| 中文摘要 | 第1-4页 |
| 英文摘要 | 第4-7页 |
| 第一章 前言 | 第7-21页 |
| ·作物杂种优势的研究进展 | 第7-13页 |
| ·杂种优势的定义和度量方法 | 第7页 |
| ·作物杂种优势的应用 | 第7-9页 |
| ·杂种优势的机理研究 | 第9-13页 |
| ·基因芯片技术 | 第13-15页 |
| ·基因芯片的诞生 | 第13页 |
| ·基因芯片的分类 | 第13-14页 |
| ·芯片杂交信号检测原理 | 第14页 |
| ·基因芯片应用 | 第14-15页 |
| ·生物信息学 | 第15-19页 |
| ·生物信息学起源 | 第15页 |
| ·主要研究内容 | 第15-17页 |
| ·生物信息学的发展方向 | 第17-19页 |
| ·本研究的目的 | 第19-21页 |
| 第二章 材料与方法 | 第21-24页 |
| ·供试材料 | 第21页 |
| ·实验方法 | 第21-24页 |
| ·玉米幼苗培养方法和取材方法 | 第21页 |
| ·根系形态指标数据调查 | 第21-22页 |
| ·提取和纯化mRNA的方法 | 第22页 |
| ·水稻cDNA芯片的杂交方法 | 第22页 |
| ·芯片杂交数据的获取和分析方法 | 第22-23页 |
| ·芯片杂交结果的生物信息学分析方法 | 第23页 |
| ·芯片杂交结果验证的方法 | 第23页 |
| ·RT-PCR扩增产物的克隆和测序 | 第23-24页 |
| 第三章 结果与分析 | 第24-40页 |
| ·玉米苗期根系杂种优势的形态学 | 第24-26页 |
| ·cDNA芯片杂交体系 | 第26-29页 |
| ·黄点实验 | 第26-28页 |
| ·反标记重复实验 | 第28-29页 |
| ·芯片杂交结果与分析 | 第29-32页 |
| ·差异表达基因的情况 | 第29-31页 |
| ·基因差异表达的模式 | 第31-32页 |
| ·差异表达基因的生物信息学分析 | 第32-38页 |
| ·差异表达基因的同源序列比对结果 | 第32-36页 |
| ·差异表达基因的功能分类 | 第36-38页 |
| ·重要差异表达基因的RT-PCR验证以及测序 | 第38-40页 |
| 第四章 讨论 | 第40-51页 |
| ·差异表达基因编码蛋白的功能 | 第40-45页 |
| ·V2Chip#16-F02差异表达基因 | 第40-42页 |
| ·V2Chip#23-P01差异表达基因 | 第42-43页 |
| ·V2Chip#02-G12差异表达基因 | 第43页 |
| ·编码运输蛋白的基因 | 第43-44页 |
| ·参与基因转录调控和mRNA修饰的基因 | 第44页 |
| ·其他基因 | 第44-45页 |
| ·差异表达与杂种优势 | 第45-47页 |
| ·差异表达模式与杂种优势 | 第45-46页 |
| ·基因网络调控与杂种优势 | 第46-47页 |
| ·等位基因表达模式与杂种优势 | 第47-48页 |
| ·基因芯片技术与杂种优势研究 | 第48-49页 |
| ·下一步工作思路 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-68页 |
| 附录1 玉米水培营养液配方 | 第57页 |
| 附录2 Trizol Reagent提取总RNA的protocol | 第57-58页 |
| 附录3 mRNA纯化protocol | 第58-59页 |
| 附录4 RT-PCR Protocol | 第59-60页 |
| 附录5 对RT-PCR扩增产物克隆、测序 | 第60-62页 |
| 附录6 一些差异表达基因的序列 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68页 |