摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
目录 | 第5-7页 |
第一章 绪论 | 第7-18页 |
1.1 生物信息学简述 | 第7-10页 |
1.1.1 生物信息学的研究背景 | 第7-8页 |
1.1.2 生物信息学研究的对象和目标 | 第8-9页 |
1.1.3 生物信息学的研究现状及其发展趋势 | 第9-10页 |
1.1.4 生物信息学的应用前景展望及意义 | 第10页 |
1.2 甲型流感病毒的蛋白质序列及空间结构 | 第10-16页 |
1.2.1 蛋白质序列与空间结构及其研究方法 | 第10-12页 |
1.2.2 甲型流感病毒的蛋白质序列结构研究及其意义 | 第12-15页 |
1.2.3 流感病毒蛋白质在国内外的研究现状和发展趋势 | 第15-16页 |
1.3 本论文的主要研究内容 | 第16-18页 |
第二章 甲型流感病毒蛋白质序列的分析与预测 | 第18-25页 |
2.1 引言 | 第18-19页 |
2.2 蛋白质序列基于详细的 HP 模型数据化构建 CGR-Walk 模型 | 第19-20页 |
2.2.1 选取蛋白质序列 | 第19页 |
2.2.2 蛋白质序列基于详细的 HP 模型数据化并建立 CGR-Walk 模型 | 第19-20页 |
2.3 建立 ARFIMA 模型 | 第20页 |
2.4 结果与分析 | 第20-24页 |
2.4.1 甲型流感病毒蛋白质序列数据集构造 | 第20页 |
2.4.2 甲型 H1N1 流感病毒蛋白质数据集特征分析 | 第20-24页 |
2.5 本章小结 | 第24-25页 |
第三章 甲型 H1N1 流感病毒蛋白质空间结构预测 | 第25-31页 |
3.1 引言 | 第25页 |
3.2 理论方法 | 第25-27页 |
3.2.1 基于蛋白质空间结构的 3DHP 模型 | 第25-26页 |
3.2.2 能量函数 | 第26-27页 |
3.2.3 优化的遗传算法 | 第27页 |
3.3 甲型 H1N1 流感病毒的蛋白质空间结构 | 第27-30页 |
3.3.1 预测蛋白质空间结构 | 第27-28页 |
3.3.2 预测甲型 H1N1 流感病毒蛋白质空间结构 | 第28页 |
3.3.3 构建距离矩阵 | 第28页 |
3.3.4 相关性分析 | 第28-30页 |
3.4 本章小结 | 第30-31页 |
第四章 甲型 H1N1 流感病毒 HNXP 蛋白质空间结构预测 | 第31-37页 |
4.1 引言 | 第31页 |
4.2 理论方法 | 第31-33页 |
4.2.1 计算方法 | 第31-32页 |
4.2.2 稀疏典型相关性分析 | 第32-33页 |
4.3 结果与讨论 | 第33-36页 |
4.3.1 氨基酸紧密接触对的相互作用能 | 第33页 |
4.3.2 HNXP 三维空间格点模型 | 第33-34页 |
4.3.3 甲型 H1N1 流感病毒三维空间结构分析 | 第34-36页 |
4.4 本章小结 | 第36-37页 |
第五章 总结与展望 | 第37-39页 |
5.1 总结 | 第37页 |
5.2 展望 | 第37-39页 |
致谢 | 第39-40页 |
参考文献 | 第40-44页 |
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第44页 |