| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第13页 |
| 1.2 研究现状 | 第13-14页 |
| 1.3 研究内容 | 第14-15页 |
| 1.4 本文结构安排 | 第15-16页 |
| 第二章 理论基础与相关技术 | 第16-22页 |
| 2.1 生物信息学理论基础 | 第16-17页 |
| 2.1.1 生物信息学 | 第16页 |
| 2.1.2 基因本体 | 第16-17页 |
| 2.2 基因相似度 | 第17-18页 |
| 2.3 数据挖掘 | 第18-19页 |
| 2.4 主题模型 | 第19-20页 |
| 2.4.1 主题模型概述 | 第19页 |
| 2.4.2 LDA与BTM模型 | 第19-20页 |
| 2.5 本章小结 | 第20-22页 |
| 第三章 基于本体的基因相似度计算 | 第22-28页 |
| 3.1 基于图形的方法 | 第22-23页 |
| 3.2 基于向量的方法 | 第23页 |
| 3.3 基于集合的方法 | 第23-24页 |
| 3.4 基于术语的方法 | 第24-27页 |
| 3.4.1 基于边的方法 | 第24-25页 |
| 3.4.2 基于节点的方法 | 第25-26页 |
| 3.4.3 基于混合的方法 | 第26-27页 |
| 3.5 本章小结 | 第27-28页 |
| 第四章 基于主题模型的基因语义相似度计算 | 第28-37页 |
| 4.1 算法基本思想及主要步骤 | 第28-30页 |
| 4.1.1 主要步骤 | 第28-30页 |
| 4.1.2 SSGTLDA模型和SSGTBTM模型对比 | 第30页 |
| 4.2 预处理 | 第30-32页 |
| 4.3 生成向量 | 第32-35页 |
| 4.3.1 SSGTLDA模型的向量生成过程 | 第32-34页 |
| 4.3.2 SSGTBTM模型的向量生成过程 | 第34-35页 |
| 4.4 计算向量相似度 | 第35-36页 |
| 4.5 计算基因相似度 | 第36页 |
| 4.6 本章小结 | 第36-37页 |
| 第五章 实验设计与结果分析 | 第37-47页 |
| 5.1 实验环境 | 第37页 |
| 5.2 实验设计 | 第37-40页 |
| 5.2.1 实验数据 | 第37-38页 |
| 5.2.2 实验方案 | 第38-39页 |
| 5.2.3 实验评价方式 | 第39-40页 |
| 5.3 实验结果与分析 | 第40-46页 |
| 5.3.1 术语对实验结果分析 | 第40-41页 |
| 5.3.2 蛋白质对实验结果分析 | 第41-46页 |
| 5.4 本章小结 | 第46-47页 |
| 第六章 总结与展望 | 第47-49页 |
| 6.1 总结 | 第47页 |
| 6.2 展望 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 攻读硕士学位期间科研成果 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |