运用比较基因组方法研究与猪经济性状相关的InDel
| 摘要 | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8页 |
| 缩略词表（ABBREVIATIONS） | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-21页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第10-11页 |
| 1.2 文献综述 | 第11-20页 |
| 1.2.1 猪的驯化及中外猪品种的差异 | 第11-13页 |
| 1.2.2 测序技术的发展及应用 | 第13-16页 |
| 1.2.3 畜禽基因组的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.2.4 InDel的研究进展 | 第18-20页 |
| 1.3 研究的目的与意义 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-33页 |
| 2.1 本研究的技术路线 | 第21-22页 |
| 2.2 材料 | 第22-27页 |
| 2.2.1 数据来源 | 第22-25页 |
| 2.2.2 主要数据库及分析软件 | 第25-27页 |
| 2.3 方法 | 第27-33页 |
| 2.3.1 数据的质量控制 | 第27-28页 |
| 2.3.2 序列比对 | 第28-29页 |
| 2.3.3 InDel鉴定 | 第29-32页 |
| 2.3.4 选择信号分析 | 第32页 |
| 2.3.5 基因功能分析 | 第32-33页 |
| 3 结果 | 第33-43页 |
| 3.1 品种信息 | 第33页 |
| 3.2 InDel鉴定 | 第33-34页 |
| 3.3 InDel统计分析 | 第34-36页 |
| 3.4 InDel位点注释 | 第36-38页 |
| 3.5 基因组选择信号与物种保守性分析 | 第38-40页 |
| 3.6 基因编码区的移码突变 | 第40-41页 |
| 3.7 非编码区InDel分析 | 第41-43页 |
| 4 讨论 | 第43-46页 |
| 4.1 InDel的鉴定 | 第43页 |
| 4.2 InDel的染色体分布 | 第43-44页 |
| 4.3 InDel的突变长度 | 第44-45页 |
| 4.4 InDel的注释 | 第45页 |
| 4.5 基因组选择区域和保守区的InDel | 第45-46页 |
| 5 小结 | 第46-48页 |
| 5.1 本研究的主要结论 | 第46页 |
| 5.2 本研究的创新点与特色 | 第46-47页 |
| 5.3 本研究的不足及下一步工作的建议 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
