摘要 | 第6-7页 |
abstract | 第7-8页 |
英文缩略表 | 第16-17页 |
第一章 引言 | 第17-26页 |
1.1 研究爆裂相关性状的重要意义 | 第17-18页 |
1.1.1 玉米的起源与进化 | 第17页 |
1.1.2 爆裂性在起源进化和遗传育种中的作用 | 第17-18页 |
1.2 热带爆裂玉米的国内外研究进展 | 第18-21页 |
1.2.1 玉米基因组学研究进展 | 第18-19页 |
1.2.2 爆裂性状遗传分析研究进展 | 第19页 |
1.2.3 爆裂相关品质性状的研究进展 | 第19-21页 |
1.3 全基因组关联分析及其在玉米研究中的应用 | 第21-22页 |
1.3.1 全基因组关联分析 | 第21页 |
1.3.2 植物数量性状的全基因组关联分析 | 第21-22页 |
1.3.3 全基因组关联分析在玉米中的研究进展 | 第22页 |
1.4 玉米选择位点的研究 | 第22-25页 |
1.4.1 玉米选择位点研究方法 | 第22-23页 |
1.4.2 玉米受选择位点的研究进展 | 第23-25页 |
1.4.3 玉米中受选择基因的适应性研究 | 第25页 |
1.5 本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
第二章 玉米选择位点分析 | 第26-52页 |
2.1 材料与方法 | 第26-29页 |
2.1.1 试验材料 | 第26页 |
2.1.2 基因型数据的鉴定和统计分析 | 第26-28页 |
2.1.3 群体结构分析 | 第28页 |
2.1.4 选择位点分析方法 | 第28页 |
2.1.5 环境变量的获取与分析 | 第28页 |
2.1.6 连锁不平衡度和单倍型分析 | 第28页 |
2.1.7 基因注释和富集分析 | 第28-29页 |
2.2 试验结果 | 第29-43页 |
2.2.1 基因型数据的基因信息 | 第29-34页 |
2.2.2 群体结构和遗传多样性 | 第34-36页 |
2.2.3 玉米进化过程中受选择区段 | 第36-40页 |
2.2.4 环境变量的全基因组关联分析结果 | 第40-41页 |
2.2.5 受选择区间与环境适应性的关系 | 第41-43页 |
2.3 讨论 | 第43-52页 |
2.3.1 大范围的玉米材料检测选择信号 | 第43-44页 |
2.3.2 Eigen GWAS鉴定受选择位点的有效性 | 第44-49页 |
2.3.3 受选择区间在染色体上的分布 | 第49-50页 |
2.3.4 玉米环境适应性的多基因模型 | 第50页 |
2.3.5 环境适应性位点对生产上的指导意义 | 第50-52页 |
第三章 玉米自交系材料的爆裂相关性状遗传分析 | 第52-70页 |
3.1 材料与方法 | 第52-54页 |
3.1.1 试验材料 | 第52页 |
3.1.2 表型数据的鉴定和统计分析 | 第52-53页 |
3.1.3 基因型数据的鉴定和统计分析 | 第53页 |
3.1.4 全基因组关联分析 | 第53页 |
3.1.5 候选基因挖掘和验证 | 第53-54页 |
3.1.6 选择位点的分析 | 第54页 |
3.2 试验结果 | 第54-66页 |
3.2.1 基因型数据的基本信息 | 第54-55页 |
3.2.2 主成分分析 | 第55页 |
3.2.3 爆裂相关性状的分布与相关 | 第55-57页 |
3.2.4 爆裂相关性状的检测结果 | 第57-64页 |
3.2.5 显著关联位点的表型预测结果 | 第64-65页 |
3.2.6 爆裂体积检测位点的验证 | 第65页 |
3.2.7 选择信号的鉴定和比较 | 第65-66页 |
3.3 讨论 | 第66-70页 |
3.3.1 爆裂性状的遗传解析 | 第66-69页 |
3.3.2 爆裂性状的多基因控制模型 | 第69页 |
3.3.3 爆裂相关性状的选择信号 | 第69页 |
3.3.4 存在问题和展望 | 第69-70页 |
第四章 玉米热带地方品种的爆裂相关性状遗传分析 | 第70-78页 |
4.1 材料与方法 | 第70页 |
4.1.1 试验材料 | 第70页 |
4.1.2 表型数据的鉴定和统计分析 | 第70页 |
4.1.3 基因型数据的鉴定和统计分析 | 第70页 |
4.1.4 全基因组关联分析 | 第70页 |
4.2 试验结果 | 第70-76页 |
4.2.1 基因型数据的基本信息 | 第70-71页 |
4.2.2 爆裂相关性状的分布与相关 | 第71页 |
4.2.3 爆裂相关性状的关联SNP检测结果 | 第71-72页 |
4.2.4 不同模型检测结果的比较 | 第72-76页 |
4.2.5 爆裂性关联位点的选择适应性 | 第76页 |
4.3 讨论 | 第76-78页 |
4.3.1 不同材料的分析结果 | 第76-77页 |
4.3.2 不同关联分析模型检测结果的比较 | 第77页 |
4.3.3 与已有研究的比较 | 第77-78页 |
第五章 全文结论与讨论 | 第78-80页 |
5.1 玉米的选择适应性 | 第78页 |
5.2 爆裂相关性状的遗传解析 | 第78页 |
5.3 不同平台和数据的鉴定结果 | 第78-79页 |
5.4 爆裂相关性状的选择适应性 | 第79页 |
5.5 有待解决的问题 | 第79-80页 |
参考文献 | 第80-89页 |
附录 | 第89-91页 |
致谢 | 第91-92页 |
作者简历 | 第92页 |