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小孢子培养结合诱变处理创制大白菜突变体及其功能基因组学研究

摘要第13-15页
ABSTRACT第15-17页
前言第18-19页
第一章 文献综述第19-25页
    1.1 植物突变体研究的意义第19页
    1.2 植物突变体的创制方法第19-20页
        1.2.1 物理诱变第19-20页
        1.2.2 化学诱变第20页
        1.2.3 T-DNA插入诱变第20页
        1.2.4 RNA沉默第20页
    1.3 游离小孢子培养技术在植物诱变中的应用与优势第20-21页
    1.4 植物功能基因组学研究第21-23页
        1.4.1 基因组学第21-22页
        1.4.2 功能基因学第22页
        1.4.3 功能基因组学研究策略第22页
        1.4.4 功能基因组学研究方法第22-23页
    1.5 分子标记技术研究进展第23页
        1.5.1 分子标记的种类第23页
        1.5.2 分子标记技术在植物遗传育种中的应用第23页
    1.6 转录组测序技术及其应用第23-24页
        1.6.1 转录组学第23-24页
        1.6.2 转录组测序在植物中的应用第24页
    1.7 本研究的目的及意义第24-25页
第二章 基于游离小孢子培养和~(60)CO-γ射线诱变创制大白菜突变体第25-34页
    2.1 材料与方法第25-26页
        2.1.1 植物材料第25页
        2.1.2 诱变处理第25页
        2.1.3 游离小孢子培养第25页
        2.1.4 突变体鉴定第25-26页
        2.1.5 倍性鉴定第26页
    2.2 结果与分析第26-33页
        2.2.1 ~(60)Co-γ射线辐射对小孢子胚发生的影响第26-27页
        2.2.2 突变体筛选第27-29页
        2.2.3 突变体的特征特性第29-31页
        2.2.4 再生植株倍性鉴定第31-33页
    2.3 小结第33-34页
第三章 基于游离小孢子培养和EMS诱变创制大白菜突变体第34-44页
    3.1 材料与方法第34-35页
        3.1.1 植物材料第34页
        3.1.2 游离小孢子培养过程中的EMS诱变处理第34-35页
        3.1.3 倍性鉴定第35页
        3.1.4 突变体筛选第35页
    3.2 结果与分析第35-43页
        3.2.1 EMS对小孢子胚发生的影响第35-36页
        3.2.2 EMS对胚状体发育的影响第36-37页
        3.2.3 EMS对小孢子再生植株生根和移栽成活的影响第37-38页
        3.2.4 小孢子再生植株倍性鉴定第38-39页
        3.2.5 突变体鉴定第39-40页
        3.2.6 突变体的特征特性第40-43页
    3.3 小结第43-44页
第四章 精细定位结合转录组分析预测大白菜花瓣退化基因pdm第44-55页
    4.1 材料与方法第44-46页
        4.1.1 植物材料第44页
        4.1.2 花器官形态观察第44页
        4.1.3 遗传分析第44页
        4.1.4 Illumina测序第44-45页
        4.1.5 定位群体构建第45页
        4.1.6 DNA提取及PCR第45页
        4.1.7 SSR和Indel标记设计与开发第45页
        4.1.8 连锁分析和遗传图谱构建第45-46页
        4.1.9 候选基因预测第46页
        4.1.10 基因表达模式分析第46页
    4.2 结果与分析第46-53页
        4.2.1 突变体pdm花器官形态第46-47页
        4.2.2 突变体pdm遗传特性第47-48页
        4.2.3 花瓣退化突变基因pdm紧密连锁的分子标记开发与鉴定第48-50页
        4.2.4 花瓣退化突变基因pdm精细定位第50-51页
        4.2.5 花瓣退化突变基因pdm的候选基因预测第51-53页
    4.3 小结第53-55页
第五章 大白菜生育迟缓突变体drm生理特性及转录组分析第55-70页
    5.1 材料与方法第55-59页
        5.1.1 植物材料第55页
        5.1.2 遗传分析第55页
        5.1.3 农艺性状调查第55页
        5.1.4 叶绿素和类胡萝卜素含量测定第55-56页
        5.1.5 光合参数测定第56页
        5.1.6 荧光动力学参数测定第56页
        5.1.7 叶绿体超微结构观察第56页
        5.1.8 RNA提取第56-57页
        5.1.9 cDNA文库构建及Illumina测序第57页
        5.1.10 与参考基因组比对第57页
        5.1.11 差异表达基因鉴定及功能富集分析第57-58页
        5.1.12 SNPs确定第58页
        5.1.13 qRT-PCR分析第58-59页
    5.2 结果与分析第59-69页
        5.2.1 突变体drm形态特征第59页
        5.2.2 突变体drm遗传特性第59-60页
        5.2.3 突变体drm农艺性状第60-61页
        5.2.4 突变体drm叶绿素和类胡萝卜素含量分析第61页
        5.2.5 突变体drm光合特性分析第61-62页
        5.2.6 突变体drm荧光动力学参数分析第62页
        5.2.7 突变体drm叶绿体超微结构观察第62-63页
        5.2.8 转录组测序分析第63-64页
        5.2.9 SNPs鉴定第64-65页
        5.2.10 差异表达基因分析第65-66页
        5.2.11 与叶绿素降解和光合作用相关的差异表达基因第66页
        5.2.12 差异表达基因的GO和KEGG pathway富集分析第66-68页
        5.2.13 基因表达模式分析第68-69页
    5.3 小结第69-70页
第六章 大白菜雌性不育突变体fsm的转录组分析第70-85页
    6.1 材料与方法第70-72页
        6.1.1 植物材料第70页
        6.1.2 遗传分析第70页
        6.1.3 形态学观察第70-71页
        6.1.4 RNA提取第71页
        6.1.5 cDNA文库构建和Illumina测序第71页
        6.1.6 与参考基因组比对第71页
        6.1.7 差异基因表达评定第71页
        6.1.8 差异表达基因的功能富集分析第71页
        6.1.9 qRT-PCR分析第71-72页
    6.2 结果与分析第72-84页
        6.2.1 突变体fsm花器官形态第72页
        6.2.2 突变体fsm遗传特性第72-73页
        6.2.3 突变体fsm的雌性不育性状表现第73-74页
        6.2.4 突变体fsm花粉活力观察第74页
        6.2.5 突变体fsm的子房和胚珠发育第74-75页
        6.2.6 转录组测序分析第75-78页
        6.2.7 新转录本和SNPs鉴定第78页
        6.2.8 差异表达基因分析第78-79页
        6.2.9 与雌蕊发育相关的差异表达基因第79-80页
        6.2.10 差异表达基因GO和KEGG pathway功能富集分析第80-82页
        6.2.11 基因表达模式分析第82-84页
    6.3 小结第84-85页
讨论第85-91页
结论第91-92页
参考文献第92-104页
附录第104-110页
致谢第110-111页
攻读博士学位期间发表的学术论文第111-112页

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