| 致谢 | 第4-10页 |
| 摘要 | 第10-11页 |
| 1.文献综述 | 第11-18页 |
| 1.1 lncRNA简介 | 第11-15页 |
| 1.1.1 lncRNA的发现 | 第11页 |
| 1.1.2 lncRNA的结构与分类 | 第11-12页 |
| 1.1.3 lncRNA的作用机制 | 第12-13页 |
| 1.1.4 lncRNA的研究方法 | 第13-14页 |
| 1.1.5 lncRNA的功能 | 第14-15页 |
| 1.1.6 lncRNA研究问题与展望 | 第15页 |
| 1.2 新基因研究策略 | 第15-18页 |
| 1.2.1 基因克隆 | 第15-16页 |
| 1.2.1.1 生物学克隆 | 第15-16页 |
| 1.2.1.2 电子克隆 | 第16页 |
| 1.2.2 生物信息学分析 | 第16页 |
| 1.2.2.1 编码产物预测分析 | 第16页 |
| 1.2.2.2 序列同源性分析 | 第16页 |
| 1.2.2.3 染色体定位 | 第16页 |
| 1.2.2.4 基因结构分析 | 第16页 |
| 1.2.3 新基因的体内表达规律研究 | 第16-17页 |
| 1.2.4 蛋白质水平的表达分析 | 第17页 |
| 1.2.5 转基因技术 | 第17页 |
| 1.2.6 基因敲除和基因敲减 | 第17-18页 |
| 2.前言 | 第18-19页 |
| 3.鸡pouBW1基因完全开放阅读框（Open reading frame,ORF）的克隆 | 第19-26页 |
| 3.1 试验材料 | 第19页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第19页 |
| 3.1.2 主要试剂及溶液配置 | 第19页 |
| 3.2 试验方法 | 第19-21页 |
| 3.2.1 引物的设计与合成 | 第19页 |
| 3.2.2 总RNA的提取 | 第19-20页 |
| 3.2.3 普通PCR反应 和琼脂糖凝胶电泳检测 | 第20页 |
| 3.2.4 PCR产物的回收 | 第20页 |
| 3.2.5 基因的克隆与测序 | 第20-21页 |
| 3.2.5.1 连接转化 | 第20-21页 |
| 3.2.5.2 菌液PCR鉴定 | 第21页 |
| 3.2.5.3 菌液测序 | 第21页 |
| 3.2.6 长链非编码RNA鉴定 | 第21页 |
| 3.3 主要仪器设备 | 第21-22页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第22-24页 |
| 3.4.1 总RNA提取 | 第22页 |
| 3.4.2 菌液PCR检测 | 第22-23页 |
| 3.4.3 完全开放阅读框（ORF）克隆 | 第23页 |
| 3.4.4 生物信息学分析 | 第23-24页 |
| 3.5 讨论与小结 | 第24-26页 |
| 4.鸡pouBW1基因的表达分析 | 第26-32页 |
| 4.1 试验材料 | 第26页 |
| 4.1.1 试验动物 | 第26页 |
| 4.1.2 样品的采集 | 第26页 |
| 4.1.3 试剂及溶液配制 | 第26页 |
| 4.1.4 荧光定量试验仪器 | 第26页 |
| 4.2 试验方法 | 第26-27页 |
| 4.2.1 总RNA提取和反转录 | 第26页 |
| 4.2.2 荧光定量PCR引物设计 | 第26页 |
| 4.2.3 实时荧光定量PCR(qPCR) | 第26-27页 |
| 4.2.4 数据处理 | 第27页 |
| 4.3 结果与分析 | 第27-31页 |
| 4.3.1 cDNA质量及引物特异性检测 | 第27-28页 |
| 4.3.2 1日龄表达谱分析 | 第28页 |
| 4.3.3 6周龄表达谱分析 | 第28-29页 |
| 4.3.4 16周龄表达谱分析 | 第29-30页 |
| 4.3.5 不同发育阶段的表达谱分析 | 第30-31页 |
| 4.4 讨论与小结 | 第31-32页 |
| 5.固始鸡-安卡鸡F2代资源群pouBW1基因多态性分析 | 第32-53页 |
| 5.1 试验材料 | 第32-33页 |
| 5.1.1 试验动物 | 第32页 |
| 5.1.1.1 资源群体 | 第32页 |
| 5.1.1.2 饲养管理及测量指标 | 第32页 |
| 5.1.2 试验主要试剂及配制 | 第32-33页 |
| 5.1.3 主要仪器设备 | 第33页 |
| 5.2 试验方法 | 第33-37页 |
| 5.2.1 基因组DNA的提取方法 | 第33-34页 |
| 5.2.2 SNP筛选 | 第34-35页 |
| 5.2.2.1 混池构建 | 第34页 |
| 5.2.2.2 引物设计、PCR扩增和SNP扫描 | 第34-35页 |
| 5.2.3 最适PCR反应体系的确立 | 第35-36页 |
| 5.2.4 酶切分型 | 第36页 |
| 5.2.5 基因型统计与分析 | 第36-37页 |
| 5.2.5.1 基因型频率与基因频率的统计 | 第36页 |
| 5.2.5.2 群体遗传多态性的分析 | 第36-37页 |
| 5.2.5.3 突变位点基因型与经济性状的关联分析模型 | 第37页 |
| 5.2.6 连锁不平衡分析 | 第37页 |
| 5.3 结果与分析 | 第37-51页 |
| 5.3.1 SNP突变位点扫描 | 第37-38页 |
| 5.3.2 pouBW1基因SNP位点基因型频率及基因频率统计 | 第38-39页 |
| 5.3.3 pouBW1基因n.830G>A位点不同基因型与不同性状的关联分析 | 第39-44页 |
| 5.3.3.1 pouBW1基因n.830G>A位点不同基因型与肉质性状的关联分析 | 第39-40页 |
| 5.3.3.2 pouBW1基因n.830G>A位点不同基因型与生长性状的关联分析 | 第40-41页 |
| 5.3.3.3 pouBW1基因n.830G>A位点不同基因型与屠体性状的关联分析 | 第41-42页 |
| 5.3.3.4 pouBW1基因n.830G>A位点不同基因型与肌纤维性状的关联分析 | 第42-43页 |
| 5.3.3.5 pouBW1基因n.830G>A位点不同基因型与血液参数性状的关联分析 | 第43-44页 |
| 5.3.4 pou BW1基因n.830G>A位点加性显性效应分析 | 第44-45页 |
| 5.3.5 pou BW1基因n.594 C>T位点不同基因型与不同性状的关联分析 | 第45-50页 |
| 5.3.5.1 pouBW1基因n.594C>T位点不同基因型与肉质性状的关联分析 | 第45-46页 |
| 5.3.5.2 pouBW1基因n.594C>T位点不同基因型与生长性状的关联分析 | 第46-47页 |
| 5.3.5.3 pouBW1基因n.594C>T位点不同基因型与屠体性状的关联分析 | 第47-48页 |
| 5.3.5.4 pouBW1基因n.594C>T位点不同基因型与肌纤维性状的关联分析 | 第48-49页 |
| 5.3.5.5 pouBW1基因n.594C>T位点不同基因型与血液参数性状的关联分析 | 第49-50页 |
| 5.3.6 pou BW1基因n.594C>T位点加性显性效应分析 | 第50页 |
| 5.3.7 单倍型构建 | 第50-51页 |
| 5.3.8 两个SNP位点的单倍型组合与F2代资源群经济性状的关联分析 | 第51页 |
| 5.4 小结与讨论 | 第51-53页 |
| 6. 全文总结 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| ABSTRACT | 第58页 |
