| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| ·研究背景 | 第10-17页 |
| ·后基因时代的生物信息学 | 第10-12页 |
| ·国内外生物信息学的研究现状 | 第12-16页 |
| ·生物信息学研究的热点问题 | 第16-17页 |
| ·论文的主要工作与创新 | 第17-18页 |
| ·论文结构 | 第18-20页 |
| 第二章 蛋白质功能预测 | 第20-32页 |
| ·蛋白质功能预测的目的及意义 | 第20-21页 |
| ·蛋白质功能预测的研究现状 | 第21-25页 |
| ·基于序列的蛋白质功能预测 | 第21-22页 |
| ·基于相互作用的蛋白质功能预测 | 第22-23页 |
| ·基于结构域的蛋白质功能预测 | 第23-25页 |
| ·蛋白质功能预测中常用的数据集与评价方法 | 第25-29页 |
| ·蛋白质数据库 | 第26-27页 |
| ·模型检验方法 | 第27-28页 |
| ·性能评估指标 | 第28-29页 |
| ·蛋白质功能预测的困难与挑战 | 第29-30页 |
| ·本文方案 | 第30-31页 |
| ·本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 基于相互作用网络的功能预测 | 第32-47页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第32-36页 |
| ·系统生物学 | 第32-34页 |
| ·生物网络研究 | 第34-35页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第35-36页 |
| ·小世界网络概论 | 第36-38页 |
| ·小世界网络的产生 | 第36-37页 |
| ·小世界网络的特性 | 第37-38页 |
| ·基于小世界网络特征的蛋白质功能预测建模 | 第38-41页 |
| ·SWN-BA 方法的实验结果与分析 | 第41-44页 |
| ·实验材料和数据 | 第41-42页 |
| ·实验结果与分析 | 第42-44页 |
| ·结合SWN-BA 方法与GO 方法的综合预测模型 | 第44-46页 |
| ·本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 基于分组重量编码的蛋白质功能预测 | 第47-59页 |
| ·蛋白质序列的分组重量编码 | 第47-52页 |
| ·蛋白质的组成 | 第47-48页 |
| ·蛋白质的一级结构和物化性质 | 第48-50页 |
| ·蛋白质序列的分组重量编码 | 第50-52页 |
| ·最近邻居法 | 第52-54页 |
| ·基于分组重量编码的蛋白质功能预测 | 第54-58页 |
| ·基于分组重量编码的蛋白质功能预测建模 | 第54-55页 |
| ·数据集合与功能分类 | 第55页 |
| ·分组重量编码的参数选择 | 第55-56页 |
| ·实验结果与分析 | 第56-58页 |
| ·本章小结 | 第58-59页 |
| 第五章 研究工作总结与展望 | 第59-61页 |
| ·结论 | 第59-60页 |
| ·进一步研究的建议 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-63页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第63-64页 |
| 攻读硕士学位期间参加的科研工作 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |