| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-20页 |
| ·烟碱型乙酰胆碱受体 ( Nicotinic Acetylcholine Receptor ，nAChR ) 简介 | 第7-8页 |
| ·nAChR 结构与功能 | 第8-10页 |
| ·胞外区（ ECD ）：配体结合区域 | 第9页 |
| ·跨膜区（ TMD ）：离子通道的形成和控制区 | 第9页 |
| ·胞内区（ ICD ） | 第9页 |
| ·nAChR 的功能 | 第9-10页 |
| ·α7 - nAChR 和 AChBP 简介 | 第10-11页 |
| ·α7 - nAChR 部分激动剂的研究现状 | 第11-14页 |
| ·本文所使用到的模拟方法简介 | 第14-18页 |
| ·分子对接方法 | 第14-16页 |
| ·分子动力学 | 第16-18页 |
| ·本课题研的究的内容及意义 | 第18-20页 |
| 第二章 α7- nAChR 与配体的分子对接 | 第20-33页 |
| ·对接材料 | 第20-21页 |
| ·计算平台 | 第21-23页 |
| ·硬件平台 | 第21页 |
| ·软件平台 | 第21-23页 |
| ·分子对接的准备 | 第23-24页 |
| ·配体文件的准备 | 第23-24页 |
| ·受体文件的准备 | 第24页 |
| ·晶体结构的对接验证 | 第24-29页 |
| ·分子对接的步骤 | 第24-26页 |
| ·对接结果的筛选 | 第26-29页 |
| ·α7 - nAChR 与配体的分子对接 | 第29-31页 |
| ·分子对接的步骤 | 第29页 |
| ·对接结果的筛选 | 第29-31页 |
| ·本章小结 | 第31-33页 |
| 第三章 α7- nAChR 复合物体系的分子动力学模拟 | 第33-60页 |
| ·分子动力学模拟材料 | 第33页 |
| ·计算平台 | 第33-34页 |
| ·硬件平台 | 第33-34页 |
| ·软件平台 | 第34页 |
| ·分子动力学模拟的步骤 | 第34-42页 |
| ·结合自由能的计算 | 第42-45页 |
| ·结合自由能计算的原理 | 第42-43页 |
| ·结合自由能计算的过程 | 第43-45页 |
| ·分子动力学模拟的结果分析 | 第45-59页 |
| ·体系动力学分析 | 第45-47页 |
| ·体系的构象分析 | 第47-54页 |
| ·结合自由能的分析 | 第54-55页 |
| ·可能影响配体激动效力的因素 | 第55-59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 第四章 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第66-67页 |
| 附录 | 第67-69页 |
| 致谢 | 第69页 |