半夏miRNA的检测及其靶基因的鉴定
摘要 | 第1-10页 |
Abstract | 第10-12页 |
缩略语 | 第12-15页 |
第一章 绪论 | 第15-36页 |
·植物 MICRORNA | 第15-21页 |
·植物 microRNA 简介 | 第15-17页 |
·动植物中 miRNA 的形成 | 第17-19页 |
·动植物中 microRNA 的区别 | 第19页 |
·miRNA 的作用方式 | 第19-20页 |
·miRNA 与 siRNA 的区别 | 第20-21页 |
·植物 MICRORNA 功能 | 第21-25页 |
·对叶发育的调控 | 第23页 |
·对花发育的调控 | 第23-24页 |
·自身负反馈调控 | 第24页 |
·激素应答调控 | 第24-25页 |
·胁迫响应 | 第25页 |
·植物 MIRNA 研究方法 | 第25-27页 |
·Northern blot | 第25-26页 |
·Real-time PCR | 第26页 |
·miRNA microarray | 第26-27页 |
·miRNA 高通量测序 | 第27页 |
·降解组测序技术 | 第27-35页 |
·降解组测序原理 | 第28-30页 |
·降解组测序的应用 | 第30-35页 |
·半夏及其 MIRNA 研究 | 第35-36页 |
第二章 实验方案设计 | 第36-38页 |
·研究内容 | 第36页 |
·目的和意义 | 第36-37页 |
·实验流程图 | 第37-38页 |
第三章 半夏 MIRNA 的芯片检测 | 第38-50页 |
·材料与试剂 | 第38页 |
·实验方法 | 第38-43页 |
·半夏 totalRNA 提取 | 第38-39页 |
·半夏 miRNA 芯片构建及检测 | 第39-43页 |
·结果与分析 | 第43-50页 |
·RNA 提取质量检测 | 第43页 |
·芯片杂交图 | 第43-44页 |
·芯片结果分析 | 第44-48页 |
·掌叶半夏和三叶半夏中差异表达的 miRNA | 第48-50页 |
第四章 MIRNA 靶基因预测和注释 | 第50-53页 |
·靶基因的预测和 GO 注释 | 第50-51页 |
·靶基因与预测 | 第50页 |
·GO 注释和富集 | 第50-51页 |
·数据结果分析 | 第51-53页 |
·靶基因预测结果分析 | 第51页 |
·GO 注释和富集结果分析 | 第51-53页 |
第五章 荧光定量 PCR 反应 | 第53-59页 |
·材料、酶、试剂以及实验仪器 | 第53页 |
·荧光定量 PCR 引物设计 | 第53-55页 |
·荧光定量 PCR 实验 | 第55-56页 |
·实验结果分析 | 第56-59页 |
·引物测试和克隆验证 | 第56-58页 |
·差异表达分析 | 第58-59页 |
第六章 降解组测序 | 第59-72页 |
·降解组测序 | 第59页 |
·降解组文库构建 | 第59-65页 |
·CLEAVELAND 软件分析 | 第65-66页 |
·路线 | 第65页 |
·输入数据 | 第65页 |
·处理 | 第65-66页 |
·实验结果和分析 | 第66-72页 |
·文库构建结果分析 | 第66-68页 |
·降解组测序结果分析 | 第68-72页 |
总结 | 第72-74页 |
参考文献 | 第74-79页 |
附录:研究生期间发表论文情况 | 第79-80页 |
致谢 | 第80页 |