| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-26页 |
| 1.1 引言 | 第18页 |
| 1.2 国内外研究现状分析综述 | 第18-24页 |
| 1.2.1 堆肥与堆肥化 | 第18-19页 |
| 1.2.2 影响堆肥进程及微生物的主要因素 | 第19-20页 |
| 1.2.2.1 温度 | 第19页 |
| 1.2.2.2 pH | 第19页 |
| 1.2.2.3 含水率 | 第19页 |
| 1.2.2.4 通风供氧（通风量） | 第19-20页 |
| 1.2.2.5 碳氮比（C/N） | 第20页 |
| 1.2.3 堆肥化过程中细菌和真菌 | 第20-21页 |
| 1.2.4 氮循环中的反硝化细菌 | 第21页 |
| 1.2.5 氨氧化菌的多样性和功能研究 | 第21-22页 |
| 1.2.6 氨氧化菌群的主要影响因素 | 第22-24页 |
| 1.2.6.1 温度 | 第22-23页 |
| 1.2.6.2 pH | 第23页 |
| 1.2.6.3 铵浓度 | 第23页 |
| 1.2.6.4 盐度 | 第23页 |
| 1.2.6.5 氧气 | 第23-24页 |
| 1.2.7 堆肥化过程中氨氧化菌的多样性及功能研究进展 | 第24页 |
| 1.3 研究意义 | 第24-26页 |
| 第二章 通风量对牛粪堆肥化过程中细菌和真菌群落的影响 | 第26-62页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-32页 |
| 2.1.1 堆肥试验材料与处理 | 第26-27页 |
| 2.1.2 堆肥理化参数的测定 | 第27-28页 |
| 2.1.3 总DNA的提取 | 第28页 |
| 2.1.4 细菌 16S V4区rRNA和真菌 18S V4区rRNA基因PCR扩增 | 第28-30页 |
| 2.1.5 高通量测序 | 第30-31页 |
| 2.1.6 微生物多样性分析 | 第31-32页 |
| 2.1.7 统计分析 | 第32页 |
| 2.2 结果 | 第32-59页 |
| 2.2.1 堆肥过程中理化参数的变化 | 第32-41页 |
| 2.2.1.1 堆体温度与环境温度 | 第32-33页 |
| 2.2.1.2 堆体O2含量 | 第33-34页 |
| 2.2.1.3 堆体pH与含水率 | 第34-36页 |
| 2.2.1.4 铵态氮与硝态氮含量 | 第36-38页 |
| 2.2.1.5 堆体氨气释放速率 | 第38-39页 |
| 2.2.1.6 总氮含量 | 第39-40页 |
| 2.2.1.7 总有机碳含量 | 第40-41页 |
| 2.2.2 不同通风处理堆肥样品总DNA提取和PCR扩增 | 第41-42页 |
| 2.2.3 高通量测序序列数据统计 | 第42-45页 |
| 2.2.4 堆肥样品中细菌和真菌群落组成分析 | 第45-49页 |
| 2.2.5 不同通风处理堆肥样品中细菌和真菌的聚类分析 | 第49-54页 |
| 2.2.6 堆肥过程中环境因子与细菌和真菌多样性的相关性分析 | 第54-59页 |
| 2.3 讨论 | 第59-62页 |
| 第三章 通风量对牛粪堆肥化过程中AOA和AOB群落及amoA基因数量的影响 | 第62-88页 |
| 3.1 材料与方法 | 第62-67页 |
| 3.1.1 堆肥试验材料与处理 | 第62页 |
| 3.1.2 堆肥理化参数的测定 | 第62-63页 |
| 3.1.3 总DNA的提取 | 第63页 |
| 3.1.4 功能基因AOA amoA基因和AOB amoA基因PCR扩增 | 第63-65页 |
| 3.1.5 高通量测序 | 第65页 |
| 3.1.6 微生物多样性分析 | 第65-66页 |
