| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-17页 |
| ·后基因组时代的生物信息学 | 第8页 |
| ·未知蛋白的功能分析 | 第8-13页 |
| ·生物信息学的方法分析未知蛋白功能 | 第9-11页 |
| ·实验方法分析未知蛋白功能 | 第11-13页 |
| ·集胞藻PCC6803——蓝细菌的模式菌株 | 第13-16页 |
| ·集胞藻基因组研究 | 第14页 |
| ·集胞藻蛋白质组学研究 | 第14-15页 |
| ·集胞藻转录组学研究 | 第15页 |
| ·集胞藻代谢组学研究 | 第15-16页 |
| ·本文的主要内容 | 第16页 |
| ·小结 | 第16-17页 |
| 第二章 集胞藻PCC6803 未知蛋白真实性分析 | 第17-40页 |
| ·实验材料与方法 | 第17-23页 |
| ·数据下载 | 第17-18页 |
| ·蛋白长度分布数学模型 | 第18-21页 |
| ·密码子偏性 | 第21-22页 |
| ·蛋白质组学鉴定集胞藻PCC6803 未知蛋白 | 第22-23页 |
| ·实验结果 | 第23-38页 |
| ·基因组信息整理 | 第23-24页 |
| ·蛋白长度分布拟合数学模型建立 | 第24-26页 |
| ·集胞藻PCC6803 蛋白长度伽马分布模型建立 | 第26-30页 |
| ·伽马分布模型验证 | 第30-31页 |
| ·密码子GC含量分析 | 第31-32页 |
| ·中性绘图分析 | 第32-35页 |
| ·蛋白质组学分析 | 第35-38页 |
| ·小结 | 第38-40页 |
| 第三章 集胞藻PCC6803 未知蛋白功能预测 | 第40-61页 |
| ·实验材料与方法 | 第41-46页 |
| ·基于同源性的蛋白质注释方法 | 第41-42页 |
| ·基于非同源性的蛋白功能注释方法 | 第42-45页 |
| ·基因共表达网络分析蛋白质功能 | 第45-46页 |
| ·实验结果 | 第46-60页 |
| ·基于序列同源性的预测结果 | 第46-48页 |
| ·基于非序列同源性的预测结果 | 第48-51页 |
| ·基于基因共表达网络的预测结果 | 第51-52页 |
| ·集胞藻PCC6803 未知蛋白预测结果 | 第52-60页 |
| ·小结 | 第60-61页 |
| 第四章 集胞藻PCC6803 未知蛋白功能验证初步 | 第61-71页 |
| ·实验材料与方法 | 第61-65页 |
| ·实验材料 | 第61-63页 |
| ·实验方法 | 第63-65页 |
| ·结果 | 第65-70页 |
| ·获取抗性基因片段 | 第65-67页 |
| ·获取目的基因上下游片段 | 第67-68页 |
| ·构建敲除载体 | 第68-69页 |
| ·集胞藻PCC 6803 的转化 | 第69页 |
| ·突变株的鉴定 | 第69-70页 |
| ·小结 | 第70-71页 |
| 第五章 总结与展望 | 第71-73页 |
| ·本文的工作总结 | 第71页 |
| ·工作展望 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-82页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 附录 | 第84-88页 |