| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 绪论 | 第14-28页 |
| 1.1 miRNAs简介 | 第14-20页 |
| 1.1.1 miRNAs的发现 | 第15页 |
| 1.1.2 miRNAs的生物合成 | 第15-17页 |
| 1.1.3 miRNAs的特征 | 第17页 |
| 1.1.4 miRNAs异构体与碱基变异 | 第17页 |
| 1.1.5 miRNAs作用机制 | 第17-18页 |
| 1.1.6 miRNAs与siRNAs的异同 | 第18-19页 |
| 1.1.7 miRNAs鉴定及检测方法 | 第19-20页 |
| 1.2 鹿茸 | 第20-25页 |
| 1.2.1 鹿茸的生长发育 | 第20-21页 |
| 1.2.2 鹿茸的组织学特征 | 第21-23页 |
| 1.2.3 鹿茸的组织发生 | 第23页 |
| 1.2.4 鹿茸再生的研究 | 第23-25页 |
| 1.3 miRNAs与再生 | 第25-27页 |
| 1.3.1 miRNAs调控软骨和皮肤发育 | 第25-26页 |
| 1.3.2 miRNAs调控鹿茸细胞的增殖 | 第26页 |
| 1.3.3 miRNAs与再生的研究进展 | 第26-27页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第27-28页 |
| 2 鹿茸软骨与茸皮组织small RNA Solexa高通量测序 | 第28-41页 |
| 2.1 实验材料 | 第28-29页 |
| 2.1.1 实验动物样品采集 | 第28页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第28页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第28-29页 |
| 2.1.4 主要试剂配制 | 第29页 |
| 2.1.5 参考数据库 | 第29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-33页 |
| 2.2.1 Total RNA提取 | 第29-30页 |
| 2.2.2 Total RNA质量检测 | 第30-31页 |
| 2.2.3 构建RNA混池 | 第31页 |
| 2.2.4 构建small RNAs文库 | 第31页 |
| 2.2.5 Small RNA高通量测序 | 第31-33页 |
| 2.3 结果与分析 | 第33-38页 |
| 2.3.1 Total RNA质量检测 | 第33页 |
| 2.3.2 Solexa测序结果及small RNA序列分析 | 第33-38页 |
| 2.4 讨论 | 第38-39页 |
| 2.4.1 miRNAs及实验动物 | 第38-39页 |
| 2.4.2 Small RNA高通量测序 | 第39页 |
| 2.5 本章小结 | 第39-41页 |
| 3 鹿茸软骨和茸皮组织miRNAs测序结果鉴定与特征分析 | 第41-54页 |
| 3.1 试验材料 | 第41页 |
| 3.1.1 主要数据库 | 第41页 |
| 3.1.2 主要分析软件 | 第41页 |
| 3.2 实验方法 | 第41-42页 |
| 3.2.1 构建数据库 | 第41页 |
| 3.2.2 miRNAs序列分类 | 第41-42页 |
| 3.2.3 miRNAs前体二级结构预测 | 第42页 |
| 3.3 结果与分析 | 第42-51页 |
| 3.3.1 鹿茸miRNAs测序数据分析 | 第43-44页 |
| 3.3.2 鹿茸软骨和茸皮中保守miRNAs的鉴定 | 第44-48页 |
| 3.3.3 IsomiRNAs | 第48-49页 |
| 3.3.4 鹿茸软骨和茸皮新miRNAs的预测 | 第49-50页 |
| 3.3.5 miRNAs二级结构预测结果 | 第50-51页 |
| 3.4 讨论 | 第51-53页 |
| 3.4.1 鹿茸miRNAs表达谱分析 | 第51页 |
| 3.4.2 鹿茸保守miRNAs和新预测的miRNAs | 第51-52页 |
| 3.4.3 鹿茸miRNAs序列的多样性 | 第52-53页 |
| 3.4.4 miRNAs二级结构预测 | 第53页 |
| 3.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 4 鹿茸软骨和茸皮组织miRNAs表达差异 | 第54-68页 |
| 4.1 主要数据库及软件 | 第54页 |
| 4.1.1 主要数据库 | 第54页 |
| 4.1.2 分析软件 | 第54页 |
| 4.2 实验方法 | 第54-56页 |
| 4.2.1 miRNAs拷贝数差异比较 | 第54页 |
| 4.2.2 miRNAs靶基因预测 | 第54-55页 |
| 4.2.3 miRNAs预测靶基因功能注释 | 第55-56页 |
| 4.3 结果与分析 | 第56-63页 |
| 4.3.1 miRNAs拷贝数差异 | 第56-57页 |
| 4.3.2 miRNAs靶基因预测结果 | 第57-58页 |
| 4.3.3 GO富集 | 第58-60页 |
| 4.3.4 KEGG通路分析 | 第60-63页 |
| 4.4 讨论 | 第63-66页 |
| 4.4.1 miRNAs拷贝数差异 | 第63页 |
| 4.4.2 miRNAs的靶基因预测分析 | 第63-64页 |
| 4.4.3 鹿茸软骨和茸皮miRNAs靶基因功能注释异同 | 第64-66页 |
| 4.5 本章小结 | 第66-68页 |
| 5 Real-time PCR验证高通量测序结果 | 第68-77页 |
| 5.1 材料与方法 | 第68-72页 |
| 5.1.1 实验动物组织样品 | 第68页 |
| 5.1.2 主要仪器和试剂 | 第68页 |
| 5.1.3 RT-PCR验证miRNAs | 第68-72页 |
| 5.2 结果 | 第72-74页 |
| 5.2.1 熔解曲线和扩增曲线分析 | 第72-73页 |
| 5.2.2 RT-PCR试验结果分析 | 第73-74页 |
| 5.3 讨论 | 第74-76页 |
| 5.3.1 RT-PCR验证miRNAs | 第74-75页 |
| 5.3.2 鹿茸软骨和茸皮miRNAs组织表达特异性与差异性 | 第75-76页 |
| 5.4 本章小结 | 第76-77页 |
| 6 结论 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-93页 |
| 附录 | 第93-99页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-102页 |
| 附件 | 第102页 |
