 | 第12-13页 |
| 1.2.3 miRNA检测方法 | 第13-14页 |
| 1.2.4 miRNA在人和动物抗病免疫方面的研究 | 第14-18页 |
| 1.3 鱼类miRNA研究进展 | 第18-22页 |
| 1.3.1 鱼类miRNA的寻找及鉴定 | 第18-21页 |
| 1.3.2 鱼类免疫相关miRNA研究 | 第21-22页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第22-24页 |
| 第二章 斑点叉尾鮰已知免疫相关miRNA及细胞因子的表达变化 | 第24-40页 |
| 2.1 前言 | 第24-26页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第26-31页 |
| 2.2.1 实验材料 | 第26页 |
| 2.2.2 样品采集 | 第26页 |
| 2.2.3 样品总RNA的提取及质量检测 | 第26-27页 |
| 2.2.4 组织中miRNA鉴定及表达 | 第27-29页 |
| 2.2.5 组织中免疫相关细胞因子的表达 | 第29-31页 |
| 2.3 结果与分析 | 第31-38页 |
| 2.3.1 样品总RNA质量检测 | 第31-32页 |
| 2.3.2 各组织样品的miRNA的鉴定及表达 | 第32-35页 |
| 2.3.3 各组织中免疫因子的表达情况 | 第35-38页 |
| 2.4 讨论 | 第38-39页 |
| 2.5 小结 | 第39-40页 |
| 第三章 拟态弧菌感染前后斑点叉尾鮰miRNA表达谱构建及生物信息学分析 | 第40-74页 |
| 3.1 前言 | 第40-41页 |
| 3.2 实验材料与方法 | 第41-46页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第41页 |
| 3.2.2 拟态弧菌攻毒实验 | 第41页 |
| 3.2.3 样品总RNA的提取及质量检测 | 第41-42页 |
| 3.2.4 Solexa高通量测序 | 第42-43页 |
| 3.2.5 小RNA文库生物信息学分析流程 | 第43-44页 |
| 3.2.6 数据处理及小RNA文库质量评估 | 第44页 |
| 3.2.7 标准信息分析 | 第44-45页 |
| 3.2.8 已知mi RNA分析 | 第45页 |
| 3.2.9 新mi RNA分析 | 第45-46页 |
| 3.2.10 统计分析 | 第46页 |
| 3.3 结果与分析 | 第46-71页 |
| 3.3.1 拟态弧菌感染斑点叉尾鮰实验 | 第46页 |
| 3.3.2 总RNA质量 | 第46-47页 |
| 3.3.3 Solexa测序结果分析 | 第47-52页 |
| 3.3.4 标准信息分析 | 第52-57页 |
| 3.3.4.1 基因组比对结果 | 第52-53页 |
| 3.3.4.2 小RNA分类注释 | 第53-57页 |
| 3.3.5 已知miRNA分析 | 第57-64页 |
| 3.3.6 新mi RNA分析 | 第64-71页 |
| 3.4 讨论 | 第71-73页 |
| 3.4.1 拟态弧菌攻毒斑点叉尾鮰半致死浓度的确定 | 第71-72页 |
| 3.4.2 小RNA文库的生物信息学分析 | 第72页 |
| 3.4.3 显著性差异表达mi RNA对鱼类免疫调控的影响 | 第72-73页 |
| 3.5 小结 | 第73-74页 |
| 全文结论 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-84页 |
| 附录 | 第84-85页 |
