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非典型PDZ蛋白TIP-1及猪链球菌2型免疫原性蛋白HP0197的结构和功能研究

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 引言第11-24页
 第一节 PDZ 蛋白家族的简要介绍第11-15页
     ·PDZ 结构域的结构和功能特性第12页
     ·PDZ 结构域的结构研究进展第12-14页
     ·PDZ 结构域的功能研究进展第14-15页
 第二节 TIP-1 蛋白的简要介绍第15-17页
     ·TIP-1 蛋白的发现第15-16页
     ·TIP-1 蛋白的性质和功能第16-17页
 第三节 Wnt/β-catenin 信号转导通路第17-20页
     ·Wnt 信号转导通路简介第17页
     ·β-catenin 背景简介第17-20页
 第四节 内向整流钾离子通道(Inward rectifier)Kir2.3 背景简介第20-23页
     ·钾离子通道背景简介第20页
     ·内向整流钾离子通道 Kir 的背景简介第20-21页
     ·钾离子通道的定位与循环第21-23页
 第五节 研究意义第23-24页
第二章 材料和方法第24-46页
 第一节 实验材料第24-31页
     ·基因、菌株和细胞第24页
     ·质粒第24-26页
     ·药物第26页
     ·试剂、工具酶及耗材第26-27页
     ·主要仪器第27-28页
     ·主要溶液及凝胶的配制第28-31页
 第二节 实验方法第31-46页
     ·基因克隆第31-37页
     ·蛋白的表达与纯化第37-40页
     ·晶体生长实验第40-41页
     ·数据收集和结构解析第41-43页
     ·等温滴定微量(Isothermal titration calorimetry,简称 ITC)实验方法第43页
     ·细胞培养及相关实验方法第43-44页
     ·GST pull-down 实验第44页
     ·western blot 实验第44-46页
第三章 TIP-1 与β-catenin C 末端的分子识别机制第46-70页
 第一节 实验结果第46-59页
     ·分子克隆第46页
     ·TIP-1 蛋白的纯化第46-48页
     ·TIP-1 蛋白单体及其与不同配体复合物的结晶条件初筛和优化第48-50页
     ·TIP-1 蛋白单体及其与β-catenin C 末端肽复合物的结构第50-58页
     ·TIP-1 蛋白与β-catenin 相互作用研究中的 ITC 实验第58-59页
 第二节 讨论第59-68页
     ·肽结合引起的 TIP-1 蛋白的结构变化第59-62页
     ·TIP-1 蛋白识别β-catenin C 末端的分子机制第62-65页
     ·TIP-1 蛋白和β-catenin 形成了一个特殊的相互作用模式第65-68页
 第三节 结论第68-70页
第四章 TIP-1 蛋白与 Kir2.3 C 末端的结合动态调控第70-88页
 第一节 结果第70-79页
     ·分子克隆第70页
     ·TIP-1 蛋白与 Kir2.3 C 末端肽复合物的结晶条件初筛和优化第70-71页
     ·TIP-1 蛋白与 Kir2.3 C 末端肽复合物的晶体结构第71-74页
     ·TIP-1 蛋白与 Kir2.3 相互作用研究中的 ITC 实验第74-76页
     ·Kir2.3 的磷酸化实验第76-77页
     ·TIP-1 蛋白与 Kir2.3 及其两者不同突变体的 pull-down 实验第77-79页
     ·mLin-7 蛋白与 Kir2.3 蛋白的 pull-down 实验第79页
 第二节 讨论第79-87页
     ·TIP-1 蛋白与 Kir2.3 C 末端小肽复合物的晶体结构第79-82页
     ·在体外 Kir2.3 能够被 PKA 磷酸化第82-83页
     ·磷酸化和去磷酸化动态调节 TIP-1 蛋白和钾离子通道 Kir2.3 的相互作用第83-87页
 第三节 结论第87-88页
第五章 猪链球菌 2 型免疫原性蛋白 HP0197 的结构研究第88-114页
 第一节 引言第88-89页
 第二节 方法和结果第89-109页
     ·蛋白纯化第89-93页
     ·晶体生长条件的筛选和优化第93-95页
     ·数据收集和结构解析第95-109页
 第三节 讨论第109-113页
     ·HP0197-18kd 的结构特性和肝素结合功能第109-112页
     ·HP0197-G5 的晶体结构特性第112-113页
 第四节 结论第113-114页
第六章 线虫 SAD-1 激酶催化结构域的结构研究第114-119页
 第一节 引言第114页
 第二节 结果第114-117页
     ·分子克隆和蛋白纯化第114-115页
     ·SAD-1 激酶结构域蛋白的结晶和结构解析第115-117页
 第三节 讨论第117-118页
 第四节 结论第118-119页
参考文献第119-127页
致谢第127-128页
个人简历 在学期间发表的学术论文及研究成果第128-129页

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