| 3.1.7 实时荧光定量PCR | 第66页 |
| 3.1.8 统计分析 | 第66-67页 |
| 3.2 结果 | 第67-85页 |
| 3.2.1 堆肥过程中理化参数的变化 | 第67-68页 |
| 3.2.1.8 氨氧化潜势（PAOR） | 第67页 |
| 3.2.1.9 不同堆肥处理氮素的损失 | 第67-68页 |
| 3.2.2 堆肥样品总DNA提取、PCR扩增 | 第68-69页 |
| 3.2.3 高通量测序序列数据统计 | 第69-73页 |
| 3.2.4 堆肥样品中氨氧化菌群落组成分析 | 第73-74页 |
| 3.2.5 堆肥样品中氨氧化菌群落Alpha多样性分析 | 第74-75页 |
| 3.2.6 不同通风量处理的堆肥过程中环境因子与AOA和AOB多样性的相关性分析 | 第75-79页 |
| 3.2.7 堆肥样品中AOA和AOB amoA基因数量的变化 | 第79-84页 |
| 3.2.8 堆肥化过程中amoA基因数量与环境因子的冗余分析（RDA） | 第84-85页 |
| 3.3 讨论 | 第85-88页 |
| 第四章 通风量对牛粪堆肥化过程中反硝化细菌多样性及nirK基因丰度的影响 | 第88-98页 |
| 4.1 材料与方法 | 第88-90页 |
| 4.1.1 堆肥试验材料与处理 | 第88页 |
| 4.1.2 堆肥理化参数的测定 | 第88页 |
| 4.1.3 克隆文库构建 | 第88-89页 |
| 4.1.3.1 总DNA的提取 | 第88-89页 |
| 4.1.3.2 细菌nirK基因扩增 | 第89页 |
| 4.1.3.3 nirK基因克隆文库的构建 | 第89页 |
| 4.1.3.4 核苷酸序列接受号 | 第89页 |
| 4.1.4 实时荧光定量PCR | 第89页 |
| 4.1.5 数据处理 | 第89-90页 |
| 4.2 结果 | 第90-95页 |
| 4.2.1 堆肥过程中理化参数的变化及氮素损失 | 第90页 |
| 4.2.2 通风处理对于堆体中对nirK基因多样性的影响 | 第90-91页 |
| 4.2.3 通风处理对于堆体中对nirK基因丰度的影响 | 第91-94页 |
| 4.2.4 通风处理对堆肥化过程中nirK基因丰度与环境因子之间的冗余分析 | 第94-95页 |
| 4.3 讨论 | 第95-98页 |
| 第五章 变通风处理对牛粪堆肥化过程中理化性质和amoA基因数量的影响 | 第98-116页 |
| 5.1 材料与方法 | 第98-99页 |
| 5.1.1 堆肥试验材料与处理 | 第98页 |
| 5.1.2 测定指标与方法 | 第98-99页 |
| 5.1.3 实时荧光定量PCR | 第99页 |
| 5.1.4 数据处理 | 第99页 |
| 5.2 结果 | 第99-113页 |
| 5.2.1 堆肥过程中理化参数的变化 | 第99-106页 |
| 5.2.1.1 堆体温度、氧气、pH和含水率 | 第99-101页 |
| 5.2.1.2 堆体铵态氮和硝态氮 | 第101-103页 |
| 5.2.1.3 堆体总氮和氨气释放速率 | 第103-104页 |
| 5.2.1.4 堆体总有机碳（TOC） | 第104-105页 |
| 5.2.1.5 堆体氨氧化潜势（PAOR） | 第105-106页 |
| 5.2.1.6 堆肥过程的氮素损失 | 第106页 |
| 5.2.2 变量通风对牛粪堆肥过程中氨氧化细菌和氨氧化古菌amoA数量的影响 | 第106-112页 |
| 5.2.3 变通风量处理时环境因子与AOB和AOA菌群数量的相关性分析 | 第112-113页 |
| 5.3 讨论 | 第113-116页 |
| 第六章 全文结论 | 第116-117页 |
| 参考文献 | 第117-127页 |
| 致谢 | 第127-128页 |
| 个人简历 | 第128-129页 |
