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选择性剪接事件调控机制及其功能预测的研究

摘要第5-7页
abstract第7-8页
第1章 绪论第12-32页
    1.1 选择性剪接事件的研究现状第13-28页
        1.1.1 选择性剪接分子生物学过程的研究现状第13-21页
        1.1.2 选择性剪接和其它生物学过程关系的研究现状第21-24页
        1.1.3 选择性剪接和疾病的研究现状第24页
        1.1.4 选择性剪接调控规则和调控蛋白的研究现状第24-28页
    1.2 选择性剪接和疾病关系的研究目的和意义第28-30页
        1.2.1 顺式调控因子与疾病的关系第28-29页
        1.2.2 反式作用因子与疾病的关系第29-30页
    1.3 本章小结和论文写作安排第30-32页
第2章 RBP对选择性剪接调控的研究第32-54页
    2.1 引言第32页
        2.1.1 主要工作和创新点第32页
    2.2 RBP调控选择性剪接事件的相关工作第32-39页
        2.2.1 研究RBP调控选择性剪接事件的相关技术第33-35页
        2.2.2 研究RBP调控选择性剪接事件使用的相关算法第35-39页
    2.3 数据集的选择和数据预处理第39-41页
    2.4 研究方法、结果、验证以及讨论第41-53页
        2.4.1 研究方法和结果第41-50页
        2.4.2 实验验证第50-51页
        2.4.3 讨论第51-53页
    2.5 本章小结第53-54页
第3章 选择性剪接对蛋白质功能影响的研究第54-72页
    3.1 引言第54-55页
        3.1.1 主要工作和创新点第54-55页
    3.2 选择性剪接事件和疾病关系的相关工作第55页
    3.3 数据集的选取第55-57页
    3.4 研究方法、结果、验证及分析第57-70页
        3.4.1 研究方法和结果第57-63页
        3.4.2 使用机器学习预测外显子功能第63-65页
        3.4.3 实验验证第65-70页
    3.5 本章小结第70-72页
第4章 使用机器学习方法研究同义突变对疾病的影响第72-86页
    4.1 引言第72-73页
        4.1.1 主要工作和创新点第73页
    4.2 同义突变对疾病影响的相关工作第73-74页
    4.3 特征提取第74-80页
        4.3.1 基因组特征的选取第74-76页
        4.3.2 蛋白质相关特征的选取第76-78页
        4.3.3 几种常用的分类器的比较第78-80页
    4.4 研究方法、结果、分析以及验证第80-84页
        4.4.1 序列相关特征的分析第80-81页
        4.4.2 蛋白质相关特征的分析第81-82页
        4.4.3 机器学习模型的验证以及分析第82-84页
    4.5 本章小结第84-86页
第5章 脂多糖诱导的BMSC细胞中选择性剪接事件的差异表达第86-98页
    5.1 引言第86页
        5.1.1 主要工作和创新点第86页
    5.2 脂多糖诱导的选择性剪接事件差异表达的相关工作第86-91页
        5.2.1 RNA-seq技术及其分析方法第87-91页
    5.3 研究步骤和生物信息学分析流程第91-94页
        5.3.1 研究步骤第91-92页
        5.3.2 生物信息学分析流程第92-94页
    5.4 实验结果及分析第94-97页
        5.4.1 LPS诱导的选择性剪接事件第94-96页
        5.4.2 LPS诱导的选择性剪接事件的蛋白质作用域第96-97页
    5.5 本章小结第97-98页
结论第98-100页
参考文献第100-112页
攻读博士学位期间发表的论文和取得的科研成果第112-114页
致谢第114-115页
附录A:模式生物的基因信息和选择性剪接信息表第115-119页
附录B:本章涉及的分子生物学技术相关词汇及其解释第119页

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