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重组表达的Pedobacter heparinus源N-乙酰-D-葡萄糖胺C-2差向异构酶的酶学特性、异构机理及应用研究

摘要第9-12页
ABSTRACT第12-14页
缩写符号第15-18页
第一章 文献综述第18-30页
    前言第18页
    1 Gn2E与唾液酸第18-24页
        1.1 唾液酸的发现第18-19页
        1.2 唾液酸与神经系统发育第19页
        1.3 唾液酸与流感病毒第19-20页
        1.4 唾液酸与恶性肿瘤第20-21页
        1.5 唾液酸的生物合成途径第21-22页
        1.6 唾液酸类似物的合成第22-24页
    2 Gn2E与β-GlcNAc的检测第24-25页
        2.1 检测β-GlcNAc的意义第24页
        2.2 检测糖链末端β-GlcNAc的方法第24-25页
        2.3 利用Gn2E检测β-GlcNAc第25页
    3 Gn2E酶的研究现状第25-26页
    4 Pedobacter heparinus相关研究简介第26-27页
    5 本研究的目的意义及内容第27-30页
第二章 PhGn2E的克隆、表达、纯化及酶学特性测定第30-64页
    1 材料与方法第31-48页
        1.1 材料第31-33页
            1.1.1 菌种第31页
            1.1.2 主要试剂第31页
            1.1.3 培养基第31-32页
            1.1.4 主要仪器设备第32-33页
        1.2 方法第33-48页
            1.2.1 细菌基因组DNA的提取第33页
            1.2.2 重组蛋白表达载体的构建第33-39页
                1.2.2.1 PCR引物设计第33页
                1.2.2.2 PCR体系与程序第33-34页
                1.2.2.3 PCR产物回收及纯化第34页
                1.2.2.4 DNA片段与中间载体的连接第34-35页
                1.2.2.5 连接产物的转化第35-36页
                1.2.2.6 重组质粒验证及提取第36-37页
                1.2.2.7 载体酶切与连接第37-38页
                1.2.2.8 重组蛋白表达质粒的转化第38页
                1.2.2.9 重组蛋白表达质粒测序及菌种保存第38-39页
            1.2.3 原核蛋白的重组表达与纯化第39-40页
                1.2.3.1 重组蛋白表达载体的转化第39页
                1.2.3.2 重组蛋白质的体外表达第39-40页
                1.2.3.3 重组蛋白的纯化第40页
            1.2.4 重组蛋白质的SDS-PAGE电泳检测及蛋白浓度测定第40-42页
            1.2.5 重组蛋白质的MALDI-TOF-MS验证第42-43页
            1.2.6 重组表达蛋白酶活验证第43-44页
            1.2.7 重组表达蛋白的酶学特性测定第44-48页
                1.2.7.1 最适反应温度的测定第45页
                1.2.7.2 最适反应pH的测定第45页
                1.2.7.3 金属离子对酶活性的影响第45页
                1.2.7.4 变性剂和去污剂对酶活性的影响第45-46页
                1.2.7.5 酶的热稳定性测定第46页
                1.2.7.6 核苷酸对酶活性的影响第46页
                1.2.7.7 底物特异性检测第46-48页
                1.2.7.8 酶的K_m、K_(cat)、最大反应速率及酶活等酶动力学参数的测定第48页
    2 结果与分析第48-61页
        2.1 PhGn2E的PCR扩增与表达载体的构建第48-50页
        2.2 PhGn2E同源序列比对分析第50-53页
        2.3 PhGn2E的体外表达与纯化第53-54页
        2.4 重组蛋白PhGn2E的MALDI-TOF验证第54-55页
        2.5 重组蛋白PhGn2E的活性验证第55页
        2.6 重组蛋白PhGn2E的酶活参数测定第55-61页
            2.6.1 酶最适反应温度的测定第55-56页
            2.6.2 酶最适反应pH的测定第56页
            2.6.3 金属离子对酶活性的影响第56-57页
            2.6.4 变性剂及去污剂对酶活性的影响第57-58页
            2.6.5 酶的热稳定性测定第58-59页
            2.6.6 核苷酸对酶活性的影响第59页
            2.6.7 底物特异性检测第59-60页
            2.6.8 酶的K_m、最大反应速率、K_(cat)等酶动力学参数的测定第60-61页
    3 讨论第61-63页
    4 本章小结第63-64页
第三章 PhGn2E酶的催化机理研究第64-80页
    1 材料与方法第64-69页
        1.1 材料第64-65页
            1.1.1 试剂第64-65页
            1.1.2 耗材第65页
            1.1.3 菌种第65页
            1.1.4 主要仪器设备第65页
        1.2 方法第65-69页
            1.2.1 PhGn2E酶的脱盐处理第65-66页
            1.2.2 GlcNAc C-2上的H-D交换第66页
            1.2.3 GlcNAc异头碳上OH1的H-D交换第66页
            1.2.4 PhGn2E酶与端基取代的GlcNAc反应第66-67页
            1.2.5 PhGn2E的定点突变第67-68页
            1.2.6 点突变载体的转化第68页
            1.2.7 蛋白突变体的表达、纯化及SDS-PAGE第68页
            1.2.8 蛋白突变体的酶活检测第68-69页
    2 结果与分析第69-78页
        2.1 GlcNAc C-2上的氢氘交换第69-71页
        2.2 GlcNAc异头碳上OH1的氢氘交换第71-72页
        2.3 PhGn2E对端基取代的GlcNAc的异构化反应第72页
        2.4 PhGn2E酶定点突变第72-76页
        2.5 四种蛋白突变体的酶活检测分析第76-78页
    3 讨论第78-79页
    4 本章小结第79-80页
第四章 唾液酸糖苷类化合物的“一釜四酶”法合成第80-92页
    1 材料与方法第80-83页
        1.1 材料第80-81页
            1.1.1 试剂第80-81页
            1.1.2 主要仪器设备第81页
        1.2 方法第81-83页
            1.2.1 唾液酸糖苷化合物的“一釜四酶”法合成第81-83页
            1.2.2 唾液酸糖苷化合物的HPLC-MS检测第83页
    2 结果与分析第83-90页
    3 讨论第90-91页
    4 本章小结第91-92页
第五章 利用PhGn2E酶检测糖链末端的β-GlcNAc第92-102页
    1 材料与方法第92-97页
        1.1 材料第92-93页
            1.1.1 试剂第92-93页
            1.1.2 主要仪器设备第93页
        1.2 方法第93-97页
            1.2.1 端基取代的GlcNAc的合成及纯化第93-94页
            1.2.2 酶解反应的可行性分析第94-95页
            1.2.3 检测β-端基取代的GlcNAc含量第95-96页
            1.2.4 微量法定量检测GlcNAc含量第96页
            1.2.5 检测天然复杂糖链末端的β-GlcNAc含量第96-97页
    2 结果与分析第97-99页
        2.1 端基取代的GlcNAc的合成及纯化第97页
        2.2 酶解β-端基取代物的可行性验证第97-98页
        2.3 β-端基取代物的定量测定第98页
        2.4 微量法定量检测天然复杂糖链末端的β-GlcNAc第98-99页
    3 讨论第99-101页
    4 本章小结第101-102页
全文结论第102-104页
论文创新点第104-106页
未来研究展望第106-108页
参考文献第108-118页
附录第118-128页
    重要化合物谱图第118-128页
致谢第128-130页
攻读博士期间发表论文情况第130页

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