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长角血蜱唾液中的microRNA分析和它们的功能研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
英文缩略表第14-16页
CHAPTER1 REVIEW:RESEARCH PROGRESS ON TICK MICRO RNA第16-39页
    Introduction第16-17页
    1.1 Overview of tick species in China第17-22页
        1.1.1 Genus Ixodes第17-18页
        1.1.2 Genus Amblyomma第18页
        1.1.3 Genus Hyalomma第18页
        1.1.4 Genus Dermacentor第18-19页
        1.1.5 Genus Rhipicephalus第19页
        1.1.6 Genus Haemaphysalis第19-22页
    1.2 Tick saliva第22-28页
        1.2.1 Impact of Tick Saliva on Host Haemostasis第25-27页
        1.2.2 Tick saliva and pathogen transmission第27-28页
    1.3 MicroRNA第28-38页
        1.3.1 mi RNA in arthropods第30-32页
        1.3.2 mi RNA in Tick species第32-33页
        1.3.3 Ixode scapularis第33页
        1.3.4 Ixodes ricinus第33页
        1.3.5 Rhipicephalus haemaphysaloides第33-34页
        1.3.6 Rhiphicephalus microplus第34页
        1.3.7 Rhipicephalus sanguineus第34页
        1.3.8 Hyalomma anatolicum第34页
        1.3.9 Haemaphysalis longicornis第34-35页
        1.3.10 MicroRNAs as biomarkers for the diagnosis of parasitic diseases第35-36页
        1.3.11 microRNAs in the regulation of the host–parasite interactions第36-37页
        1.3.12 MicroRNAs as targets for parasite control第37-38页
    1.4 Study objectives第38-39页
CHAPTER2 A MICRORNA PROFILE OF SALIVA IN HAEMAPHYSALIS LONGICORNIS(IXODIDA:IXODIDAE)第39-50页
    2.2 Introduction第39-40页
    2.3 Methods第40-43页
        2.3.1 Tick rearing and feeding第40-41页
        2.3.2 Saliva collection第41-42页
        2.3.3 Total RNA isolation第42-43页
    2.4 Bioinformatics Pipeline第43-45页
        2.4.1 Data Filtering第43-44页
        2.4.2 sRNA Classification第44页
        2.4.3 sRNA Prediction第44页
        2.4.4 sRNA Expression第44-45页
        2.4.5 Target Prediction第45页
    2.5 Chemical Reagents preparation第45页
    2.6 Results第45-48页
        2.6.1 sRNA library from tick saliva第45-48页
    2.7 Discussion第48-49页
    2.8 Conclusions第49-50页
CHAPTER3 ROLE OF MIR-375 IN HAEMAPHYSALIS LONGICORNIS(IXODIDA:IXODIDAE)第50-63页
    3.2 Introduction第50-51页
    3.3 Methods第51-52页
        3.3.1 Sample collection at different developmental stages and tissue dissection第51页
        3.3.2 Total RNA isolation第51页
        3.3.3 Homogenization第51页
        3.3.4 Phase separation第51-52页
        3.3.5 RNA precipitation第52页
        3.3.6 RNA Washing第52页
        3.3.7 Solubilize the RNA第52页
        3.3.8 Determine the RNA yield第52页
    3.4 cDNA synthesis第52-53页
        3.4.1 Thawing第52页
        3.4.2 Preparing master mix第52-53页
        3.4.3 cDNA dilution第53页
    3.5 Real-time PCR第53-54页
        3.5.1 Reaction setup for real-time PCR第53-54页
    3.6 Feeding periods and oviposition第54页
    3.7 Antagomir synthesis and application第54页
    3.8 Cloning of Pre-miRNA第54-55页
    3.9 Gel Electrophoresis第55-57页
        3.9.1 Gel Preparation第55页
        3.9.2 PCR products loading第55-56页
        3.9.3 Purification of bands第56页
        3.9.4 Ligation into Vector第56页
        3.9.5 Transformation第56-57页
    3.10 Statistical analysis第57页
    3.11 Chemical Reagents preparation第57-58页
        3.11.1 10X PBS第57页
        3.11.2 50X TAE buffer第57页
        3.11.3 1X TAE buffer第57-58页
        3.11.4 LB Broth base第58页
        3.11.5 LB agar第58页
    3.12 Results第58-62页
        3.12.1 Pre-miR-375 amplification第58-59页
        3.12.2 Expression profile of miR-375 in various developmental stages and tissue第59页
        3.12.3 Silencing of miRNA-375 affects egg production and hatchability第59-62页
    3.13 Discussion第62页
    3.14 Conclusions第62-63页
CHAPTER4 LOCALIZED EXPRESSION AND INHIBITION EFFECT OF MIR-184 ON BLOOD DIGESTION AND OVIPOSITION IN HAEMAPHYSALIS LONGICORNIS(IXODIDA:IXODIDAE)第63-80页
    4.2 Introduction第64-65页
    4.3 Methods第65-66页
        4.3.1 Tick rearing and feeding第65页
        4.3.2 Sample collection at different growth phases and tissue dissection第65页
        4.3.3 Total RNA isolation第65页
        4.3.4 Real-Time PCR for miR-184第65-66页
    4.4 Feeding periods and oviposition第66页
    4.5 Antagomir synthesis and application第66页
    4.6 Computational prediction of miRNA targets第66-68页
        4.6.1 Real-Time PCR of predicted targets第67页
        4.6.2 Genomic DNA elimination reaction第67页
        4.6.3 Reverse-transcription reaction第67-68页
    4.7 SDS-PAGE第68-69页
        4.7.1 SDS-PAGE reagents第68页
        4.7.2 1 mol/L Tris-Cl第68-69页
        4.7.3 10% SDS第69页
        4.7.4 10X SDS-PAGE running buffer第69页
        4.7.5 1X SDS-PAGE buffer第69页
        4.7.6 2X SDS-PAGE loading buffer第69页
    4.8 Results第69-77页
        4.8.1 Expression profile of miR-184 in various developmental stages and tissues第69-70页
        4.8.2 Silencing of miRNA-184 affects oviposition第70-73页
        4.8.3 Expression analysis of Vitellogenin after inhibition of miR-184第73-75页
        4.8.4 PCR amplification of Vg-1第75-76页
        4.8.5 Expression analysis of K-10 protein after inhibition of miR-184第76-77页
        4.8.6 SDS-PAGE gel after silencing miR-184第77页
    4.9 Discussion第77-79页
    4.10 Conclusion第79-80页
CHAPTER5 CONCLUSION第80-81页
REFERENCES第81-99页
ACKNOWLEDGEMENT第99-100页
CURRICULUM VITAE第100页

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