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基于广义紧类的层级化系统演化树构造

中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 绪论第12-18页
    §1.1 研究背景第12-13页
    §1.2 系统发生学中的生物方法第13-14页
    §1.3 生物方法与数学方法的比较第14-16页
    §1.4 本文研究的思路和论文框架第16-18页
第二章 有限图中的系统演化第18-31页
    §2.1 有限图中的系统演化树第18-20页
    §2.2 有限图的层次结构第20页
    §2.3 有限图中的一些分类方法第20-29页
        §2.3.1 紧类第21-23页
        §2.3.2 严格类第23-26页
        §2.3.3 升祖类和降祖类第26-29页
    §2.4 小结第29-31页
第三章 无限图中的系统演化第31-35页
    §3.1 无限图中的层次第31-32页
    §3.2 无限图中的分类第32-34页
        §3.2.1 生日类第32-33页
        §3.2.2 无限类第33-34页
    §3.3 小结第34-35页
第四章 分类方法的应用第35-48页
    §4.1 基于广义完备紧类的分类方法第35-39页
        §4.1.1 广义紧类第36-37页
        §4.1.2 广义完备紧类第37-39页
    §4.2 广义完备紧类的搜索算法第39-43页
        §4.2.1 算法思路第40-42页
        §4.2.2 GPU并行处理第42-43页
    §4.3 加权的广义完备紧类搜索算法第43-47页
        §4.3.1 加权的祖先封闭性第43-44页
        §4.3.2 加权的连通性第44-45页
        §4.3.3 加权的广义紧类搜索算法第45-47页
    §4.4 小结第47-48页
第五章 结论与展望第48-49页
参考文献第49-51页
致谢第51-52页
学位论文评阅及答辩情况表第52页

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