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草鱼脂肪肝相关基因和miRNAs的差异表达及miR-33的靶基因验证

摘要第4-7页
Abstract第7-9页
缩略语中英文对照第10-15页
第一章 前言第15-25页
    1.1 影响鱼类肝脏脂质蓄积的因素第15-17页
        1.1.1 营养因素第15-16页
        1.1.2 生理因素第16页
        1.1.3 物种因素第16页
        1.1.4 环境因素第16-17页
        1.1.5 遗传与突变第17页
    1.2 鱼类形成脂肪肝的分子机制第17-21页
        1.2.1 鱼类脂肪肝的鉴别第17页
        1.2.2 鱼类脂肪肝的发生机制第17-18页
        1.2.3 影响鱼类脂肪肝形成的关键基因第18-21页
    1.3 miRNAs在动物脂肪代谢中的研究概况第21-23页
        1.3.1 mi RNAs的发现第21页
        1.3.2 mi RNAs基本生物学特性、调控机制第21页
        1.3.3 mi RNAs调控动物脂类代谢第21-23页
    1.4 本研究的目的及意义第23-25页
第二章 高糖高脂饲料对草鱼生长及肝脏脂肪蓄积的影响第25-35页
    2.1 引言第25页
    2.2 材料第25-26页
        2.2.1 主要器具第25页
        2.2.2 主要试剂配制第25-26页
    2.3 方法第26-30页
        2.3.1 制作实验饲料第26-27页
        2.3.2 饲养与管理第27页
        2.3.3 样品采集与贮存第27-28页
        2.3.4 生长指标及生物学特征参数评价第28页
        2.3.5 血清生化指标的测定第28-29页
        2.3.6 肝脏组织石蜡切片的制作第29-30页
    2.4 结果与分析第30-33页
        2.4.1 高糖高脂饲料对草鱼生长及脂肪蓄积的影响第30-31页
        2.4.2 高糖高脂饲料对草鱼血清生化指标和肝脏组织的影响第31-33页
    2.5 讨论第33-35页
第三章 高通量测序检测高糖高脂饲料对草鱼相关mi RNAs表达的影响第35-45页
    3.1 引言第35页
    3.2 材料与方法第35-37页
        3.2.1 制作实验饲料第35页
        3.2.2 饲养与管理第35页
        3.2.3 样品采集与贮存第35页
        3.2.4 提取样品总RNA第35-37页
        3.2.5 小RNA分离第37页
    3.3 结果与分析第37-43页
        3.3.1 肝脏总RNA提取结果第37-38页
        3.3.2 高通量测序小RNA长度分析结果第38-40页
        3.3.3 小RNA测序数据注释结果第40-41页
        3.3.4 肝脏已知mi RNAs的鉴定与分析第41页
        3.3.5 mi RNAs转录组测序的差异表达结果第41-43页
    3.4 讨论第43-45页
第四章 高糖高脂饲料对草鱼脂肪代谢关键基因和mi RNAs表达的影响第45-57页
    4.1 引言第45页
    4.2 主要试剂第45-46页
    4.3 方法第46-50页
        4.3.1 制作实验饲料第46页
        4.3.2 饲养与管理第46页
        4.3.3 样品采集与贮存第46页
        4.3.4 提取样品总RNA第46页
        4.3.5 第一链cDNA合成第46-47页
        4.3.6 脂代谢相关基因和mi RNAs表达量的检测第47-50页
        4.3.7 数据统计与分析第50页
    4.4 结果与分析第50-54页
        4.4.1 标准曲线第50-53页
        4.4.2 高糖高脂饲料对草鱼脂肪代谢相关基因表达的影响第53页
        4.4.3 高糖高脂饲料对草鱼mi RNAs表达的影响第53-54页
    4.5 讨论第54-57页
第五章 草鱼SREBP-1 基因的克隆和miRNA在其 3'UTR区作用靶位点的预测第57-73页
    5.1 引言第57页
    5.2 材料第57-58页
        5.2.1 实验用鱼第57页
        5.2.2 主要试剂第57-58页
        5.2.3 试剂配制第58页
        5.2.4 主要仪器第58页
    5.3 方法第58-63页
        5.3.1 肝脏总RNA提取第58页
        5.3.2 第一链cDNA合成第58页
        5.3.3 SREBP-1 cDNA中间片段的合成第58-61页
        5.3.4 SREBP-1 cDNA 3'端基因克隆第61-62页
        5.3.5 序列分析第62页
        5.3.6 草鱼SREBP-1 组织表达分析第62-63页
        5.3.7 预测草鱼SREBP-13'UTR区的miRNA作用靶位点第63页
    5.4 结果第63-70页
        5.4.1 草鱼SREBP-1 核苷酸序列分析和氨基酸序列的一级结构第63-67页
        5.4.2 bHLH-zip结构域的二级结构及理化性质分析第67-68页
        5.4.3 氨基酸序列的系统进化树分析第68-69页
        5.4.4 草鱼SREBP-1 基因组织表达分析第69-70页
        5.4.5 SREBP-13'UTR区miRNA作用靶位点的预测第70页
    5.5 讨论第70-73页
第六章 SREBP-1 基因 3'UTR双荧光素酶报告载体的构建第73-81页
    6.1 引言第73页
    6.2 材料第73-74页
        6.2.1 实验鱼第73页
        6.2.2 主要试剂第73-74页
        6.2.3 主要仪器第74页
    6.3 方法第74-76页
        6.3.1 肝脏总RNA提取第74页
        6.3.2 靶基因SREBP-13'UTR的扩增第74页
        6.3.3 靶基因SREBP-13'UTR荧光素酶报告基因载体的构建第74-75页
        6.3.4 miR-33 mimics的合成第75页
        6.3.5 双荧光素酶表达载体和mi R-33 mimics共转染细胞系验证候选靶基因第75-76页
    6.4 结果与分析第76-79页
        6.4.1 靶基因SREBP-13'UTR的扩增结果第76-77页
        6.4.2 靶基因SREBP-13'UTR荧光素酶报告基因载体的构建第77-78页
        6.4.3 双荧光素酶表达载体转染C2C12细胞验证候选靶基因第78-79页
    6.5 讨论第79-81页
总结与展望第81-83页
参考文献第83-97页
致谢第97-99页
攻读学位期间学术业绩第99-101页

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