| 致谢 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-25页 |
| 1. 真菌与寄主植物的共生现状 | 第11-19页 |
| ·致病菌对寄主植物的寄生现状 | 第11-15页 |
| ·镰刀菌 | 第11-13页 |
| ·尖孢镰刀菌 | 第12-13页 |
| ·串珠镰刀菌 | 第13页 |
| ·灰霉菌 | 第13-15页 |
| ·有益菌与寄主植物的共生现状 | 第15-19页 |
| ·VA(泡囊—从枝菌根)真菌 | 第15-16页 |
| ·根瘤菌 | 第16-19页 |
| ·根瘤菌概述 | 第17页 |
| ·根瘤菌-豆科植物共生过程 | 第17-18页 |
| ·根瘤菌的应用 | 第18-19页 |
| 2. 有益内生真菌的共生分子机制 | 第19-23页 |
| ·AM(丛枝菌根)真菌的共生信号途径 | 第19-21页 |
| ·根瘤菌的共生信号途径 | 第21-23页 |
| ·根瘤菌结瘤基因表达调控 | 第21-22页 |
| ·寄主植物的信号分子调控(黄酮类物质) | 第22-23页 |
| 3. 本研究的意义及展望 | 第23-25页 |
| 第二章 石斛小菇(Mycena)转录组分析 | 第25-44页 |
| 1. 材料与方法 | 第25-27页 |
| ·材料 | 第25页 |
| ·供试材料 | 第25页 |
| ·生化试剂 | 第25页 |
| ·设备 | 第25页 |
| ·方法 | 第25-27页 |
| ·石斛提取液处理石斛小菇(Mycena) | 第25-26页 |
| ·提取石斛小菇(Mycena)RNA | 第26-27页 |
| ·反转录 | 第27页 |
| ·转录组测序 | 第27页 |
| 2. 结果与分析 | 第27-42页 |
| ·转录组测序分析流程 | 第27-29页 |
| ·组装质量统计 | 第29-42页 |
| ·Contig的质量统计结果(图2.2A,2.2B) | 第29-30页 |
| ·scaffold的质量统计结果(图2.3A,2.3B) | 第30-31页 |
| ·Unigene的质量统计结果(图2.4A,2.4B,2.4C) | 第31-32页 |
| ·Unigene的基因注释 | 第32-42页 |
| ·CDS预测 | 第32页 |
| ·GO功能分析 | 第32-33页 |
| ·COG功能注释 | 第33-34页 |
| ·Unigene差异分析 | 第34-41页 |
| ·KEGG Pathway分析 | 第41-42页 |
| 讨论 | 第42-44页 |
| ·石斛小菇-金钗石斛菌根共生体系 | 第42-43页 |
| ·石斛小菇转录组测序 | 第43-44页 |
| 第三章 丝核菌-金钗石斛共生体系建立及分子机理研究 | 第44-58页 |
| 1. 材料与方法 | 第44-51页 |
| ·材料 | 第44-45页 |
| ·供试材料 | 第44-45页 |
| ·培养基及缓冲液 | 第45页 |
| ·生化试剂 | 第45页 |
| ·设备 | 第45页 |
| ·方法 | 第45-51页 |
| ·共生培养基的确定 | 第45-46页 |
| ·菌株接种方法的确立 | 第46页 |
| ·菌根石蜡切片 | 第46-48页 |
| ·分子机理定量分析 | 第48-51页 |
| ·石斛提取液处理丝核菌 | 第48页 |
| ·提取丝核菌RNA | 第48-49页 |
| ·反转录 | 第49页 |
| ·设计引物 | 第49-50页 |
| ·荧光定量PCR | 第50-51页 |
| 2. 结果与分析 | 第51-56页 |
| ·丝核菌(Rhizoctonia)的形态及ITS区段验证 | 第51-52页 |
| ·共生的形态学鉴定(组培苗) | 第52-53页 |
| ·菌根石蜡切片结果 | 第53-54页 |
| ·荧光定量PCR结果 | 第54-56页 |
| 3. 讨论 | 第56-58页 |
| 第四章 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-68页 |
| 附录 | 第68-71页 |
| 硕士期间参与科研项目及发表的文章 | 第71页 |
