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拟南芥CPSF30基因克隆及其在NO3-信号调控中的功能鉴定研究

中文摘要第11-14页
Abstract第14-16页
1 前言第17-37页
    1.1 素的重要性及其对植物生长发育的影响第17-19页
        1.1.1 氮素的重要性第17页
        1.1.2 氮素对植物生长发育的影响第17-18页
        1.1.3 过量施用氮肥的危害第18-19页
    1.2 植物吸收利用氮素的分子机制第19-26页
        1.2.1 植物吸收NO_3~-的生理机制第19-24页
            1.2.2.1 NRT1家族转运蛋白系统第20-22页
            1.2.2.2 NRT2家族转运蛋白系统第22-23页
            1.2.2.3 SLAC家族转运蛋白第23页
            1.2.2.4 CLC家族转运蛋白第23-24页
        1.2.3 植物对NH_4~+的吸收第24-25页
        1.2.4 NO_3~-在植物体内的同化第25-26页
    1.3 植物中NO_3~-调控基因的研究第26-34页
        1.3.1 植物中在长期效应中起作用的基因第26-28页
        1.3.2 植物中在短期效应中起作用的基因第28-34页
            1.3.2.1 NRT1.1基因对NO_3~-调控的重要作用第28-30页
            1.3.2.2 CIPK8基因是一个NO_3~-正调控基因第30页
            1.3.2.3 NLP基因家族对NO_3~-调控非常重要第30-31页
            1.3.2.4 LBD37/38/39在NO_3~-调控中的作用第31-32页
            1.3.2.5 NRG2基因在NO_3~-调控中的重要作用第32-33页
            1.3.2.6 利用系统生物学找到的NO_3~-调控基因第33-34页
    1.4 拟南芥NO_3~-调控基因突变体的筛选系统第34-35页
    1.5 本研究的目的及意义第35-37页
2 材料与方法第37-60页
    2.1 实验材料第37-43页
        2.1.1 植物材料第37页
        2.1.2 菌株与质粒第37页
        2.1.3 酶与试剂第37-41页
            2.1.3.1 酶第37页
            2.1.3.2 试剂第37-38页
            2.1.3.3 试剂盒第38页
            2.1.3.4 溶液、缓冲液及培养基配方第38-41页
        2.1.4 仪器与设备第41-42页
        2.1.5 引物第42-43页
    2.2 实验方法第43-60页
        2.2.1 植物材料准备及拟南芥植株的生长第43-46页
            2.2.1.1 培养基的配制第43-44页
            2.2.1.2 种子的消毒处理第44页
            2.2.1.3 拟南芥种子的竖直培养第44页
            2.2.1.4 六孔板培养法第44-45页
            2.2.1.5 Magenta Box培养法第45页
            2.2.1.6 植株的正常生长第45页
            2.2.1.7 拟南芥的杂交第45-46页
        2.2.2 拟南芥基因组的提取第46页
        2.2.3 拟南芥NO_3~-调控基因突变体筛选系统的EMS诱变第46-47页
            2.2.3.1 EMS诱变第46-47页
            2.2.3.2 荧光筛选第47页
        2.2.4 图位克隆第47-48页
            2.2.4.1 材料的挑选第47页
            2.2.4.2 初步定位第47-48页
            2.2.4.3 精细定位第48页
            2.2.4.4 PCR扩增第48页
            2.2.4.5 通过测序确定基因第48页
        2.2.5 构建转基因株系表达载体第48-54页
            2.2.5.1 植物总RNA的提取(试剂盒法)第49页
            2.2.5.2 反转录第49-50页
            2.2.5.3 Phusion PCR扩增第50页
            2.2.5.4 PCR产物回收(试剂盒法)第50-51页
            2.2.5.5 TOPO连接反应第51页
            2.2.5.6 大肠杆菌感受态的制备第51-52页
            2.2.5.7 大肠杆菌感受态细胞的转化第52页
            2.2.5.8 质粒提取第52-53页
            2.2.5.9 DNA序列的测定第53页
            2.2.5.10 LR反应第53页
            2.2.5.11 质粒DNA的酶切鉴定第53-54页
        2.2.6 农杆菌介导的拟南芥的遗传转化第54-55页
