| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 引言 | 第12-19页 |
| 1.1. OsHV-1 的研究现状 | 第12-15页 |
| 1.1.1. OsHV-1 的发现和发展 | 第12-13页 |
| 1.1.2. OsHV-1 变异株的发现和发展 | 第13-14页 |
| 1.1.3. OsHV-1 主要变异株的流行病学特点 | 第14-15页 |
| 1.1.4. 环境因素对病毒感染的影响 | 第15页 |
| 1.2. 序列保守区在分子检测中的应用 | 第15-17页 |
| 1.2.1 疱疹病毒DNA聚合酶基因在分子检测中的应用 | 第16页 |
| 1.2.2 疱疹病毒末端酶基因在分子检测中的应用 | 第16-17页 |
| 1.3. OsHV-1 分子水平的研究 | 第17-18页 |
| 1.3.1 OsHV-1 及主要变异株全基因组的测序 | 第17页 |
| 1.3.2 基于OsHV-1 基因组C区变化的主要变异株 | 第17页 |
| 1.3.3 微卫星序列在病毒株系分化研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.4. 研究意义 | 第18-19页 |
| 第二章 基于牡蛎疱疹病毒DNA聚合酶基因的巢式PCR检测方法的建立及应用 | 第19-33页 |
| 2.1. 实验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1. 贝类病料 | 第20页 |
| 2.1.2. 主要试剂 | 第20-21页 |
| 2.2. 实验方法 | 第21-25页 |
| 2.2.1. 引物设计 | 第21页 |
| 2.2.2. 组织DNA的提取 | 第21-22页 |
| 2.2.3. 胶回收及质粒标准品的制备 | 第22-23页 |
| 2.2.4. P-nPCR反应条件及程序的优化 | 第23-24页 |
| 2.2.5. P-nPCR灵敏度实验 | 第24页 |
| 2.2.6. P-nPCR特异性实验 | 第24页 |
| 2.2.7. 两种巢式PCR检测方法对牡蛎疱疹病毒检测结果的比较 | 第24-25页 |
| 2.3. 实验结果 | 第25-30页 |
| 2.3.1. P-nPCR反应体系及扩增程序的优化 | 第25页 |
| 2.3.2. P-nPCR灵敏度的测定 | 第25-26页 |
| 2.3.3. P-nPCR特异性的测定 | 第26-27页 |
| 2.3.4. P-nPCR与C-n PCR检测结果比较 | 第27-30页 |
| 2.4. 讨论 | 第30-33页 |
| 第三章 我国部分OsHV-1 变异株基因分型及系统发育关系的建立 | 第33-53页 |
| 3.1. 材料和方法 | 第34-37页 |
| 3.1.1. 贝类病料 | 第34-35页 |
| 3.1.2. 引物 | 第35页 |
| 3.1.3. DNA提取 | 第35-36页 |
| 3.1.4. 反应程序及条件的优化 | 第36页 |
| 3.1.5. PCR扩增及产物的处理 | 第36-37页 |
| 3.1.6. 数据分析 | 第37页 |
| 3.2. 结果 | 第37-50页 |
| 3.2.1. 所提核算浓度的测定 | 第37-38页 |
| 3.2.2. 对引物反应程序的优化 | 第38页 |
| 3.2.3. 样品PCR检测和测序结果 | 第38-42页 |
| 3.2.4. C2/C6区序列分析 | 第42-43页 |
| 3.2.5. Del36-37F2/ Del36-37R、IA1/IA2、NC1/NC2区序列分析 | 第43-46页 |
| 3.2.6. C2/C6区系统进化分析 | 第46-50页 |
| 3.2.7. NC1/NC2区系统进化分析 | 第50页 |
| 3.3. 讨论 | 第50-53页 |
| 第四章 我国部分地区双壳贝类感染三种寄生虫情况调查 | 第53-63页 |
| 4.1. 材料和方法 | 第53-57页 |
| 4.1.1. 贝类样品 | 第53-54页 |
| 4.1.2. 主要试剂 | 第54页 |
| 4.1.3. 主要仪器 | 第54页 |
| 4.1.4. 实验方法 | 第54页 |
| 4.1.5. 引物合成 | 第54-55页 |
| 4.1.6. 待测样品DNA的提取 | 第55-56页 |
| 4.1.7. 样品PCR检测 | 第56-57页 |
| 4.1.8. 结果的汇总和分析 | 第57页 |
| 4.2. 实验结果 | 第57-61页 |
| 4.2.1. 样品核酸浓度检测结果 | 第57页 |
| 4.2.2. 样品检测结果及分析 | 第57-61页 |
| 4.3. 讨论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
