| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第1章 绪论 | 第13-33页 |
| 1.1 课题研究的背景和意义 | 第13-22页 |
| 1.1.1 非编码RNA | 第13-16页 |
| 1.1.2 RNA二级结构预测的背景和意义 | 第16-20页 |
| 1.1.3 分子信标检测结构化RNA的背景和意义 | 第20-22页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第22-29页 |
| 1.2.1 RNA二级结构预测的国内外研究现状 | 第22-26页 |
| 1.2.2 RNA检测的国内外研究现状 | 第26-29页 |
| 1.3 课题研究的主要内容 | 第29-30页 |
| 1.4 本文组织与结构 | 第30-33页 |
| 第2章 基于反向互补折叠方法预测小非编码RNA二级结构 | 第33-56页 |
| 2.1 引言 | 第33-37页 |
| 2.2 基于反向互补折叠的预测算法 | 第37-46页 |
| 2.2.1 建立配对数矩阵 | 第37-39页 |
| 2.2.2 建立路径矩阵 | 第39-40页 |
| 2.2.3 预测小分子RNA的次级结构 | 第40-43页 |
| 2.2.4 选择合理的小分子RNA的二级结构 | 第43-44页 |
| 2.2.5 预测RNA二级结构的最优结构 | 第44-46页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第46-55页 |
| 2.3.1 分析标准 | 第47页 |
| 2.3.2 预测pre-microRNA实验 | 第47-51页 |
| 2.3.3 预测小分子RNA实验 | 第51-55页 |
| 2.4 本章小结 | 第55-56页 |
| 第3章 基于替换茎区的方法预测非编码RNA二级结构 | 第56-70页 |
| 3.1 引言 | 第56-58页 |
| 3.2 替换茎区方法的预测算法 | 第58-61页 |
| 3.2.1 建立茎区池 | 第58页 |
| 3.2.2 构建RNA二级结构 | 第58-59页 |
| 3.2.3 重新选择茎区 | 第59-60页 |
| 3.2.4 预测RNA的最优二级结构 | 第60-61页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第61-69页 |
| 3.3.1 实验流程 | 第62-64页 |
| 3.3.2 实验数据选取 | 第64-65页 |
| 3.3.3 实验结果 | 第65页 |
| 3.3.4 实验分析 | 第65-69页 |
| 3.4 本章小结 | 第69-70页 |
| 第4章 高度结构化RNA分子的制作 | 第70-87页 |
| 4.1 引言 | 第70-73页 |
| 4.2 制作模板DNA | 第73-79页 |
| 4.2.1 DNA引物设计 | 第73页 |
| 4.2.2 引物延伸 | 第73-74页 |
| 4.2.3 DNA溶液的提纯 | 第74-77页 |
| 4.2.4 电气泳动（NATIVE 8% PAGE）方法确认得到的模板DNA | 第77-79页 |
| 4.3 制作RNA | 第79-85页 |
| 4.3.1 使用模板DNA转录RNA | 第79-80页 |
| 4.3.2 电气泳动（NATIVE 8% PAGE）方法确认得到的RNA | 第80-82页 |
| 4.3.3 RNA的切出提纯 | 第82-84页 |
| 4.3.4 电气泳动（NATIVE 8% PAGE）方法确认提纯的RNA | 第84-85页 |
| 4.4 本章小结 | 第85-87页 |
| 第5章 高度结构化小非编码RNA的检测 | 第87-101页 |
| 5.1 引言 | 第87-88页 |
| 5.2 人类tRNALys3的分子信标设计与结构预测 | 第88-91页 |
| 5.3 实验与结果分析 | 第91-99页 |
| 5.3.1 分子信标与人类tRNALys3分子结合实验与结果分析 | 第91-95页 |
| 5.3.2 分子信标与短序列靶RNA结合实验与结果分析 | 第95-99页 |
| 5.4 MB与人类t RNALys3分子结合的难易度分析 | 第99-100页 |
| 5.5 本章小结 | 第100-101页 |
| 结论 | 第101-103页 |
| 参考文献 | 第103-115页 |
| 附件 | 第115-125页 |
| 攻读学位期间发表的论文和取得的科研成果 | 第125-127页 |
| 致谢 | 第127页 |