            2.2.6.1 根癌农杆菌GV3101感受态细胞的制备第54页
            2.2.6.2 表达载体转化农杆菌第54-55页
            2.2.6.3 拟南芥的转化第55页
        2.2.7 qPCR实验技术第55-56页
        2.2.8 GUS染色分析第56页
        2.2.9 硝态氮含量测定第56-57页
            2.2.9.1 标准曲线的制作第57页
            2.2.9.2 样品中硝态氮含量的测定第57页
        2.2.10 NR活性的测定(试剂盒法)第57-58页
            2.2.10.1 测定原理第57-58页
            2.2.10.2 样品的测定与NR活性计算第58页
        2.2.11 氨基酸含量的测定(试剂盒法)第58-59页
            2.2.11.1 测定原理第58页
            2.2.11.2 样品中氨基酸的提取与测定第58-59页
        2.2.12 统计学方法第59-60页
3 结果与分析第60-92页
    3.1 拟南芥NO_3~-响应缺陷型突变体Mut65的分离与CPSF30基因的图位克隆第60-63页
        3.1.1 拟南芥Mut65突变体的荧光表型第60页
        3.1.2 CPSF30基因的图位克隆及其基因结构第60-62页
        3.1.3 cpsf30-2突变体的表型是由CPSF30-L基因突变造成第62-63页
    3.2 CPSF30基因对NO_3~-调控功能的验证第63-66页
        3.2.1 cpsf30-2突变体中受NO_3~-诱导基因的表达第63-64页
        3.2.2 氮饥饿条件下cpsf30-2突变体中受NO_3~-诱导基因的表达第64-65页
        3.2.3 CPSF30基因对氮素的响应第65-66页
    3.3 CPSF30基因的组织表达与亚细胞定位第66-70页
        3.3.1 CPSF30基因的组织表达第67-68页
            3.3.1.1 qPCR检测CPSF30基因在各部位的表达第67页
            3.3.1.2 GUS染色分析第67-68页
        3.3.2 CPSF30蛋白的亚细胞定位第68-70页
            3.3.2.1 CPSF30蛋白在拟南芥稳定转化植株的表达第68-69页
            3.3.2.2 CPSF30蛋白在烟草表皮细胞的瞬时转化表达第69-70页
    3.4 cpsf30-2突变体的NO_3~-含量分析第70-76页
        3.4.1 cpsf30-2突变体的NO_3~-含量第70页
        3.4.2 cpsf30-2突变体对NO_3~-的吸收第70-71页
        3.4.3 cpsf30-2突变体中的转运基因的表达水平第71-74页
        3.4.4 cpsf30-2突变体中同化基因的表达水平第74-75页
        3.4.5 cpsf30-2突变体的NR活性及氨基酸含量分析第75-76页
    3.5 CPSF30与其他NO_3~-调控基因之间的调控关系第76-87页
        3.5.1 CPSF30与NRT1.1基因之间的调控关系第76-82页
            3.5.1.1 CPSF30与NRT1.1基因之间的调控关系第76-77页
            3.5.1.2 cpsf30-2 chl1-13双突变体中荧光表型第77-79页
            3.5.1.3 cpsf30-2 chl1-13双突变体中NO_3~-响应基因的表达第79页
            3.5.1.4 NRT1.1/cpsf30-2互补株系中荧光表型第79-80页
            3.5.1.5 NRT1.1/cpsf30-2互补株系中的NO_3~-含量第80-81页
            3.5.1.6 NRT1.1/cpsf30-2互补株系中的NO_3~-诱导基因表达第81-82页
        3.5.2 CPSF30与NLP7基因之间的调控关系第82-85页
            3.5.2.1 CPSF30与NLP7基因之间的调控关系第82-83页
            3.5.2.2 cpsf30-2 nlp7双突变体中荧光表型第83-85页
            3.5.2.3 cpsf30-2 nlp7-4双突变体中NO_3~-响应基因的表达第85页
        3.5.3 CPSF30与CIPK8、CIPK23基因之间的调控关系第85-86页
        3.5.4 CPSF30与其他几个NO_3~-调控基因之间的关系第86-87页
    3.6 cpsf30-2突变体与野生型的转录组分析第87-92页
        3.6.1 测序数据质量评估第87-88页
        3.6.2 差异表达基因统计第88-89页
        3.6.3 差异表达基因的GO分析第89-92页
4 讨论第92-95页
5 结论第95-96页
参考文献第96-109页
致谢第109-110页
攻读学位期间发表的论文及成果第110页

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