| 中文摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 动物高原适应研究概述 | 第13-27页 |
| 1.1 动物高海拔适应的特征及机制 | 第13-21页 |
| 1.1.1 形态学和组织学 | 第14-16页 |
| 1.1.2 血红蛋白及血氧亲和力的低氧适应 | 第16-17页 |
| 1.1.3 代谢与氧化应激 | 第17-19页 |
| 1.1.4 母体繁殖 | 第19页 |
| 1.1.5 体温调节 | 第19-21页 |
| 1.2 动物高海拔适应的遗传学基础研究进展 | 第21-25页 |
| 1.2.1 动物高海拔适应的基因组学研究进展 | 第21-23页 |
| 1.2.2 转录组测序技术的发展简介 | 第23-24页 |
| 1.2.3 两栖爬行动物高海拔适应的转录组学研究进展 | 第24-25页 |
| 1.3 青藏高原沙蜥属蜥蜴概况 | 第25页 |
| 1.4 立项依据 | 第25-27页 |
| 第二章 基于转录组学研究海拔对青海沙蜥成体和幼体的影响 | 第27-75页 |
| 2.1 前言 | 第27-29页 |
| 2.2 实验材料 | 第29-31页 |
| 2.2.1 物种采集和组织样品准备 | 第29页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第29-30页 |
| 2.2.3 主要分析数据库 | 第30页 |
| 2.2.4 主要分析软件 | 第30-31页 |
| 2.3 实验方法 | 第31-37页 |
| 2.3.1 RNA的提取及质量分析 | 第31页 |
| 2.3.2 cDNA文库构建及转录组测序 | 第31-32页 |
| 2.3.3 分类和上机测序 | 第32页 |
| 2.3.4 测序数据分析 | 第32-34页 |
| 2.3.5 实时定量PCR验证 | 第34-36页 |
| 2.3.6 代谢酶活性及物质含量的测定 | 第36-37页 |
| 2.3.7 数据统计 | 第37页 |
| 2.4 实验结果 | 第37-71页 |
| 2.4.1 组织样品RNA提取检测结果 | 第37页 |
| 2.4.2 转录组数据的过滤、组装及注释 | 第37-40页 |
| 2.4.3 组内样品相关性分析及组间DEG的筛选 | 第40-43页 |
| 2.4.4 幼体阶段青海沙蜥种群间DEGs的功能注释分析 | 第43-53页 |
| 2.4.5 成体阶段青海沙蜥种群间DEGs的功能注释及富集分析 | 第53-60页 |
| 2.4.6 青海沙蜥种群间DEGs的基因集分析及功能注释 | 第60-66页 |
| 2.4.7 能量代谢酶活性及物质含量分析 | 第66-71页 |
| 2.5 讨论 | 第71-75页 |
| 第三章 青海沙蜥不同发育阶段的转录组学研究 | 第75-100页 |
| 3.1 前言 | 第75-77页 |
| 3.2 实验材料和方法 | 第77-78页 |
| 3.2.1 实验物种 | 第77页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第77-78页 |
| 3.3 实验结果 | 第78-98页 |
| 3.3.1 同一种群幼体和成体间DEGs筛选 | 第78-79页 |
| 3.3.2 青海沙蜥德令哈种群幼体与成体间DEGs的功能注释 | 第79-86页 |
| 3.3.3 玛多种群幼体和成体间DEGs的功能注释 | 第86-98页 |
| 3.4 讨论 | 第98-100页 |
| 3.4.1 差异表达基因的分析 | 第98页 |
| 3.4.2 发育过程中的能量代谢调控 | 第98-99页 |
| 3.4.3 发育过程中的免疫调控 | 第99-100页 |
| 第四章 基于转录组学研究青海沙蜥冬眠过程及适应机制 | 第100-129页 |
| 4.1 前言 | 第100-102页 |
| 4.2 实验材料 | 第102页 |
| 4.2.1 实验动物采集及组织获取 | 第102页 |
| 4.2.2 主要仪器和试剂 | 第102页 |
| 4.2.3 主要数据库及软件 | 第102页 |
| 4.3 实验方法 | 第102-103页 |
| 4.3.1 组织样品RNA的提取 | 第102-103页 |
| 4.3.2 cDNA文库的构建及转录组测序 | 第103页 |
| 4.3.3 转录组的数据分析 | 第103页 |
| 4.3.4 组间DEGs的筛选及功能注释分析 | 第103页 |
| 4.3.5 所有DEGs的聚类分析 | 第103页 |
| 4.4 实验结果 | 第103-126页 |
| 4.4.1 青海沙蜥冬眠转录组测序结果统计 | 第103-108页 |
| 4.4.2 青海沙蜥冬眠组间差异基因的表达情况 | 第108-110页 |
| 4.4.3 青海沙蜥冬眠期与冬眠前期DEGs功能注释分析 | 第110-117页 |
| 4.4.4 青海沙蜥冬眠觉醒期与冬眠期DEGs的功能注释分析 | 第117-122页 |
| 4.4.5 青海沙蜥冬眠三个时期DEGs的基因聚类分析 | 第122-126页 |
| 4.5 讨论 | 第126-129页 |
| 4.5.1 青海沙蜥冬眠转录组测序结果的整体分析 | 第126-127页 |
| 4.5.2 冬眠期间的代谢调控 | 第127页 |
| 4.5.3 冬眠期间免疫和抗氧化防御系统的调控 | 第127-129页 |
| 第五章 结论与展望 | 第129-132页 |
| 5.1 主要结论 | 第129-130页 |
| 5.2 创新点 | 第130-131页 |
| 5.3 展望 | 第131-132页 |
| 参考文献 | 第132-142页 |
| 在学期间的研究成果 | 第142-143页 |
| 学术交流与获奖情况 | 第143-144页 |
| 学术交流情况 | 第143页 |
| 获奖情况 | 第143-144页 |
| 参与的科研项目 | 第144-145页 |
| 致谢 | 第145页 |
